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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3vtg
タイトル
High choriolytic enzyme 1 (HCE-1), a hatching enzyme zinc-protease from Oryzias latipes (Medaka fish)
要素
High choriolytic enzyme 1
キーワード
HYDROLASE / hatching enzyme / Structural Genomics / NPPSFA / National Project on Protein Structural and Functional Analyses / astacin family / zinc protease
機能・相同性
機能・相同性情報
choriolysin H / transport vesicle / metalloendopeptidase activity / zinc ion binding 類似検索 - 分子機能
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.34→20 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.957 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.949 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.5 / SU B: 0.787 / SU ML: 0.034 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.059 / ESU R Free: 0.059 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT U VALUES: REFINED INDIVIDUALLY
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2036
2255
5 %
RANDOM
Rwork
0.1871
-
-
-
obs
0.1879
44691
99.37 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK