登録情報 データベース : PDB / ID : 3sng 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル X-ray structure of fully glycosylated bifunctional nuclease TBN1 from Solanum lycopersicum (Tomato) 要素nuclease 詳細 キーワード HYDROLASE / mainly alpha helical / trinuclear metal centre / bi-functional / endonuclease / 3'-nucleotidase / nucleic acids / mononucleotides / cytosol membrane associated機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
Aspergillus nuclease S1 / single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity / DNA catabolic process / RNA endonuclease activity / nucleic acid binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 S1/P1 nuclease / S1/P1 Nuclease / P1 Nuclease / P1 Nuclease / Phospholipase C/P1 nuclease domain superfamily / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Solanum lycopersicum (トマト)手法 X線回折 / シンクロトロン / Combination of MAD , 分子置換 / 解像度 : 2.16 Å 詳細データ登録者 Koval, T. / Stepankova, A. / Lipovova, P. / Podzimek, T. / Matousek, J. / Duskova, J. / Skalova, T. / Hasek, J. / Dohnalek, J. 引用ジャーナル : Acta Crystallogr.,Sect.D / 年 : 2013タイトル : Plant multifunctional nuclease TBN1 with unexpected phospholipase activity: structural study and reaction-mechanism analysis.著者 : Koval, T. / Lipovova, P. / Podzimek, T. / Matousek, J. / Duskova, J. / Skalova, T. / Stepankova, A. / Hasek, J. / Dohnalek, J. 履歴 登録 2011年6月29日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2012年7月4日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2013年2月20日 Group : Database references改定 1.2 2017年11月8日 Group : Refinement description / カテゴリ : software改定 1.3 2018年1月31日 Group : Database references / カテゴリ : citation_author / Item : _citation_author.name改定 2.0 2020年7月29日 Group : Atomic model / Data collection ... Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_special_symmetry / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_struct_special_symmetry.label_asym_id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2023年9月13日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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