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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4bf8 | ||||||
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タイトル | Fpr4 PPI domain | ||||||
![]() | FPR4 | ||||||
![]() | ISOMERASE / PROLINE ISOMERIZATION / FKBP / HISTONE CHAPERONE | ||||||
機能・相同性 | ![]() : / : / macrolide binding / peptidylprolyl isomerase / peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity / nucleosome assembly / nucleolus / nucleus 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / ARIA1.2 | ||||||
![]() | Monneau, Y. / Mackereth, C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure and Activity of the Peptidyl-Prolyl Isomerase Domain from the Histone Chaperone Fpr4 Towards Histone H3 Proline Isomerization 著者: Monneau, Y.R. / Soufari, H. / Nelson, C.J. / Mackereth, C.D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 470.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 398.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 535.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 703.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 37.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 53.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12502.853 Da / 分子数: 1 断片: PEPTIDYL PROLINE ISOMERASE (PPI) DOMAIN, RESIDUES 280-392 由来タイプ: 組換発現 詳細: C-TERMINAL PEPTIDYL PROLYL CIS-TRANS ISOMERASE DOMAIN FROM YEAST FPR4P 由来: (組換発現) ![]() ![]() プラスミド: MODIFIED PET-9D / 発現宿主: ![]() ![]() |
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配列の詳細 | CONTAINS N-TERMINAL GLY-ALA-MET-ALA- RESIDUES FOLLOWING CLEAVAGE OF THE HIS6-TAG BY TEV PROTEAS |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: STRUCTURE CALCULATION USED A COMBINATION OF DISTANCE RESTRAINTS (UNAMBIGUOUS AND AMBIGUOUS), DIHEDRAL ANGLE RESTRAINTS, HYDROGEN-BOND RESTRAINTS AND RESIDUAL DIPOLAR COUPLING RESTRAINTS |
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試料調製
詳細 | 内容: 10% WATER/90% D2O, 100% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 150 mM / pH: 6.5 / 圧: 1.0 atm / 温度: 292.0 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: ARIA1.2 / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LOWEST ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 12 |