登録情報 データベース : PDB / ID : 4b0s 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Structure of the Deamidase-Depupylase Dop of the Prokaryotic Ubiquitin-like Modification Pathway in Complex with ATP 要素DEAMIDASE-DEPUPYLASE DOP 詳細 キーワード HYDROLASE / PUPYLATION / PROKARYOTIC UBIQUITIN-LIKE PROTEIN / PROTEASOME機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
protein pupylation / hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amides / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素 / proteasomal protein catabolic process / modification-dependent protein catabolic process / peptidase activity / ATP binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能生物種 ACIDOTHERMUS CELLULOLYTICUS (バクテリア)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.85 Å 詳細データ登録者 Ozcelik, D. / Barandun, J. / Schmitz, N. / Sutter, M. / Guth, E. / Damberger, F.F. / Allain, F.H.-T. / Ban, N. / Weber-Ban, E. 引用ジャーナル : Nat.Commun. / 年 : 2012タイトル : Structures of Pup Ligase Pafa and Depupylase Dop from the Prokaryotic Ubiquitin-Like Modification Pathway.著者 : Ozcelik, D. / Barandun, J. / Schmitz, N. / Sutter, M. / Guth, E. / Damberger, F.F. / Allain, F.H.-T. / Ban, N. / Weber-Ban, E. 履歴 登録 2012年7月4日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2012年9月12日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2013年2月6日 Group : Atomic model改定 1.2 2019年2月27日 Group : Data collection / Derived calculations ... Data collection / Derived calculations / Experimental preparation / Other カテゴリ : exptl_crystal_grow / pdbx_database_proc ... exptl_crystal_grow / pdbx_database_proc / pdbx_database_status / struct_biol / struct_conn Item : _exptl_crystal_grow.method / _exptl_crystal_grow.temp ... _exptl_crystal_grow.method / _exptl_crystal_grow.temp / _pdbx_database_status.recvd_author_approval / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag 改定 1.3 2020年4月1日 Group : Advisory / Derived calculations / Otherカテゴリ : pdbx_database_status / pdbx_struct_conn_angle ... pdbx_database_status / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_sheet_hbond / pdbx_validate_close_contact / struct_conf / struct_conn / struct_conn_type / struct_sheet / struct_sheet_order / struct_sheet_range / struct_site Item : _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id ... _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id / _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id / _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id / _struct_sheet.id / _struct_sheet_order.sheet_id / _struct_sheet_range.sheet_id / _struct_site.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.4 2024年5月8日 Group : Data collection / Database references / Derived calculationsカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id
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