PDB-3zzf: Crystal structure of the amino acid kinase domain from Saccharomy...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3zzf

タイトル

Crystal structure of the amino acid kinase domain from Saccharomyces cerevisiae acetylglutamate kinase complexed with its substrate N- acetylglutamate

要素

ACETYLGLUTAMATE KINASE

キーワード

TRANSFERASE / N-ACETYL-L-GLUTAMATE / ARGININE BIOSYNTHESIS

機能・相同性

機能・相同性情報

Urea cycle / ornithine biosynthetic process / N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase / N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase activity / acetylglutamate kinase / acetylglutamate kinase activity / L-arginine biosynthetic process / NADP+ binding / NAD binding / mitochondrial matrix ...
類似検索 - 分子機能

生物種

SACCHAROMYCES CEREVISIAE (パン酵母)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.2 Å

データ登録者

de Cima, S. / Gil-Ortiz, F. / Crabeel, M. / Fita, I. / Rubio, V.

引用

ジャーナル: Plos One / 年: 2012
タイトル: Insight on an Arginine Synthesis Metabolon from the Tetrameric Structure of Yeast Acetylglutamate Kinase
著者: De Cima, S. / Gil-Ortiz, F. / Crabeel, M. / Fita, I. / Rubio, V.

履歴

登録	2011年9月1日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2012年5月2日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2012年5月9日	Group: Other
改定 1.2	2024年5月1日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

Remark 650

HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED.

Remark 700

SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED.

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3zzf.cif.gz	471.2 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3zzf.ent.gz	391.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3zzf.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3zzf_validation.pdf.gz	504.8 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3zzf_full_validation.pdf.gz	517.7 KB	表示
XML形式データ	3zzf_validation.xml.gz	47.3 KB	表示
CIF形式データ	3zzf_validation.cif.gz	65.7 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zz/3zzf ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/zz/3zzf	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3zzgC 3zzhC 3zziC 4ab7C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3zzh-d 3zzg-d 2dfv-d 4tzw-d 4lus-d 3wf3-2 6o42-d 5mqt-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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アクチノマイシン (Actinomycin)
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鉛の毒 (Lead Poisoning)
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レグマイン (Legumain)
類似性 (1)
#225 - 2018年9月
フィターゼ (Phytase)
類似性 (1)
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類似性 (1)
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カロテノイド酸素添加酵素 (Carotenoid Oxygenase)
類似性 (1)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (1)

登録構造単位

A: ACETYLGLUTAMATE KINASE

B: ACETYLGLUTAMATE KINASE

C: ACETYLGLUTAMATE KINASE

D: ACETYLGLUTAMATE KINASE

ヘテロ分子

140 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	69.701, 99.299, 190.644
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Refine code	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	6	A	1 - 400
2	1	1	6	B	1 - 400
3	1	1	6	C	1 - 400
4	1	1	6	D	1 - 400

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(-0.7489, 0.00623, 0.6627), (0.02443, -0.999, 0.037), (0.6623, 0.04389, 0.748)	-5.02946, 36.0436, 0.71287
2	given	(0.5912, 0.01295, -0.8064), (0.0151, -0.9999, -0.00498), (-0.8064, -0.009235, -0.5913)	38.08, 39.14, 76.1
3	given	(-0.9748, -0.007891, 0.2228), (-0.02255, 0.9977, -0.06332), (-0.2218, -0.06675, -0.9728)	16.27, 2.183, 85.44

-
タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD

#1: タンパク質	ACETYLGLUTAMATE KINASE / N-ACETYLGLUTAMATE KINASE / N-ACETYL-L-GLUTAMATE 5-PHOSPHOTRANSFERASE / NAG KINASE / AGK / PROTEIN ...N-ACETYLGLUTAMATE KINASE / N-ACETYL-L-GLUTAMATE 5-PHOSPHOTRANSFERASE / NAG KINASE / AGK / PROTEIN ARG5\ / 6\ / MITOCHONDRIAL 分子量: 34015.039 Da / 分子数: 4 / 断片: AMINO ACID KINASE DOMAIN, RESIDUES 58-356 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) SACCHAROMYCES CEREVISIAE (パン酵母) 株: SIGMA 1278B / プラスミド: PYK6-AAK / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q01217, acetylglutamate kinase

#1: タンパク質

ACETYLGLUTAMATE KINASE / N-ACETYLGLUTAMATE KINASE / N-ACETYL-L-GLUTAMATE 5-PHOSPHOTRANSFERASE / NAG KINASE / AGK / PROTEIN ...

