PDB-3sja: Crystal structure of S. cerevisiae Get3 in the open state in comp...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3sja

タイトル

Crystal structure of S. cerevisiae Get3 in the open state in complex with Get1 cytosolic domain

要素

ATPase GET3
Golgi to ER traffic protein 1

キーワード

HYDROLASE/TRANSPORT PROTEIN / Coiled-coil / receptor complex / TA-protein biogenesis / GET pathway / HYDROLASE-TRANSPORT PROTEIN complex

機能・相同性

機能・相同性情報

establishment of protein localization to endoplasmic reticulum membrane / GET complex / pheromone-dependent signal transduction involved in conjugation with cellular fusion / tail-anchored membrane protein insertion into ER membrane / 加水分解酵素; 酸無水物に作用 / protein insertion into ER membrane / post-translational protein targeting to endoplasmic reticulum membrane / retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum / response to arsenic-containing substance / response to metal ion ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3 Å

データ登録者

Reitz, S. / Wild, K. / Sinning, I.

引用

ジャーナル: Science / 年: 2011
タイトル: Structural basis for tail-anchored membrane protein biogenesis by the Get3-receptor complex.
著者: Stefer, S. / Reitz, S. / Wang, F. / Wild, K. / Pang, Y.Y. / Schwarz, D. / Bomke, J. / Hein, C. / Lohr, F. / Bernhard, F. / Denic, V. / Dotsch, V. / Sinning, I.

履歴

登録	2011年6月21日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2011年7月6日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Version format compliance
改定 1.2	2011年12月14日	Group: Database references
改定 1.3	2014年5月14日	Group: Refinement description
改定 1.4	2024年2月28日	Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3sja.cif.gz	801 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3sja.ent.gz	670.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3sja.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3sja_validation.pdf.gz	515.4 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3sja_full_validation.pdf.gz	557.5 KB	表示
XML形式データ	3sja_validation.xml.gz	68.7 KB	表示
CIF形式データ	3sja_validation.cif.gz	92.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sj/3sja ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sj/3sja	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	3sjbC 3sjcC 3sjdC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6k8w-d 6k8v-d 3k5l-d 6q4t-d 3own-3 3m1r-2 5ayc-1 1xvl-d 5dbk-d 3k59-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: ATPase GET3

B: ATPase GET3

C: Golgi to ER traffic protein 1

D: Golgi to ER traffic protein 1

E: ATPase GET3

F: ATPase GET3

G: Golgi to ER traffic protein 1

H: Golgi to ER traffic protein 1

I: ATPase GET3

J: Golgi to ER traffic protein 1

ヘテロ分子

243 kDa, 10 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: ATPase GET3

B: ATPase GET3

C: Golgi to ER traffic protein 1

D: Golgi to ER traffic protein 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
97.2 kDa, 4 ポリマー
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2

E: ATPase GET3

F: ATPase GET3

G: Golgi to ER traffic protein 1

H: Golgi to ER traffic protein 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
97 kDa, 4 ポリマー
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3

I: ATPase GET3

J: Golgi to ER traffic protein 1

ヘテロ分子

I: ATPase GET3

J: Golgi to ER traffic protein 1

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
97 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	204.120, 91.460, 149.180
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	18
Space group name H-M	P2₁2₁2

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	I-363- ZN

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID
1	1
2	1
1	2
2	2
1	3
2	3
3	3
4	3
5	3

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Selection details
1	1	1	chain F and (resseq 5:105 or resseq 116:280 or resseq 285:353 )
2	1	1	chain I and (resseq 5:105 or resseq 116:280 or resseq 285:353 )
1	1	2	chain B and (resseq 5:105 or resseq 117:280 or resseq 285:353 )
2	1	2	chain E and (resseq 5:105 or resseq 117:280 or resseq 285:353 )
1	1	3	chain C and (resseq 18:78 )
2	1	3	chain D and (resseq 18:78 )
3	1	3	chain G and (resseq 18:78 )
4	1	3	chain H and (resseq 18:78 )
5	1	3	chain J and (resseq 18:78 )

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3

#1: タンパク質	ATPase GET3 分子量: 40464.730 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) 株: ATCC 204508 / S288c / 遺伝子: GET3, ARR4, YDL100C, D2371 / プラスミド: pET24d / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) 参照: UniProt: Q12154, 加水分解酵素; 酸無水物に作用
#2: タンパク質	Golgi to ER traffic protein 1 分子量: 7896.763 Da / 分子数: 5 / Fragment: Get1 cytosolic domain from residue 36 to 93 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) 株: ATCC 204508 / S288c / 遺伝子: GET1, MDM39, YGL020C / プラスミド: pET24d / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: P53192
#3: 化合物	ChemComp-ZN / ZINC ION 分子量: 65.409 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#4: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION / ホスファ-ト分子量: 94.971 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.88 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.28 %
結晶化	温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8 詳細: 1 M LiCl, 20% PEG 6000, 0.1 M Tris/HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID14-4 / 波長: 0.9395 Å
検出器	日付: 2004年11月27日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9395 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3→51.3 Å / Num. obs: 56397 / % possible obs: 99.7 % / Observed criterion σ(F): 2.7 / Observed criterion σ(I): 2.7 / 冗長度: 5.7 % / R_sym value: 0.123 / Net I/σ(I): 8.6
反射シェル	解像度: 3→3.16 Å / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
ADSC	Quantum	データ収集
PHASER		位相決定
PHENIX	(phenix.refine: 1.6_289)	精密化
MOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 3→51.3 Å / SU ML: 0.47 / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 22.19 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2314	2857	5.07 %	random
R_work	0.1808	-	-	-
obs	0.1834	56397	99.43 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 49.981 Å² / k_sol: 0.306 e/Å³

