マシュー密度: 2.22 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.72 % 解説: SOLEIL DATASET (SE-SAD) WAS USED TO SOLVE THE STRUCTURE AND IN THE REFINEMENT OF THE FIRST MODEL. ESRF DATASET USED IMPROVE THE RESOLUTION TO 2.15 A, IN LATER REFINEMENT CYCLES.
結晶化
pH: 6 詳細: PROTEIN SOLUTION AT 5 MG/ML IN 10 MM BICINE PH 8.5 AND 100 MM NACL WAS MIXED IN A 3:1 RATIO TO A SOLUTION CONTAINING 3.6% ISOPROPANOL AND 1.9 M AMMONIUM SULPHATE AS PRECIPITANT AGENTS IN 5 MM MGCL2 AND 2 MM AMP
-
データ収集
回折
ID
平均測定温度 (K)
Crystal-ID
1
110
1
2
110
1
放射光源
由来
サイト
ビームライン
ID
波長
シンクロトロン
ESRF
ID29
1
0.91839
シンクロトロン
SOLEIL
PROXIMA1
2
0.97911
検出器
タイプ
ID
検出器
日付
DECTRIS PILATUS 6M
1
PIXEL
2010年7月25日
ADSC QUANTUM 315r
2
CCD
2010年6月3日
放射
ID
プロトコル
単色(M)・ラウエ(L)
散乱光タイプ
Wavelength-ID
1
SINGLEWAVELENGTH
M
x-ray
1
2
SINGLEWAVELENGTH
M
x-ray
1
放射波長
ID
波長 (Å)
相対比
1
0.91839
1
2
0.97911
1
反射
解像度: 2.15→50 Å / Num. obs: 32549 / % possible obs: 97.9 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 12.8 % / Biso Wilson estimate: 36.6 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.08 / Net I/σ(I): 24
反射 シェル
解像度: 2.15→2.21 Å / 冗長度: 13.4 % / Rmerge(I) obs: 0.74 / Mean I/σ(I) obs: 3.72 / % possible all: 99.9
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
BUSTER
2.11.2
精密化
XDS
データ削減
XSCALE
データスケーリング
autoSHARP
位相決定
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 開始モデル: NONE 解像度: 2.15→28.42 Å / SU R Cruickshank DPI: 0.226 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / SU R Blow DPI: 0.239 / SU Rfree Blow DPI: 0.185 詳細: IDEAL-DIST CONTACT TERM CONTACT SETUP. ALL ATOMS HAVE CCP4 ATOM TYPE FROM LIBRARY RESIDUES 44-54 AND 75- 82 ARE NOT VISIBLE IN THE ELECTRON DENSITY MAPS.