登録情報 データベース : PDB / ID : 3spd 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of aprataxin ortholog Hnt3 in complex with DNA 要素Aprataxin-like protein DNA (5'-D(*GP*TP*CP*AP*CP*TP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*AP*TP*GP*AP*G)-3')DNA (5'-D(*TP*AP*TP*TP*CP*CP*GP*AP*TP*AP*GP*TP*GP*AP*C)-3') 詳細キーワード HYDROLASE/DNA / HIT domain / Zinc Finger / DNA deadenylase / DNA Binding / HYDROLASE-DNA complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
guanosine binding / adenosine-5'-diphospho-5'-[DNA] diphosphatase / DNA-3'-diphospho-5'-guanosine diphosphatase / DNA-3'-diphospho-5'-guanosine diphosphatase / DNA 5'-adenosine monophosphate hydrolase activity / GMP binding / single-strand break-containing DNA binding / single strand break repair / mismatched DNA binding / mismatch repair ... guanosine binding / adenosine-5'-diphospho-5'-[DNA] diphosphatase / DNA-3'-diphospho-5'-guanosine diphosphatase / DNA-3'-diphospho-5'-guanosine diphosphatase / DNA 5'-adenosine monophosphate hydrolase activity / GMP binding / single-strand break-containing DNA binding / single strand break repair / mismatched DNA binding / mismatch repair / double-stranded RNA binding / single-stranded DNA binding / double-stranded DNA binding / zinc ion binding / nucleus / cytosol 類似検索 - 分子機能 Aprataxin, C2HE/C2H2/C2HC zinc finger / C2HE / C2H2 / C2HC zinc-binding finger / HIT domain / HIT-like domain / HIT-like / HIT family, subunit A / HIT-like superfamily / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Schizosaccharomyces pombe (分裂酵母)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.912 Å 詳細データ登録者 Gong, Y. / Zhu, D. / Ding, J. / Dou, C. / Ren, X. / Jiang, T. / Wang, D. 引用ジャーナル : Nat.Struct.Mol.Biol. / 年 : 2011タイトル : Crystal structures of aprataxin ortholog Hnt3 reveal the mechanism for reversal of 5'-adenylated DNA著者 : Gong, Y. / Zhu, D. / Ding, J. / Dou, C. / Ren, X. / Gu, L. / Jiang, T. / Wang, D. 履歴 登録 2011年7月1日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2011年10月12日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2013年7月3日 Group : Database references改定 1.2 2023年11月1日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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