原子変位パラメータ

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.3516 Å²	-0 Å²	0 Å²
2-	-	-0.8108 Å²	-0 Å²
3-	-	-	1.1624 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3→51.3 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	15830	0	38	5	15873

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.011	16119
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.157	21699
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	19.501	6044
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.073	2429
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	2813

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
1	1	F	2611	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL
1	2	I	2611	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.043
2	1	B	2603	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL
2	2	E	2603	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.05
3	1	C	515	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL
3	2	D	515	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.036
3	3	G	515	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.037
3	4	H	515	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.038
3	5	J	515	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.037

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
3-3.1072	0.3197	269	0.2529	5328	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1072-3.2316	0.3026	287	0.2234	5279	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2316-3.3786	0.2701	290	0.1941	5319	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3786-3.5567	0.2314	318	0.1722	5287	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5567-3.7795	0.2292	269	0.1615	5347	X-RAY DIFFRACTION	100
3.7795-4.0712	0.211	265	0.1491	5375	X-RAY DIFFRACTION	100
4.0712-4.4807	0.1848	310	0.1441	5334	X-RAY DIFFRACTION	100
4.4807-5.1286	0.1822	284	0.1345	5413	X-RAY DIFFRACTION	100
5.1286-6.4594	0.2283	275	0.1722	5427	X-RAY DIFFRACTION	100
6.4594-51.2733	0.2325	290	0.1987	5431	X-RAY DIFFRACTION	96

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.8009	-0.8466	0.3993	2.4919	0.5395	2.2558	-0.0633	-0.043	0.2275	0.0729	0.1048	-0.0063	-0.0082	0.2602	-0.0488	0.0711	-0.07	-0.0105	0.0723	-0.023	0.0888	52.0835	8.3835	-17.875
2	0.509	0.7061	0.4936	0.2248	-0.7887	0.2731	-0.0336	-0.0461	-0.1789	-0.0171	-0.01	0.1022	-0.1818	0.0588	-0.0464	0.176	0.0649	0.0515	0.1259	-0.0641	0.5114	18.2156	8.5786	-13.61
3	1.8447	-0.2858	0.6303	2.4372	0.6693	1.0412	-0.0903	-0.0254	-0.0281	0.0689	0.1192	-0.1167	0.0097	0.1645	0.0109	0.1672	0.0909	-0.0135	0.1685	0.0579	-0.0088	53.8562	-25.845	-22.4941
4	0.8006	-0.508	0.0835	1.4081	-1.198	0.4883	0.0465	0.0598	-0.3417	-0.2384	-0.0396	0.5204	0.0611	0.0464	-0.0065	0.4609	0.0575	-0.2265	0.1149	-0.0094	0.3453	28.6711	-26.6079	-45.6289
5	2.0983	-0.2392	-0.3363	1.3028	0.2342	0.9626	0.1002	0.4403	0.1919	0.3456	-0.3626	0.7002	0.2191	-0.1054	0.3065	0.1333	0.0188	0.0997	0.1517	-0.0619	0.4767	22.5314	-11.9157	-10.2541
6	0.2451	-0.2775	0.0834	0.1043	-0.2403	0.927	0.3218	0.2166	-0.4484	-0.3113	-0.1702	0.3771	-0.2169	0.0297	0.0285	0.4819	0.1456	-0.2439	0.2569	-0.0293	0.4403	33.7285	-6.0096	-45.8986
7	1.8147	-0.8359	0.1697	2.8386	-0.3748	1.227	-0.205	-0.4486	-0.0628	0.0741	0.3124	0.0867	-0.2751	-0.1065	-0.0497	0.2273	0.0794	0.0272	0.3157	0.0584	0.1111	67.6417	-0.5748	-68.6044
8	0.6116	-0.1337	-0.2193	0.4497	1.6193	1.1746	0.0258	-0.0456	0.0325	-0.5472	0.057	-0.1586	-0.6185	-0.0363	-0.0753	0.8194	-0.0968	0.0885	0.1817	0.0361	0.242	73.6893	-0.4774	-102.0993
9	1.4995	-0.6883	-0.2314	2.298	-0.0676	2.361	-0.1365	-0.1246	-0.3046	0.053	0.1939	0.042	0.0166	-0.072	0.0242	0.0206	-0.0008	0.0466	0.2405	0.222	0.2696	71.6188	-34.743	-65.2833
10	1.4096	0.8775	-0.5158	1.4098	-0.3071	1.0415	-0.0066	-0.1314	-0.0962	-0.2214	0.1144	-0.2201	0.17	0.0532	-0.0743	0.2456	-0.0054	0.1511	0.2688	-0.0231	0.5585	101.3838	-35.7619	-82.1121
11	0.5719	-0.1583	-0.1038	0.8403	-0.3623	1.2784	0.3377	-0.1935	-0.2513	-0.6252	-0.1803	-0.1562	-0.6171	0.0638	-0.2509	0.5959	-0.0123	0.0913	0.1631	0.0376	0.1758	69.2972	-21.0416	-98.9774
12	1.6383	-0.3108	0.3725	0.5778	-0.6046	0.3417	-0.1854	-0.5581	-0.3135	-0.1941	-0.2385	-0.8971	0.1635	0.3102	0.2614	0.3251	0.0077	0.3416	0.3589	0.1277	0.7428	100.0574	-15.1181	-77.2651
13	3.1218	-0.3265	-0.2038	4.1259	0.7344	2.1369	0.4255	0.6151	-0.1181	-1.2735	-0.4291	0.0277	-0.2739	-0.0088	-0.0289	0.469	0.2788	-0.1365	0.1815	-0.153	-0.0704	99.7635	-17.1782	-18.2385
14	0.4171	-1.2405	-0.2021	0.7427	0.1652	0.8349	0.2325	-0.0244	-0.2516	0.4292	0.0251	0.1812	0.4264	0.1127	-0.1621	0.4709	-0.0496	0.0867	0.1536	0.0129	0.2908	85.0732	-17.6107	12.6075
15	1.0622	-0.639	-0.278	0.7678	0.2997	1.1505	0.0087	0.0364	-0.1847	0.3906	-0.6683	0.4294	0.4001	-0.2077	0.1832	0.7721	-0.0533	0.1641	0.3288	-0.0587	0.3327	83.2428	2.8726	7.5836

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND ( RESID 5:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:354 ) )	A	5 - 88
2	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND ( RESID 5:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:354 ) )	A	158 - 170
3	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND ( RESID 5:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:354 ) )	A	233 - 354
4	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN A AND ( RESID 89:157 OR RESID 172:232 ) )	A	89 - 157
5	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN A AND ( RESID 89:157 OR RESID 172:232 ) )	A	172 - 232
6	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN B AND ( RESID 4:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:354 ) )	B	4 - 88
7	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN B AND ( RESID 4:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:354 ) )	B	158 - 170
8	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN B AND ( RESID 4:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:354 ) )	B	233 - 354
9	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN B AND ( RESID 89:157 OR RESID 172:232 ) )	B	89 - 157
10	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN B AND ( RESID 89:157 OR RESID 172:232 ) )	B	172 - 232
11	X-RAY DIFFRACTION	5	( CHAIN C AND RESID 35:78 )	C	35 - 78
12	X-RAY DIFFRACTION	6	( CHAIN D AND RESID 35:78 )	D	35 - 78
13	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN E AND ( RESID 5:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:353 ) )	E	5 - 88
14	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN E AND ( RESID 5:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:353 ) )	E	158 - 170
15	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN E AND ( RESID 5:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:353 ) )	E	233 - 353
16	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN E AND ( RESID 89:157 OR RESID 172:232 ) )	E	89 - 157
17	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN E AND ( RESID 89:157 OR RESID 172:232 ) )	E	172 - 232
18	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN F AND ( RESID 4:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:354 ) )	F	4 - 88
19	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN F AND ( RESID 4:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:354 ) )	F	158 - 170
20	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN F AND ( RESID 4:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:354 ) )	F	233 - 354
21	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN F AND ( RESID 89:157 OR RESID 172:232 ) )	F	89 - 157
22	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN F AND ( RESID 89:157 OR RESID 172:232 ) )	F	172 - 232
23	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN G AND RESID 35:78 )	G	35 - 78
24	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN H AND RESID 35:78 )	H	35 - 78
25	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN I AND ( RESID 5:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:353 ) )	I	5 - 88
26	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN I AND ( RESID 5:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:353 ) )	I	158 - 170
27	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN I AND ( RESID 5:88 OR RESID 158:170 OR RESID 233:353 ) )	I	233 - 353
28	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN I AND ( RESID 89:157 OR RESID 172:232 ) )	I	89 - 157
29	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN I AND ( RESID 89:157 OR RESID 172:232 ) )	I	172 - 232
30	X-RAY DIFFRACTION	15	( CHAIN J AND RESID 35:78 )	J	35 - 78

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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