PDB-3zzh: Crystal structure of the amino acid kinase domain from Saccharomy...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3zzh

タイトル

Crystal structure of the amino acid kinase domain from Saccharomyces cerevisiae acetylglutamate kinase in complex with its feed- back inhibitor L-arginine

要素

ACETYLGLUTAMATE KINASE

キーワード

TRANSFERASE / ARGININE BIOSYNTHESIS

機能・相同性

機能・相同性情報

Urea cycle / ornithine biosynthetic process / N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase / N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase activity / acetylglutamate kinase / acetylglutamate kinase activity / L-arginine biosynthetic process / NADP+ binding / NAD binding / mitochondrial matrix ...
類似検索 - 分子機能

生物種

SACCHAROMYCES CEREVISIAE (パン酵母)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.1 Å

データ登録者

de Cima, S. / Gil-Ortiz, F. / Crabeel, M. / Fita, I. / Rubio, V.

引用

ジャーナル: Plos One / 年: 2012
タイトル: Insight on an Arginine Synthesis Metabolon from the Tetrameric Structure of Yeast Acetylglutamate Kinase
著者: De Cima, S. / Gil-Ortiz, F. / Crabeel, M. / Fita, I. / Rubio, V.

履歴

登録	2011年9月1日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2012年5月2日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2012年5月9日	Group: Other
改定 1.2	2023年12月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

Remark 650

HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED.

Remark 700

SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED.

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3zzh.cif.gz	471.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3zzh.ent.gz	390.6 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3zzh.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	3zzh_validation.pdf.gz	539.8 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3zzh_full_validation.pdf.gz	558.8 KB	表示
XML形式データ	3zzh_validation.xml.gz	50 KB	表示
CIF形式データ	3zzh_validation.cif.gz	69 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zz/3zzh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zz/3zzh	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3zzfSC 3zzgC 3zziC 4ab7C S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3zzf-d 3zzg-d 6o42-d 2dfv-d 4lck-2 3u9u-3 4tzw-d 4tzp-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#215 - 2017年11月アスパラギン酸カルバモイル転移酵素 (Aspartate Transcarbamoylase) 類似性 (1) #133 - 2011年1月一酸化窒素合成酵素 (Nitric Oxide Synthase) 類似性 (1)

登録構造単位

A: ACETYLGLUTAMATE KINASE

B: ACETYLGLUTAMATE KINASE

C: ACETYLGLUTAMATE KINASE

D: ACETYLGLUTAMATE KINASE

ヘテロ分子

140 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	69.489, 99.596, 189.238
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(-0.3862, 0.07005, 0.9198), (0.00126, -0.9971, 0.07646), (0.9224, 0.03069, 0.385)	17.32, 43.93, -13.14
2	given	(0.5958, 0.07797, -0.7994), (0.06339, -0.9967, -0.04998), (-0.8007, -0.02089, -0.5988)	-53.37, 37.02, -103.3
3	given	(-0.9701, -0.06672, -0.2336), (-0.05917, 0.9975, -0.03921), (0.2356, -0.02421, -0.9716)	-54.65, -2.007, -100.1

-
タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD

#1: タンパク質	ACETYLGLUTAMATE KINASE / N-ACETYLGLUTAMATE KINASE / N-ACETYL-L-GLUTAMATE 5-PHOSPHOTRANSFERASE / NAG KINASE / AGK / PROTEIN ...N-ACETYLGLUTAMATE KINASE / N-ACETYL-L-GLUTAMATE 5-PHOSPHOTRANSFERASE / NAG KINASE / AGK / PROTEIN ARG5\ / 6\ / MITOCHONDRIAL 分子量: 34015.039 Da / 分子数: 4 / 断片: AMINO ACID KINASE DOMAIN, RESIDUES 58-356 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) SACCHAROMYCES CEREVISIAE (パン酵母) 株: SIGMA 1278B / プラスミド: PYK6-AAK / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q01217, acetylglutamate kinase

#1: タンパク質

ACETYLGLUTAMATE KINASE / N-ACETYLGLUTAMATE KINASE / N-ACETYL-L-GLUTAMATE 5-PHOSPHOTRANSFERASE / NAG KINASE / AGK / PROTEIN ...

