- PDB-3vpb: ArgX from Sulfolobus tokodaii complexed with LysW/Glu/ADP/Mg/Zn/S... -
+
データを開く
IDまたはキーワード:
読み込み中...
-
基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3vpb
タイトル
ArgX from Sulfolobus tokodaii complexed with LysW/Glu/ADP/Mg/Zn/Sulfate
要素
Alpha-aminoadipate carrier protein lysW
Putative acetylornithine deacetylase
キーワード
LIGASE / ATP-dependent amine/thiol ligase family / ATP-dependent amine/thiol ligase / LysW / Enzyme-Carrier protein complex
機能・相同性
機能・相同性情報
lysine biosynthetic process / 合成酵素; C-N結合を形成; 酸-D-アミノ酸リガーゼ(ペプチド合成) / lysine biosynthetic process via aminoadipic acid / arginine biosynthetic process / ligase activity / protein modification process / ATP binding / identical protein binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能
解像度: 1.8→28.91 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.957 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.933 / SU B: 2.958 / SU ML: 0.094 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / ESU R: 0.144 / ESU R Free: 0.139 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.23505
5608
5 %
RANDOM
Rwork
0.1869
-
-
-
obs
0.18931
106366
99.67 %
-
all
-
106366
-
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK