登録情報 データベース : PDB / ID : 4b5v 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structures of divalent metal dependent pyruvate aldolase, HpaI, in complex with 4-hydroxyl-2-ketoheptane-1,7-dioate 要素4-HYDROXY-2-OXO-HEPTANE-1,7-DIOATE ALDOLASE 詳細 キーワード LYASE機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
4-hydroxy-2-ketopimelate aldolase activity / 4-hydroxy-2-oxoheptanedioate aldolase / : / phenylacetate catabolic process / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 4-hydroxy-2-oxo-heptane-1,7-dioate aldolase, Enterobacteriales / 2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase / HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase domain / HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family / Phosphoenolpyruvate-binding domains / Pyruvate kinase-like domain superfamily / Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase-like domain superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 (4R)-4-oxidanyl-2-oxidanylidene-heptanedioic acid / PYRUVIC ACID / 4-hydroxy-2-oxo-heptane-1,7-dioate aldolase 類似検索 - 構成要素生物種 ESCHERICHIA COLI ATCC 8739 (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.041 Å 詳細データ登録者 Coincon, M. / Wang, W. / Seah, S.Y.K. / Sygusch, J. 引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2012タイトル : Crystal Structure of Reaction Intermediates in Pyruvate Class II Aldolase: Substrate Cleavage, Enolate Stabilization and Substrate Specificity著者 : Coincon, M. / Wang, W. / Sygusch, J. / Seah, S.Y.K. 履歴 登録 2012年8月7日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2012年8月29日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2012年9月5日 Group : Atomic model / Database references改定 1.2 2012年10月31日 Group : Database references改定 1.3 2013年2月6日 Group : Atomic model改定 1.4 2017年7月12日 Group : Refinement description / カテゴリ : software / Item : _software.name改定 2.0 2023年11月15日 Group : Atomic model / Data collection ... Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Other カテゴリ : atom_site / chem_comp_atom ... atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item : _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ... _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 2.1 2023年12月20日 Group : Refinement description / カテゴリ : pdbx_initial_refinement_model
すべて表示 表示を減らす Remark 700 SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "AA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW ... SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "AA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 8-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 9-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. THE SHEETS PRESENTED AS "BA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 8-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 9-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL.