PDB-3ve2: The 2.1 angstrom crystal structure of Transferrin binding protein...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3ve2

タイトル

The 2.1 angstrom crystal structure of Transferrin binding protein B (TbpB) from serogroup B M982 Neisseria meningitidis

要素

Transferrin-binding protein 2

キーワード

Transferrin-binding protein / Lipoprotein / transferrin receptor / iron acquisition / vaccine candidate / host pathogen interaction / Beta barrel / Receptor / Transferrin / Outermembrane

機能・相同性

機能・相同性情報

cell outer membrane / cell surface
類似検索 - 分子機能

生物種

Neisseria meningitidis serogroup B (髄膜炎菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.14 Å

データ登録者

Calmettes, C. / Moraes, T.F.

引用

ジャーナル: Nat.Struct.Mol.Biol. / 年: 2012
タイトル: The structural basis of transferrin sequestration by transferrin-binding protein B.
著者: Calmettes, C. / Alcantara, J. / Yu, R.H. / Schryvers, A.B. / Moraes, T.F.

履歴

登録	2012年1月6日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2012年2月22日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2012年9月5日	Group: Database references
改定 1.2	2024年11月6日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / struct_ncs_dom_lim / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3ve2.cif.gz	444.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3ve2.ent.gz	361.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3ve2.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ve/3ve2 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ve/3ve2	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3ve1C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3gbm-d 2odf-d 22856 5ux5-d 5v1x-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#35 - 2002年11月フェリチンとトランスフェリン (Ferritin and Transferrin) 類似性 (1) #244 - 2020年4月光合成超複合体 (Photosynthetic Supercomplexes) 類似性 (1) #59 - 2004年11月光化学系II (Photosystem II) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Transferrin-binding protein 2

B: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

145 kDa, 2 ポリマー
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1

B: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

B: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

A: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

A: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
289 kDa, 4 ポリマー
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2

B: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

B: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

A: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

A: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

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3

B: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

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4

A: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

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72.1 kDa, 1 ポリマー
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5

B: Transferrin-binding protein 2

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
72.5 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	46.604, 149.336, 199.600
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	17
Space group name H-M	P222₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B

NCSドメイン領域:

Ens-ID: 1

Dom-ID	Component-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	GLN	GLN	PRO	PRO	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	38 - 107	5 - 74
1	2	GLN	GLN	ASP	ASP	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	121 - 149	88 - 116
1	3	LYS	LYS	SER	SER	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	153 - 263	120 - 230
1	4	LYS	LYS	ASN	ASN	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	272 - 287	239 - 254
1	5	PHE	PHE	THR	THR	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	289 - 296	256 - 263
1	6	THR	THR	ASP	ASP	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	303 - 348	270 - 315
1	7	LYS	LYS	PRO	PRO	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	377 - 417	344 - 384
1	8	GLU	GLU	GLU	GLU	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	436 - 446	403 - 413
1	9	THR	THR	LYS	LYS	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	475 - 498	442 - 465
1	10	VAL	VAL	ASN	ASN	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	520 - 554	487 - 521
1	11	THR	THR	ASN	ASN	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	556 - 569	523 - 536
1	12	ALA	ALA	ALA	ALA	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	571 - 588	538 - 555
1	13	ALA	ALA	GLN	GLN	chain A and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	A	A	675 - 687	642 - 654
2	1	GLN	GLN	PRO	PRO	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	38 - 107	5 - 74
2	2	GLN	GLN	ASP	ASP	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	121 - 149	88 - 116
2	3	LYS	LYS	SER	SER	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	153 - 263	120 - 230
2	4	LYS	LYS	ASN	ASN	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	272 - 287	239 - 254
2	5	PHE	PHE	THR	THR	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	289 - 296	256 - 263
2	6	THR	THR	ASP	ASP	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	303 - 348	270 - 315
2	7	LYS	LYS	PRO	PRO	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	377 - 417	344 - 384
2	8	GLU	GLU	GLU	GLU	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	436 - 446	403 - 413
2	9	THR	THR	LYS	LYS	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	475 - 498	442 - 465
2	10	VAL	VAL	ASN	ASN	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	520 - 554	487 - 521
2	11	THR	THR	ASN	ASN	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	556 - 569	523 - 536
2	12	ALA	ALA	ALA	ALA	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	571 - 588	538 - 555
2	13	ALA	ALA	GLN	GLN	chain B and (resseq 38:107 or resseq 121:149 or resseq...	B	B	675 - 687	642 - 654

NCS oper: (Code: given
Matrix: (-0.946295, -0.012595, -0.32306), (0.041559, -0.99569, -0.082913), (-0.320623, -0.091886, 0.942739)
ベクター: 60.854, -34.257301, 8.6033)

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AB

#1: タンパク質	Transferrin-binding protein 2 / TBP-2 分子量: 71406.695 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Neisseria meningitidis serogroup B (髄膜炎菌) 株: M982 / 遺伝子: tbpB, tbp2 / プラスミド: pET / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q09057

-
非ポリマー , 5種, 638分子

#2: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 11 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#3: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 化合物	ChemComp-ACT / ACETATE ION / 酢酸イオン分子量: 59.044 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₃O₂
#5: 化合物	ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン分子量: 22.990 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 618 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.43 Å³/Da / 溶媒含有率: 49.42 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 4.5 詳細: 0.1M sodium citrate pH 4.5, 1.85M Ammonium sulfate, vapor diffusion, hanging drop, temperature 20K, temperature 293K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 24-ID-E / 波長: 0.9795 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2011年6月26日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9795 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.1→50 Å / Num. obs: 76520 / % possible obs: 93.4 % / 冗長度: 2.9 % / R_merge(I) obs: 0.073 / Χ²: 0.981 / Net I/σ(I): 8.5

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique all	Χ²	Diffraction-ID	% possible all
2.1-2.18	2.7	0.646	7611	0.799	1	95
2.18-2.26	2.7	0.507	7688	0.798	1	95.1
2.26-2.37	2.7	0.394	7713	0.76	1	95.4
2.37-2.49	2.8	0.299	7686	0.754	1	95.1
2.49-2.65	2.8	0.208	7713	0.786	1	95.1
2.65-2.85	2.9	0.146	7687	0.87	1	94.4
2.85-3.14	2.9	0.082	7709	0.926	1	94.1
3.14-3.59	3	0.057	7652	1.261	1	93.1
3.59-4.52	3	0.047	7543	1.905	1	91.2
4.52-50	3.1	0.024	7518	0.823	1	86.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PHENIX	1.7.1_743	精密化
PDB_EXTRACT	3.1	データ抽出
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.14→45.383 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.3 / FOM work R set: 0.8782 / SU ML: 0.68 / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 19.29 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2091	1919	2.63 %
R_work	0.1713	-	-
obs	0.1723	72950	93.36 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.83 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 73.755 Å² / k_sol: 0.376 e/Å³

原子変位パラメータ

B_iso max: 207.75 Å² / B_iso mean: 60.5452 Å² / B_iso min: 9.96 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	2.5036 Å²	-0 Å²	0 Å²
2-	-	-7.4843 Å²	-0 Å²
3-	-	-	4.9807 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.14→45.383 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	8122	0	106	618	8846

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.008	8403
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.105	11280
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.083	1158
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	1463
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.373	3098

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
1	1	A	3420	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.066
1	2	B	3420	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.066

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 14

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.14-2.1935	0.2762	101	0.2523	5086	5187	95
2.1935-2.2528	0.2714	202	0.2279	5034	5236	95
2.2528-2.3191	0.2535	101	0.2231	5178	5279	95
2.3191-2.394	0.2702	101	0.2148	5116	5217	95
2.394-2.4795	0.2792	202	0.2057	5059	5261	95
2.4795-2.5788	0.2193	101	0.186	5159	5260	95
2.5788-2.6961	0.2165	190	0.172	5049	5239	95
2.6961-2.8383	0.2043	113	0.1646	5107	5220	94
2.8383-3.0161	0.2205	101	0.1527	5139	5240	94
3.0161-3.2489	0.2155	202	0.168	5017	5219	94
3.2489-3.5757	0.1708	101	0.1561	5116	5217	93
3.5757-4.0928	0.1952	101	0.147	5043	5144	92
4.0928-5.1554	0.1673	202	0.1405	4942	5144	90
5.1554-45.3935	0.2187	101	0.1849	4986	5087	85

