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Yorodumi- PDB-4ab7: Crystal structure of a tetrameric acetylglutamate kinase from Sac... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 4ab7 | ||||||
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Title | Crystal structure of a tetrameric acetylglutamate kinase from Saccharomyces cerevisiae complexed with its substrate N- acetylglutamate | ||||||
Components | PROTEIN ARG5,6, MITOCHONDRIAL | ||||||
Keywords | TRANSFERASE / ARGININE BIOSYNTHESIS / AMINO ACID KINASE DOMAIN / GCN5-RELATED ACETYLTRANSFERASE / GNAT / DUF619 | ||||||
Function / homology | Function and homology information Urea cycle / ornithine biosynthetic process / N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase / N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase activity / acetylglutamate kinase / acetylglutamate kinase activity / arginine biosynthetic process / NADP+ binding / NAD binding / protein dimerization activity ...Urea cycle / ornithine biosynthetic process / N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase / N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase activity / acetylglutamate kinase / acetylglutamate kinase activity / arginine biosynthetic process / NADP+ binding / NAD binding / protein dimerization activity / mitochondrial matrix / phosphorylation / regulation of DNA-templated transcription / mitochondrion / ATP binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | SACCHAROMYCES CEREVISIAE (brewer's yeast) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 3.25 Å | ||||||
Authors | de Cima, S. / Gil-Ortiz, F. / Crabeel, M. / Fita, I. / Rubio, V. | ||||||
Citation | Journal: Plos One / Year: 2012 Title: Insight on an Arginine Synthesis Metabolon from the Tetrameric Structure of Yeast Acetylglutamate Kinase Authors: De Cima, S. / Gil-Ortiz, F. / Crabeel, M. / Fita, I. / Rubio, V. | ||||||
History |
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Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. | ||||||
Remark 700 | SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. |
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 4ab7.cif.gz | 1.3 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb4ab7.ent.gz | 1.1 MB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 4ab7.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ab/4ab7 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ab/4ab7 | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 3zzfC 3zzgC 3zzhC 3zziSC C: citing same article (ref.) S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 0 / Refine code: 0
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