分子量: 34015.039 Da / 分子数: 4 / 断片: AMINO ACID KINASE DOMAIN, RESIDUES 58-356 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

SACCHAROMYCES CEREVISIAE (パン酵母)
株: SIGMA 1278B / プラスミド: PYK6-AAK / 発現宿主:

ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q01217, acetylglutamate kinase

-
非ポリマー , 6種, 466分子

#2: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 13 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 化合物	ChemComp-HG / MERCURY (II) ION 分子量: 200.590 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: Hg
#5: 化合物	ChemComp-NLG / N-ACETYL-L-GLUTAMATE / N-アセチルグルタミン酸分子量: 189.166 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₇H₁₁NO₅
#6: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 430 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.43 Å³/Da / 溶媒含有率: 49 % / 解説: NONE
結晶化	pH: 4.6 詳細: PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50 MM NA-ACETATE, PH 4.6, 0.2 M NA-MALONATE AND 2% PEG 8000,, CONTAINING 24MM N-ACETYLGLUTAMATE; PREVIOUS TO FREEZING, CRYSTAL WAS SOAKED IN 2 MM HGCL2 AND 25% ...詳細: PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50 MM NA-ACETATE, PH 4.6, 0.2 M NA-MALONATE AND 2% PEG 8000,, CONTAINING 24MM N-ACETYLGLUTAMATE; PREVIOUS TO FREEZING, CRYSTAL WAS SOAKED IN 2 MM HGCL2 AND 25% GLYCEROL AS CRYOPROTECTOR

結晶

マシュー密度: 2.43 Å³/Da / 溶媒含有率: 49 % / 解説: NONE

結晶化

pH: 4.6
詳細: PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50 MM NA-ACETATE, PH 4.6, 0.2 M NA-MALONATE AND 2% PEG 8000,, CONTAINING 24MM N-ACETYLGLUTAMATE; PREVIOUS TO FREEZING, CRYSTAL WAS SOAKED IN 2 MM HGCL2 AND 25% ...

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID14-4 / 波長: 0.979
検出器	タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD / 日付: 2009年7月25日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.979 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.2→19.97 Å / Num. obs: 67865 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): 1.9 / 冗長度: 15 % / B_iso Wilson estimate: 26.7 Å² / R_merge(I) obs: 0.12 / Net I/σ(I): 5
反射シェル	解像度: 2.2→2.32 Å / 冗長度: 15.3 % / R_merge(I) obs: 0.4 / Mean I/σ(I) obs: 1.9 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.5.0109	精密化
MOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: STARTING MODEL WAS A LOW RESOLUTION INCOMPLETE MODEL FROM A SE-MET SUBSTITUTED CRYSTAL

解像度: 2.2→20 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.948 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.927 / SU B: 10.302 / SU ML: 0.126 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.247 / ESU R Free: 0.19 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. U VALUES RESIDUAL ONLY.

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.21812	3432	5.1 %	RANDOM
R_work	0.1787	-	-	-
obs	0.1807	64245	99.92 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 26.165 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.05 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	0.06 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.11 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.2→20 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	8984	0	143	430	9557

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.008	0.022	9357
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	6343
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.038	1.986	12632
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.804	3.002	15480
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.65	5	1186
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	34.377	25.077	392
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	14.669	15	1707
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	14.062	15	48
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.059	0.2	1472
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.003	0.02	10336
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	1740
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.343	1.5	5850
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.07	1.5	2412
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.681	2	9455
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.152	3	3507
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	1.966	4.5	3177
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Ens-ID: 1 / 数: 3616 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Dom-ID	Auth asym-ID	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	A	loose positional	1.26	5
2	B	loose positional	1.13	5
3	C	loose positional	1.08	5
4	D	loose positional	1.11	5
1	A	loose thermal	1.68	10
2	B	loose thermal	1.18	10
3	C	loose thermal	1.53	10
4	D	loose thermal	1.55	10