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.3022	-0.1506	0.2938	1.6404	1.3464	2.7474	-0.0341	0.0053	-0.3477	0.0971	0.0335	0.0889	0.2605	0.1107	-0.0046	0.1118	-0.0131	0.0393	0.2534	-0.0238	0.1632	30.2619	-34.8429	35.6523
2	3.0332	1.3306	0.3567	3.497	-4.4939	8.3679	0.28	-0.1811	0.3072	0.6966	-0.2137	0.5193	-0.5839	-0.854	-0.0713	0.2746	0.0163	0.0304	0.4045	-0.1535	0.2428	27.4146	-27.8816	18.6977
3	0.9416	-0.1502	-0.2132	0.7827	0.1661	1.2912	-0.0072	0.1992	-0.2515	-0.2699	0.0389	-0.0763	0.0496	0.0709	0.0715	0.1178	-0.0362	0.0566	0.357	-0.1152	0.1417	37.7794	-32.1828	24.0262
4	1.2001	0.1312	1.5198	2.8817	-3.8423	7.528	0.0572	0.9347	1.4334	-1.3266	-0.2183	-2.1349	-0.8797	1.903	0.134	0.5001	-0.2151	0.1833	0.6606	-0.0039	0.7949	48.0363	-19.4507	14.1804
5	0.8982	-0.8198	-0.6738	1.1935	0.1192	2.1531	-0.0708	0.047	-0.135	-0.0795	0.0793	-0.1785	0.132	0.3564	-0.1771	0.1469	0.0488	0.0859	0.2873	-0.1838	0.2493	45.2522	-40.1202	23.2039
6	1.3388	1.7708	-0.7856	3.5681	-1.8966	4.2225	0.1058	0.0674	-0.4091	0.2968	-0.0694	0.4078	0.4954	-0.2587	-0.014	0.4276	-0.0813	0.0423	0.251	-0.2489	0.8062	26.2555	-61.2006	21.3834
7	0.0445	0.0214	-0.0313	0.7826	0.3768	0.4012	-0.0095	0.0686	-0.4399	0.3674	0.0767	0.437	0.2182	-0.0909	0.33	0.5417	0.0045	0.2542	0.287	-0.1906	1.3025	26.232	-75.4718	18.5336
8	0.275	1.0461	0.8697	6.0632	1.1767	4.9352	0.2251	0.1495	-0.1736	-0.0674	-0.3906	0.2801	0.4798	0.0354	0.1298	0.4677	0.0006	0.2331	0.3181	-0.1695	1.182	25.825	-76.2663	15.8984
9	0.9597	0.0917	-0.9323	1.8716	-1.0581	2.525	0.0259	0.0598	0.1294	0.1819	-0.0324	-0.0946	-0.2805	-0.0295	-0.0237	0.1332	-0.0254	-0.0093	0.2161	0.003	0.0739	20.9203	-1.7785	34.5397
10	3.9771	-0.4219	-3.6094	2.9931	-3.3508	8.0037	-0.2101	0.4977	-0.7585	-0.2261	0.1884	0.0662	0.8293	-0.3982	-0.0015	0.2774	-0.0645	-0.0853	0.7428	0.0213	0.5762	32.1353	-11.5759	24.8574
11	0.5442	-0.0916	-0.0327	0.6267	-0.2727	1.2773	0.0099	0.0913	0.1158	-0.1813	0.0054	-0.04	-0.0637	-0.0253	-0.0035	0.1392	-0.0139	0.0026	0.2554	0.0352	0.0622	17.0954	-3.3297	21.7125
12	0.5903	-0.7172	-0.729	2	3.9766	1.9377	0.3937	0.6416	-0.1716	-1.8186	-0.4327	2.226	-0.4473	-1.5743	0.055	0.4729	0.1305	-0.1249	0.6331	0.073	0.5158	10.1117	-15.2092	5.3474
13	0.8099	-0.3576	0.054	1.8435	-0.2685	2.8912	-0.0567	0.0941	0.102	-0.0874	0.0593	0.1745	-0.1656	-0.3295	-0.126	0.176	0.0617	-0.0085	0.2565	0.0914	0.0329	10.6429	5.1545	18.8557
14	4.4513	1.0715	1.4789	5.114	1.595	6.2731	0.1599	-0.1119	0.6746	0.4914	-0.0602	-0.5419	-0.4281	0.5038	-0.1435	0.4789	-0.1267	0.017	0.2025	0.0301	0.4832	28.6326	26.5026	25.7891
15	0.3279	0.1657	0.1321	0.6443	0.2383	0.7285	0.0382	0.0581	0.5156	0.0279	0.0469	-0.1739	-0.4915	0.14	0.2253	0.8306	-0.0965	-0.0207	0.1892	0.0178	0.8638	26.7485	39.8875	25.1956
16	1.4641	1.9975	0.1614	5.6208	0.6284	2.062	0.1254	-0.0177	-0.0229	0.0583	0.0569	-0.6254	-0.4069	0.2786	-0.0171	0.5697	-0.0881	0.0833	0.2266	0.1158	0.927	31.2781	42.6218	21.4133

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(chain A and resid 38:101)	A	38 - 101
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(chain A and resid 102:123)	A	102 - 123
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(chain A and resid 124:260)	A	124 - 260
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(chain A and resid 261:272)	A	261 - 272
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(chain A and resid 273:346)	A	273 - 346
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(chain A and resid 347:438)	A	347 - 438
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(chain A and resid 439:649)	A	439 - 649
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(chain A and resid 650:689)	A	650 - 689
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(chain B and resid 38:106)	B	38 - 106
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(chain B and resid 107:121)	B	107 - 121
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(chain B and resid 122:262)	B	122 - 262
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(chain B and resid 263:273)	B	263 - 273
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(chain B and resid 274:376)	B	274 - 376
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(chain B and resid 377:417)	B	377 - 417
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(chain B and resid 436:615)	B	436 - 615
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(chain B and resid 616:687)	B	616 - 687

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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