分子量: 34015.039 Da / 分子数: 4 / 断片: AMINO ACID KINASE DOMAIN, RESIDUES 58-356 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

SACCHAROMYCES CEREVISIAE (パン酵母)
株: SIGMA 1278B / プラスミド: PYK6-AAK / 発現宿主:

ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q01217, acetylglutamate kinase

-
非ポリマー , 7種, 556分子

#2: 化合物	... ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 45 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#3: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#4: 化合物	ChemComp-MLI / MALONATE ION / マロナ-ト分子量: 102.046 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₂O₄
#5: 化合物	ChemComp-NLG / N-ACETYL-L-GLUTAMATE / N-アセチルグルタミン酸分子量: 189.166 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₇H₁₁NO₅
#6: 化合物	ChemComp-ARG / ARGININE / L-アルギニン-ω′-カチオンタイプ: L-peptide linking / 分子量: 175.209 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₅N₄O₂
#7: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#8: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 497 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.41 Å³/Da / 溶媒含有率: 49 % / 解説: NONE
結晶化	pH: 4.6 詳細: PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50 MM NA-ACETATE, PH 4.6, 0.2 M NA-MALONATE AND 2% PEG 8000,, CONTAINING 24MM N-ACETYLGLUTAMATE (NAG); 24 HOURS BEFORE FREEZING ARGININE 0.2 M WAS ADDED TO ...詳細: PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50 MM NA-ACETATE, PH 4.6, 0.2 M NA-MALONATE AND 2% PEG 8000,, CONTAINING 24MM N-ACETYLGLUTAMATE (NAG); 24 HOURS BEFORE FREEZING ARGININE 0.2 M WAS ADDED TO CRYSTALLIZATION DROP. 20% GLYCEROL WAS USED AS CRYOPROTECTOR

結晶

マシュー密度: 2.41 Å³/Da / 溶媒含有率: 49 % / 解説: NONE

結晶化

pH: 4.6
詳細: PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50 MM NA-ACETATE, PH 4.6, 0.2 M NA-MALONATE AND 2% PEG 8000,, CONTAINING 24MM N-ACETYLGLUTAMATE (NAG); 24 HOURS BEFORE FREEZING ARGININE 0.2 M WAS ADDED TO ...

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: BM16 / 波長: 0.9786
検出器	タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD / 日付: 2010年9月7日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9786 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.1→20 Å / Num. obs: 77012 / % possible obs: 99.6 % / Observed criterion σ(I): 1.9 / 冗長度: 4.8 % / B_iso Wilson estimate: 19.8 Å² / R_merge(I) obs: 0.13 / Net I/σ(I): 3.8
反射シェル	解像度: 2.1→2.21 Å / 冗長度: 4.7 % / R_merge(I) obs: 0.37 / Mean I/σ(I) obs: 1.9 / % possible all: 99.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.5.0109	精密化
XDS		データ削減
SCALA		データスケーリング
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 3ZZF

3zzf

解像度: 2.1→20 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.942 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.925 / SU B: 8.639 / SU ML: 0.109 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.209 / ESU R Free: 0.169 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS.

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.21544	3860	5 %	RANDOM
R_work	0.18037	-	-	-
obs	0.18211	72907	99.27 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 22.225 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.32 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	0.26 Å²	0 Å²
3-	-	-	0.07 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.1→20 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	8953	0	276	497	9726

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.007	0.022	9417
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	6462
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.019	1.988	12645
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.801	3.005	15521
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.699	5	1179
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	32.555	24.987	389
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	13.565	15	1696
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	17.913	15	49
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.058	0.2	1470
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.003	0.02	10300
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	1737
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.326	1.5	5829
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.061	1.5	2402
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.649	2	9418
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.143	3	3588
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	2.003	4.5	3227
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 2.1→2.154 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.279	312	-
R_work	0.215	5240	-
obs	-	-	99.87 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.6237	0.0189	3.1064	3.2823	0.042	9.3537	0.3071	-0.4284	-0.2794	0.0333	0.1276	0.1501	0.6002	-0.3335	-0.4347	0.1142	-0.0185	-0.1414	0.1407	0.0797	0.2535	-19.356	-2.192	-47.468
2	2.7552	0.6588	-0.4891	2.616	0.6717	2.4237	-0.0534	0.1456	0.0395	-0.1112	0.1082	-0.0444	0.085	-0.0116	-0.0549	0.1161	-0.0033	-0.0077	0.0496	0.0229	0.0545	-14.715	40.274	-50.831
3	3.7566	-0.3397	3.3326	1.0764	0.2961	5.2025	-0.2996	-0.3257	0.2895	0.2007	-0.0462	0.096	-0.8659	-0.2581	0.3457	0.3479	0.0081	-0.015	0.1146	-0.0273	0.1413	-27.424	40.484	-60.202
4	5.2624	-0.7965	1.0134	3.7535	1.1485	6.4857	0.0515	0.1453	-0.247	-0.0048	0.0853	-0.2663	0.2142	0.2832	-0.1369	0.0721	0.0183	-0.0849	0.1045	0.0334	0.209	-20.077	-1.464	-60.828
5	1.2074	-0.3759	0.3015	1.5752	0.1049	1.0937	-0.0728	-0.1464	0.0041	0.076	0.0818	-0.0574	0.0365	0.0212	-0.009	0.0905	0.0518	-0.0183	0.0592	-0.0011	0.1115	-1.671	9.907	-30.057
6	0.8219	-0.2136	0.1557	1.1132	0.0654	1.339	-0.0326	-0.1117	0.0218	0.1317	0.0968	-0.1229	0.0761	0.1196	-0.0642	0.0979	0.0516	-0.0235	0.0509	-0.0291	0.0894	-8.541	32.164	-26.405
7	0.9501	0.1108	-0.0278	0.6333	-0.5005	2.6407	0.0433	0.0829	0.0958	0.0069	0.018	0.0091	-0.122	0.0316	-0.0613	0.0796	-0.0238	0.0041	0.0441	0.0233	0.1001	-29.624	28.968	-83.987
8	0.9886	0.0054	0.1249	1.1102	-0.5607	1.4397	-0.0228	0.1442	0.0217	-0.1323	0.0718	-0.0384	0.0692	-0.0052	-0.0489	0.056	-0.0309	-0.011	0.0387	0.0192	0.096	-35.878	6.575	-80.822
9	2.0518	-1.356	0.8519	3.6286	-0.6322	2.9568	-0.0825	-0.2477	-0.2251	-0.0207	0.1608	0.2617	0.2733	-0.0915	-0.0784	0.1278	0.0318	0.0199	0.0779	0.0597	0.1403	-2.135	-10.095	-29.428
10	2.9554	0.0279	0.5911	2.2663	2.0421	3.6305	-0.035	-0.1344	0.2516	-0.0405	0.1908	-0.2746	-0.1261	0.3058	-0.1559	0.0853	0.002	-0.0164	0.0402	-0.0475	0.1603	-7.72	51.858	-28.482
11	6.1665	1.9343	2.2634	5.3518	-0.7872	5.2317	-0.9	0.7796	0.9375	-0.3925	0.3019	0.3328	-1.2975	-0.0073	0.5981	0.6188	-0.0788	-0.1853	0.1225	0.0902	0.3064	-31.517	49.819	-81.188
12	2.333	1.6038	0.4246	2.9023	0.9292	3.2399	-0.0871	0.2724	-0.3117	-0.2046	0.1009	-0.3335	0.2747	0.0802	-0.0138	0.1377	0.0118	0.0229	0.0367	-0.0205	0.1717	-33.725	-13.197	-80.528

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	62 - 98
2	X-RAY DIFFRACTION	2	B	63 - 98
3	X-RAY DIFFRACTION	3	C	63 - 98
4	X-RAY DIFFRACTION	4	D	63 - 98
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	99 - 271
6	X-RAY DIFFRACTION	6	B	99 - 271
7	X-RAY DIFFRACTION	7	C	99 - 271
8	X-RAY DIFFRACTION	8	D	99 - 271
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	272 - 357
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	272 - 357
11	X-RAY DIFFRACTION	11	C	272 - 357
12	X-RAY DIFFRACTION	12	D	272 - 357

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD

-
非ポリマー , 7種, 556分子

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD

-非ポリマー , 7種, 556分子

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD

-
非ポリマー , 7種, 556分子

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)