登録情報 | データベース: PDB / ID: 4bxe |
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF AMPDH3 FROM PSEUDOMONAS AERUGINOSA IN COMPLEX WITH ANHYDROMURAMIC PENTAPEPTIDE |
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要素 | - AMPDH3
- ANHYDROMURAMIC PEPTIDE
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キーワード | HYDROLASE/PEPTIDE / HYDROLASE-PEPTIDE COMPLEX |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / Gram-negative-bacterium-type cell wall / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity / peptidoglycan turnover / outer membrane / peptidoglycan catabolic process / cell wall organization / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Muramoyl-pentapeptide Carboxypeptidase; domain 1 / PGBD-like superfamily/PGBD / : / PGBD superfamily / Lysozyme-like / Peptidoglycan recognition protein-like / Ami_2 / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase/PGRP domain superfamily ...Muramoyl-pentapeptide Carboxypeptidase; domain 1 / PGBD-like superfamily/PGBD / : / PGBD superfamily / Lysozyme-like / Peptidoglycan recognition protein-like / Ami_2 / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase/PGRP domain superfamily / PGBD-like superfamily / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ACETATE ION / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | PSEUDOMONAS AERUGINOSA PAO1 (緑膿菌) SYNTHETIC CONSTRUCT (人工物) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.95 Å |
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データ登録者 | Artola-Recolons, C. / Hermoso, J.A. |
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引用 | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2013 タイトル: Cell-Wall Remodeling by the Zinc-Protease Ampdh3 from Pseudomonas Aeruginosa. 著者: Lee, M. / Artola-Recolons, C. / Carrasco-Lopez, C. / Martinez-Caballero, S. / Hesek, D. / Spink, E. / Lastochkin, E. / Zhang, W. / Hellman, L.M. / Boggess, B. / Hermoso, J.A. / Mobashery, S. |
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履歴 | 登録 | 2013年7月10日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2013年10月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年10月16日 | Group: Atomic model / Structure summary |
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改定 2.0 | 2023年11月15日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Other カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom ...atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_validate_torsion / struct_conn / struct_site Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 2.1 | 2024年5月1日 | Group: Refinement description / カテゴリ: pdbx_initial_refinement_model |
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