LS精密化シェル

解像度: 2.202→2.258 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.243	253	-
R_work	0.188	4617	-
obs	-	-	99.25 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	8.1808	-0.7205	-0.4274	10.9121	3.1279	5.8433	-0.2413	0.5056	-0.0231	-0.5379	0.3752	-0.3176	0.1926	-0.0478	-0.1339	0.1608	-0.0249	-0.0438	0.1321	-0.008	0.0318	15.523	36.69	35.701
2	0.5974	0.1605	1.3586	2.1251	1.6119	3.5283	-0.0211	-0.0475	0.0728	0.0767	0.0298	-0.1366	-0.1099	-0.1488	-0.0087	0.1761	-0.0506	-0.0054	0.1447	0.0554	0.1181	8.47	37.522	26.363
3	4.5598	-0.0089	-0.4471	5.9429	0.2207	2.9194	-0.0049	0.105	-0.0738	-0.0349	-0.0278	-0.2746	0.1615	0.0708	0.0328	0.1721	-0.0855	0.0071	0.1358	0.0553	0.0462	10.935	28.815	-3.621
4	2.1387	-0.4222	1.81	1.7788	-0.9332	4.3983	-0.0007	0.2692	0.0804	-0.2128	0.0411	-0.0376	0.1518	0.1688	-0.0403	0.1073	-0.0823	0.0124	0.1173	0.0283	0.0648	5.619	25.103	10.519
5	1.0775	0.2786	0.7397	1.9535	-2.0148	8.9733	0.0115	0.059	0.0117	0.0173	0.2641	0.2048	-0.1694	-0.6464	-0.2757	0.0646	-0.0399	-0.0079	0.1055	0.0522	0.0892	-2.316	26.803	15.165
6	1.1231	1.2362	1.6126	3.8136	2.2679	2.7432	-0.1275	0.0183	0.0608	-0.1699	0.1196	0.0688	-0.1569	-0.1653	0.0079	0.1187	-0.0242	-0.0033	0.1424	0.0771	0.103	0.45	34.224	11
7	2.4863	-0.1338	0.2733	3.048	-0.9737	4.998	0.0368	0.0239	0.2417	0.0606	0.0497	-0.0624	-0.6741	-0.1953	-0.0866	0.168	0.013	0.0287	0.0446	0.0432	0.1027	3.458	49.598	11.708
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9	1.2711	0.0011	1.474	0.9252	0.1217	1.9709	-0.0687	0.1021	0.0146	0.0246	0.0945	-0.132	-0.0293	0.0965	-0.0258	0.0949	-0.0277	-0.0223	0.103	0.0275	0.1461	1.305	4.102	24.106
10	3.7432	-1.3328	-0.5379	2.1892	-1.422	2.4107	-0.0393	0.2449	-0.122	-0.204	0.0016	0.0908	0.1502	-0.0602	0.0376	0.0914	-0.0492	-0.0464	0.0845	0.0485	0.0839	-13.925	8.002	5.869
11	5.9207	0.2596	3.4733	2.1772	1.2175	13.1926	-0.2587	-0.2958	0.1597	0.0688	0.0992	0.0694	-0.252	-0.3643	0.1595	0.0854	-0.0293	-0.0439	0.0575	0.0361	0.1053	-2.064	13.413	25.808
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16	2.0599	0.7161	0.9785	3.2401	1.5486	5.7913	-0.0086	-0.114	-0.4087	0.1351	0.1254	-0.3648	0.4233	0.4199	-0.1167	0.0837	0.0077	-0.021	0.0781	-0.0048	0.2044	5.675	-9.887	21.411
17	8.8337	2.0871	-3.3363	12.747	2.0115	8.5519	-0.0645	-0.6282	0.3451	0.0854	0.2967	-0.3479	0.0002	0.4989	-0.2322	0.1452	0.011	-0.1453	0.0992	-0.0121	0.1576	18.288	3.988	42.577
18	4.3969	-0.6502	2.8111	7.4913	7.5888	17.0744	0.1793	-0.2631	0.0121	0.2009	0.1026	0.4043	0.9736	-0.5094	-0.2819	0.2383	-0.0424	-0.1437	0.1755	0.1452	0.2903	13.807	-5.694	50.486
19	2.4453	-0.7278	1.4066	1.2702	-0.3643	2.1846	-0.0173	0.0657	0.0148	-0.1751	-0.0287	-0.0887	0.0825	0.1949	0.0461	0.1376	0.0655	0.0033	0.1017	0.0102	0.1373	34.902	7.206	57.85
20	4.615	-1.624	4.8901	1.1006	-1.3523	7.4916	-0.131	-0.0138	0.2215	0.0068	0.0224	-0.1397	0.0464	0.3572	0.1086	0.0629	0.0841	-0.01	0.173	-0.0394	0.1489	41.367	12.95	66.506
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23	5.3233	2.4233	2.8076	3.9722	2.0472	3.0672	-0.021	-0.2706	-0.1335	0.1768	0.0314	0.0626	0.1147	-0.155	-0.0104	0.1098	0.0763	0.008	0.1794	0.0393	0.0493	28.978	7.792	71.843
24	4.7851	-3.5641	2.706	5.2748	-2.9958	2.055	0.1446	-0.0878	-0.0676	-0.4224	-0.182	-0.2048	0.1855	0.2086	0.0374	0.2084	0.0568	0.0029	0.1434	0.0144	0.1128	37.588	-9.225	60.299
25	4.0512	-2.7106	-1.2778	4.5154	0.2494	6.7864	-0.1928	-0.4882	-0.2327	0.43	0.3259	0.2293	0.3326	-0.0319	-0.1332	0.1521	0.0558	0.0015	0.0898	0.0642	0.1415	32.735	-10.045	70.24
26	4.5847	-4.5863	5.1419	3.7783	-2.1261	1.7324	0.6699	-0.3918	-1.0563	-0.7557	0.1064	0.6882	0.6749	-0.5988	-0.7763	0.383	-0.0833	-0.1396	0.2484	0.1158	0.3267	26.407	-8.254	56.364
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29	1.7259	0.0914	-3.2438	0.9161	-1.5494	13.227	-0.0709	-0.2102	-0.0995	0.1262	0.1332	-0.0073	0.3327	-0.0206	-0.0623	0.1185	0.0573	-0.0326	0.1036	-0.0173	0.1097	21.254	32.723	76.313
30	4.9013	0.607	0.1282	3.6835	-1.6956	4.948	-0.0255	-0.5066	0.0231	0.1361	-0.0359	-0.0906	0.1395	0.2283	0.0614	0.0974	0.0764	-0.018	0.1535	-0.0346	0.0302	27.88	31.434	81.564
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32	3.7863	0.2844	0.7468	2.0988	0.9697	10.3086	0.1362	-0.3221	-0.1136	0.1568	0.1326	-0.3829	0.0609	0.816	-0.2688	0.0758	0.0757	-0.0781	0.2068	-0.0541	0.1515	38.458	32.242	74.437
33	4.4665	0.3147	3.2433	2.849	1.353	7.4372	0.0909	0.0725	-0.1312	-0.1081	0.1031	-0.3257	0.2391	0.2293	-0.1941	0.0857	0.0468	0.0015	0.0266	-0.0188	0.1394	29.896	27.631	59.312
34	1.3376	-1.6923	1.8799	2.3615	-1.7996	4.0528	-0.0381	0.0453	0.1362	0.0937	-0.0338	-0.3332	-0.0948	0.2309	0.0718	0.062	0.0297	-0.0285	0.1769	-0.0555	0.1823	35.111	34.503	67.814
35	0.4819	-0.3308	0.3781	3.3639	1.5997	2.4533	-0.0312	-0.1292	0.1103	-0.0808	0.0912	-0.0137	-0.1175	0.1743	-0.06	0.0518	-0.0037	-0.0185	0.0931	-0.0535	0.0922	23.273	52.517	66.8
36	6.0337	-3.0813	-5.4643	4.7855	4.6007	12.1644	-0.2295	-0.4177	0.2163	0.3417	0.4131	-0.2178	0.2398	0.5245	-0.1836	0.0455	-0.0066	-0.0521	0.162	-0.0617	0.0681	31.903	52.362	73.23
37	3.5326	1.3197	2.9215	3.288	1.2924	5.4688	-0.169	0.4293	0.2712	-0.3611	0.1526	0.0184	-0.3895	0.3741	0.0164	0.1153	-0.0019	0.0164	0.0784	-0.0144	0.0931	25.186	49.377	58.102

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	62 - 78
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	79 - 135
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	136 - 168
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	169 - 208
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	209 - 235
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	236 - 274
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	275 - 352
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	63 - 90
9	X-RAY DIFFRACTION	9	B	91 - 143
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	144 - 172
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	173 - 190
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	191 - 238
13	X-RAY DIFFRACTION	13	B	239 - 265
14	X-RAY DIFFRACTION	14	B	266 - 291
15	X-RAY DIFFRACTION	15	B	292 - 318
16	X-RAY DIFFRACTION	16	B	319 - 351
17	X-RAY DIFFRACTION	17	C	62 - 76
18	X-RAY DIFFRACTION	18	C	77 - 98
19	X-RAY DIFFRACTION	19	C	99 - 152
20	X-RAY DIFFRACTION	20	C	153 - 182
21	X-RAY DIFFRACTION	21	C	183 - 197
22	X-RAY DIFFRACTION	22	C	198 - 235
23	X-RAY DIFFRACTION	23	C	236 - 265
24	X-RAY DIFFRACTION	24	C	266 - 284
25	X-RAY DIFFRACTION	25	C	285 - 330
26	X-RAY DIFFRACTION	26	C	331 - 351
27	X-RAY DIFFRACTION	27	D	63 - 90
28	X-RAY DIFFRACTION	28	D	91 - 128
29	X-RAY DIFFRACTION	29	D	129 - 151
30	X-RAY DIFFRACTION	30	D	152 - 172
31	X-RAY DIFFRACTION	31	D	173 - 193
32	X-RAY DIFFRACTION	32	D	194 - 219
33	X-RAY DIFFRACTION	33	D	220 - 239
34	X-RAY DIFFRACTION	34	D	240 - 263
35	X-RAY DIFFRACTION	35	D	264 - 291
36	X-RAY DIFFRACTION	36	D	292 - 318
37	X-RAY DIFFRACTION	37	D	319 - 352

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万見 (Yorodumi)