- PDB-3zf5: Phage dUTPases control transfer of virulence genes by a proto-onc... -
+
データを開く
IDまたはキーワード:
読み込み中...
-
基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3zf5
タイトル
Phage dUTPases control transfer of virulence genes by a proto-oncogenic G protein-like mechanism. (Staphylococcus bacteriophage 80alpha dUTPase Y84F mutant with dUpNHpp).
要素
DUTPASE
キーワード
HYDROLASE / PATHOGENICITY ISLAND / SAPI INDUCTION / GENE TRANSFER / MOONLIGHTING PROTEINS / G-PROTEIN / P-LOOP
機能・相同性
機能・相同性情報
dUTP catabolic process / dUMP biosynthetic process / dUTP diphosphatase / dUTP diphosphatase activity / magnesium ion binding 類似検索 - 分子機能
解像度: 3.2→14.71 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.878 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.807 / SU B: 15.769 / SU ML: 0.267 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.126 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. INITIAL MET IS NOT TRACED. RESIDUES F115, K117, E118 AND E159 ARE TRACED AS A BECAUSE OF LACK OF ELECTRON DENSITY.
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.27663
150
4.2 %
RANDOM
Rwork
0.22189
-
-
-
obs
0.22421
3391
89.53 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK