PDB-3w1j: Crystal structure of the N-terminal truncated selenocysteine synt...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3w1j

タイトル

Crystal structure of the N-terminal truncated selenocysteine synthase SelA in complex with thiosulfate

要素

L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase

キーワード

TRANSFERASE / homodecamer / pentamer of dimers / fold-type I pyridoxal 5'-phosphate (PLP) dependent enzyme / L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase / selenocysteine synthesis / selenium metabolism

機能・相同性

機能・相同性情報

L-seryl-tRNASec selenium transferase / L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase activity / conversion of seryl-tRNAsec to selenocys-tRNAsec / selenocysteine incorporation / identical protein binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Aquifex aeolicus (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.252 Å

データ登録者

Itoh, Y. / Sekine, S. / Yokoyama, S.

引用

ジャーナル: Science / 年: 2013
タイトル: Decameric SelA-tRNA(Sec) ring structure reveals mechanism of bacterial selenocysteine formation
著者: Itoh, Y. / Brocker, M.J. / Sekine, S. / Hammond, G. / Suetsugu, S. / Soll, D. / Yokoyama, S.

履歴

登録	2012年11月15日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2013年6月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年11月22日	Group: Refinement description / カテゴリ: software
改定 1.2	2023年11月8日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.3	2023年12月6日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3w1j.cif.gz	1.5 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3w1j.ent.gz	1.3 MB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3w1j.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3w1j_validation.pdf.gz	566.5 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3w1j_full_validation.pdf.gz	714.9 KB	表示
XML形式データ	3w1j_validation.xml.gz	152.6 KB	表示
CIF形式データ	3w1j_validation.cif.gz	198.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w1/3w1j ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w1/3w1j	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	3w1hC 3w1iSC 3w1kC C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3w1i-d 3gyr-2 3gyr-1 30401 6wpk-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase

B: L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase

C: L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase

D: L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase

E: L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase

F: L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase

G: L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase

H: L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase

I: L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase

J: L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase

ヘテロ分子

442 kDa, 10 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	92.442, 116.372, 124.788
Angle α, β, γ (deg.)	102.090, 93.390, 106.060
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1

#1: タンパク質	L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase / Selenocysteine synthase / Sec synthase / Selenocysteinyl-tRNA(Sec) synthase 分子量: 43998.105 Da / 分子数: 10 断片: the core and C-terminal domains, UNP residues 62-452 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Aquifex aeolicus (バクテリア) / 株: VF5 / 遺伝子: selA / プラスミド: pET22b / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): Rosetta 2(DE3) 参照: UniProt: O67140, L-seryl-tRNASec selenium transferase
#2: 化合物	ChemComp-K / POTASSIUM ION / カリウムカチオン分子量: 39.098 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: K
#3: 化合物	ChemComp-THJ / THIOSULFATE 分子量: 112.128 Da / 分子数: 16 / 由来タイプ: 合成 / 式: O₃S₂

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.84 Å³/Da / 溶媒含有率: 56.76 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 120mM Tris-HCl, 12% PEG 4000, 800mM NaNO3, 160mM KCl, 50mM L-serine, 50mM Na2S2O3, 0.2M NaCl, 10mM 2-mercaptoethanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 90 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Photon Factory / ビームライン: BL-5A / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2007年5月31日 / 詳細: mirrors
放射	モノクロメーター: Si / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3.25→50 Å / Num. all: 76007 / Num. obs: 75475 / % possible obs: 99.3 % / Observed criterion σ(I): -2 / 冗長度: 3.9 % / R_merge(I) obs: 0.129 / R_sym value: 0.129 / Net I/σ(I): 12.7
反射シェル	解像度: 3.25→3.37 Å / 冗長度: 3.8 % / R_merge(I) obs: 0.538 / Mean I/σ(I) obs: 2.05 / R_sym value: 0.538 / % possible all: 98.6

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PHASER		位相決定
PHENIX	1.7.1_743	精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
ADSC	Quantum	データ収集
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3W1I

3w1i

解像度: 3.252→38.518 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / FOM work R set: 0.753 / SU ML: 0.92 / σ(F): 1.97 / 位相誤差: 31.28 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2661	3812	5.06 %	RANDOM
R_work	0.2003	-	-	-
obs	0.2036	75371	98.94 %	-
all	-	76178	-	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.16 Å / VDWプローブ半径: 0.5 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 70.465 Å² / k_sol: 0.285 e/Å³

原子変位パラメータ

B_iso max: 333.29 Å² / B_iso mean: 123.2922 Å² / B_iso min: 41.21 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-40.2921 Å²	-0.5608 Å²	-7.5529 Å²
2-	-	41.1022 Å²	-2.4413 Å²
3-	-	-	-0.8101 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3.252→38.518 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	30803	0	85	0	30888

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.009	31277
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.26	42075
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.074	4853
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	5333
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.109	12151

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 27

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
3.2523-3.2934	0.4392	138	0.3399	2501	2639	92
3.2934-3.3367	0.3613	131	0.316	2631	2762	99
3.3367-3.3824	0.3814	167	0.2973	2624	2791	99
3.3824-3.4307	0.3467	125	0.2634	2699	2824	99
3.4307-3.4819	0.3184	130	0.2656	2591	2721	99
3.4819-3.5363	0.3413	148	0.2558	2711	2859	99
3.5363-3.5942	0.3097	130	0.2498	2597	2727	99
3.5942-3.6561	0.2958	131	0.2322	2689	2820	99
3.6561-3.7226	0.3173	144	0.233	2652	2796	99
3.7226-3.7941	0.3196	140	0.2278	2635	2775	99
3.7941-3.8715	0.2706	156	0.2162	2668	2824	99
3.8715-3.9556	0.2534	144	0.2042	2628	2772	99
3.9556-4.0475	0.27	128	0.1938	2654	2782	99
4.0475-4.1486	0.2366	146	0.1818	2652	2798	99
4.1486-4.2606	0.262	149	0.1785	2637	2786	99
4.2606-4.3858	0.2612	141	0.1664	2691	2832	99
4.3858-4.5272	0.2177	135	0.1593	2653	2788	99
4.5272-4.6887	0.2245	134	0.1493	2695	2829	99
4.6887-4.8761	0.2298	132	0.1483	2670	2802	99
4.8761-5.0975	0.253	152	0.1583	2640	2792	100
5.0975-5.3656	0.2309	138	0.1658	2677	2815	100
5.3656-5.7008	0.3042	152	0.1998	2649	2801	100
5.7008-6.1393	0.2975	134	0.2032	2688	2822	100
6.1393-6.7542	0.3148	159	0.2278	2637	2796	100
6.7542-7.7247	0.2604	155	0.1794	2672	2827	100
7.7247-9.7065	0.1816	140	0.1435	2672	2812	100
9.7065-38.5209	0.2453	133	0.2429	2646	2779	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.1835	-0.3473	-0.0353	0.7774	-0.035	2.1292	-0.323	0.3029	-0.2329	-0.14	0.1114	-0.0988	-0.0011	-0.0042	0.2026	0.8111	0.01	-0.0473	0.5052	-0.0207	0.9375	42.121	-36.2329	29.4896
2	1.8298	0.0297	-0.3391	1.9202	0.9108	3.1408	-0.0607	-0.0922	-0.4456	0.0967	-0.0195	0.0245	0.3181	-0.4107	0.0923	0.668	-0.0661	0.0904	0.4191	-0.0655	0.5907	21.2751	-36.5474	45.9671
3	2.6605	-0.5953	-1.5428	1.3369	-1.3327	3.3137	-0.209	-0.4191	-0.1695	0.1304	-0.2643	-0.4032	0.3704	0.7025	0.4557	0.816	0.0123	0.0186	0.6225	0.058	1.0117	54.7537	-43.164	38.5309
4	3.1354	0.6244	-0.5704	3.668	0.2285	1.9699	0.1057	0.1673	-0.8463	-0.7548	0.0554	0.0488	0.3957	-0.0058	-0.1505	1.0071	-0.1947	-0.003	0.8883	-0.3217	0.8927	16.3364	-48.7407	21.2634
5	3.221	-1.3577	0.1682	2.9068	-1.0864	1.6014	-0.0215	0.3276	-0.0171	-0.1911	0.082	-0.1557	0.3058	-0.316	-0.0688	0.5965	-0.0547	0.052	0.5981	-0.1862	0.4671	20.6064	-23.4017	19.7771
6	0.8173	0.2317	-0.3075	2.3782	0.1374	1.2048	0.1218	0.4694	-0.7928	-0.8099	0.2817	0.2894	1.1858	-0.3559	-0.3062	1.4357	-0.3233	-0.2247	1.2391	-0.3496	1.269	9.9788	-54.0805	8.3106
7	3.6872	-1.3915	0.1218	2.6585	-1.3839	5.6564	0.4856	1.1518	0.2355	-0.033	-0.2898	-0.4191	-0.3314	1.7336	-0.1428	0.7627	-0.1747	0.017	1.9029	-0.1949	1.1229	-17.8435	-11.9584	-8.3152
8	3.6551	-0.5455	0.6245	1.2931	-0.5558	1.8486	-0.043	0.8491	-0.3357	-0.1979	0.056	0.099	0.0634	0.2378	-0.0222	0.5321	-0.083	0.0344	0.7792	-0.0706	0.5467	-22.7625	-20.0237	16.6243
9	1.3685	-0.5477	0.2338	2.8662	-0.3515	3.577	0.1371	1.3887	-0.0882	-1.3142	-0.0764	-0.3372	0.3355	0.6459	-0.1386	1.1069	-0.0323	0.0602	2.4072	-0.3157	1.0795	-12.936	-25.9429	-16.1459
10	3.7094	-1.1715	-0.0251	2.0366	-1.1719	3.2266	0.0237	1.3259	0.0145	-0.0216	-0.647	-0.4314	-0.1325	0.3184	0.4746	0.7341	-0.1006	0.0396	1.3581	0.2217	0.7292	-44.1188	-6.6884	5.1026
11	1.4745	0.7001	0.3051	2.0875	1.1095	1.7597	-0.1005	0.9555	0.4663	-0.3184	0.2425	-0.0947	-0.3797	0.2789	-0.1167	0.6352	-0.1817	0.0273	1.1946	0.3606	0.7993	-23.6236	8.1231	8.4334
12	2.0723	1.1018	0.6007	2.0361	-0.8605	1.1885	-0.2688	0.7376	0.7944	-0.386	0.1156	0.298	-0.1697	-0.0813	-0.0444	0.8508	-0.1768	-0.068	1.4007	0.4001	0.9026	-56.9108	1.8707	0.9477
13	2.2795	0.9988	-1.2344	3.5972	-1.5102	2.394	0.2519	-0.2089	0.6933	-0.3665	-0.1539	-0.1019	-0.3479	-0.0069	0.0104	1.087	0.0175	-0.3098	0.8454	0.2858	1.593	-46.7541	45.3514	28.2191
14	1.5633	-0.3984	-0.1035	2.3877	1.2457	1.1873	-0.0637	-0.106	0.1823	0.1782	-0.0315	0.5182	0.1781	-0.2076	0.1155	0.787	-0.0266	0.0623	0.7068	0.3424	1.1808	-46.2898	23.0665	42.3976
15	1.2962	-0.2136	0.234	2.0331	-0.5876	2.1346	-0.0313	0.7294	0.67	-0.662	-0.3227	0.4782	-0.6651	-0.2003	0.2588	1.1581	0.0954	-0.3679	1.1376	0.333	1.7557	-56.4992	41.3947	15.0875
16	2.7304	-0.6878	-1.2788	1.1882	-0.4812	3.7314	-0.7106	-0.7561	-0.0703	-0.2052	0.3729	0.2431	-0.0313	0.3578	0.3681	1.1981	0.005	0.0846	1.6285	-0.1381	2.106	-54.3193	43.7395	57.5214
17	2.8463	0.2421	1.344	1.265	0.1416	2.3065	-0.1311	0.0929	0.6449	-0.0101	0.0116	0.3466	-0.4467	-0.0574	0.101	0.8212	-0.0099	0.0305	0.5528	0.1926	1.0927	-29.4105	45.98	48.625
18	2.8501	0.2372	-0.6773	0.9796	0.2196	0.8744	0.194	-0.9861	0.9591	0.6904	-0.1568	0.6284	-0.1834	-0.7096	-0.0574	1.3364	-0.0644	0.2955	1.719	-0.2417	2.1361	-56.2776	57.0461	67.7588
19	4.8682	-0.7378	0.3593	3.7845	0.2246	4.2514	-1.0782	-0.4231	0.8709	-0.0613	-0.1544	0.6834	-0.8634	0.0092	1.212	1.5585	0.5294	-0.4092	1.1147	-0.1816	1.891	-9.0115	56.2757	91.9793
20	2.7477	-0.1851	0.6314	2.8389	0.9522	3.0886	-0.3407	-0.6289	0.2421	0.855	0.5366	0.3622	0.0086	-0.503	-0.2374	1.2016	0.2483	0.1747	0.6926	0.0795	0.9574	-17.8958	32.8051	88.8092
21	2.0835	1.2445	0.1392	2.0732	0.7974	0.9629	-0.5191	-0.4747	2.0218	-0.0044	0.2527	1.1394	-0.7043	0.1353	0.3539	1.8924	0.3263	-0.2179	1.3094	-0.2751	2.523	-19.8502	67.2911	92.9865
22	2.8019	3.0036	-1.1367	4.595	-1.8851	3.8091	0.0797	-0.3361	0.7845	0.417	0.7206	0.5617	0.1803	-0.3661	-0.7745	1.9053	0.8132	-0.2294	1.4271	-0.2584	1.1473	-0.7664	33.0874	109.3082
23	2.6361	-0.4193	-0.5671	1.9345	1.3679	2.5915	-0.4515	-0.1085	0.8954	0.6397	0.4057	-0.2656	-0.4792	0.2708	0.0489	1.2246	0.1084	-0.2104	0.5966	-0.0981	1.0083	10.9047	37.4259	86.1352
24	1.4076	0.6931	-0.3357	1.0287	-0.8955	2.5336	-0.0898	-0.8119	0.2053	0.8562	0.3339	0.0473	-0.7381	0.0022	-0.1528	2.3419	0.6623	-0.2289	1.257	-0.2836	1.1507	12.1844	31.9963	120.2965
25	3.0461	0.0318	-1.2521	2.262	0.0124	3.2537	-0.8622	-0.8659	0.7581	0.7362	0.4911	-0.7029	0.6	-0.0508	0.2345	1.23	0.2217	-0.1835	1.3916	-0.3445	0.8183	47.9714	6.6145	91.1922
26	4.4732	-0.6048	0.506	1.7468	0.003	1.7502	-0.1339	-1.1264	-0.0326	0.5621	0.0863	0.2179	-0.0952	-0.2015	0.0539	1.1429	0.1499	0.0564	0.6927	-0.0089	0.4563	23.6312	-4.0301	90.6249
27	2.908	0.7882	0.0989	0.6166	0.2885	0.952	-0.0892	-1.4482	1.2402	0.6965	0.1743	-0.307	-0.6168	0.6975	0.0174	1.7273	0.0984	-0.247	1.7162	-0.5442	1.3313	48.5961	14.1431	106.3867
28	3.7708	1.8493	0.0542	3.3627	-1.5149	2.1768	0.5531	-0.8502	0.4496	0.3842	-0.2267	0.216	0.3361	-0.022	-0.2126	1.1896	0.262	-0.0414	0.7825	-0.0609	0.6317	42.4111	-22.9035	87.1029
29	3.276	0.0614	0.718	1.189	0.3046	3.3117	-0.1488	0.0861	0.3601	0.0349	0.0075	-0.1602	-0.4647	0.3182	0.1218	0.8459	0.0222	0.0406	0.3351	0.0403	0.4895	41.9861	-5.0591	67.785
30	1.1877	-0.3628	0.3299	1.6256	-0.8764	2.1476	-0.0992	-0.2337	-1.0341	0.3457	0.1024	-0.4569	1.2318	0.7653	0.026	1.3943	0.4386	-0.0694	1.1681	0.1315	1.2277	53.8945	-34.2262	81.9465

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	CHAIN A AND (RESSEQ 61:89)	A	61 - 89
2	X-RAY DIFFRACTION	2	CHAIN A AND (RESSEQ 90:338)	A	90 - 338
3	X-RAY DIFFRACTION	3	CHAIN A AND (RESSEQ 339:452)	A	339 - 452
4	X-RAY DIFFRACTION	4	CHAIN B AND (RESSEQ 63:89)	B	63 - 89
5	X-RAY DIFFRACTION	5	CHAIN B AND (RESSEQ 90:338)	B	90 - 338
6	X-RAY DIFFRACTION	6	CHAIN B AND (RESSEQ 339:452)	B	339 - 452
7	X-RAY DIFFRACTION	7	CHAIN C AND (RESSEQ 61:89)	C	61 - 89
8	X-RAY DIFFRACTION	8	CHAIN C AND (RESSEQ 90:338)	C	90 - 338
9	X-RAY DIFFRACTION	9	CHAIN C AND (RESSEQ 339:452)	C	339 - 452
10	X-RAY DIFFRACTION	10	CHAIN D AND (RESSEQ 63:89)	D	63 - 89
11	X-RAY DIFFRACTION	11	CHAIN D AND (RESSEQ 90:338)	D	90 - 338
12	X-RAY DIFFRACTION	12	CHAIN D AND (RESSEQ 339:452)	D	339 - 452
13	X-RAY DIFFRACTION	13	CHAIN E AND (RESSEQ 61:89)	E	61 - 89
14	X-RAY DIFFRACTION	14	CHAIN E AND (RESSEQ 90:338)	E	90 - 338
15	X-RAY DIFFRACTION	15	CHAIN E AND (RESSEQ 339:452)	E	339 - 452
16	X-RAY DIFFRACTION	16	CHAIN F AND (RESSEQ 61:89)	F	61 - 89
17	X-RAY DIFFRACTION	17	CHAIN F AND (RESSEQ 90:338)	F	90 - 338
18	X-RAY DIFFRACTION	18	CHAIN F AND (RESSEQ 339:452)	F	339 - 452
19	X-RAY DIFFRACTION	19	CHAIN G AND (RESSEQ 64:89)	G	64 - 89
20	X-RAY DIFFRACTION	20	CHAIN G AND (RESSEQ 90:338)	G	90 - 338
21	X-RAY DIFFRACTION	21	CHAIN G AND (RESSEQ 339:452)	G	339 - 452
22	X-RAY DIFFRACTION	22	CHAIN H AND (RESSEQ 61:89)	H	61 - 89
23	X-RAY DIFFRACTION	23	CHAIN H AND (RESSEQ 90:338)	H	90 - 338
24	X-RAY DIFFRACTION	24	CHAIN H AND (RESSEQ 339:452)	H	339 - 452
25	X-RAY DIFFRACTION	25	CHAIN I AND (RESSEQ 61:89)	I	61 - 89
26	X-RAY DIFFRACTION	26	CHAIN I AND (RESSEQ 90:338)	I	90 - 338
27	X-RAY DIFFRACTION	27	CHAIN I AND (RESSEQ 339:452)	I	339 - 452
28	X-RAY DIFFRACTION	28	CHAIN J AND (RESSEQ 61:89)	J	61 - 89
29	X-RAY DIFFRACTION	29	CHAIN J AND (RESSEQ 90:338)	J	90 - 338
30	X-RAY DIFFRACTION	30	CHAIN J AND (RESSEQ 339:452)	J	339 - 452

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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