+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3sgq | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | GLN 18 VARIANT OF TURKEY OVOMUCOID INHIBITOR THIRD DOMAIN COMPLEXED WITH STREPTOMYCES GRISEUS PROTEINASE B AT PH 10.7 | ||||||
![]() |
| ||||||
![]() | HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / COMPLEX (SERINE PROTEASE-INHIBITOR) / SERINE PROTEINASE / PROTEIN INHIBITOR / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | ![]() streptogrisin B / molecular function inhibitor activity / serine-type endopeptidase inhibitor activity / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Huang, K. / Lu, W. / Anderson, S. / Laskowski Jr., M. / James, M.N.G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Recruitment of a Buried K+ Ion to Stabilize the Negative Charge of Ionized P1 in the Hydrophobic Pocket: Crystal Structures of Glu18, Gln18, Asp18 and Asn18 Variants of Turkey Ovomucoid ...タイトル: Recruitment of a Buried K+ Ion to Stabilize the Negative Charge of Ionized P1 in the Hydrophobic Pocket: Crystal Structures of Glu18, Gln18, Asp18 and Asn18 Variants of Turkey Ovomucoid Inhibitor Third Domain Complexed with Streptomyces griseus Protease B at Various pH's 著者: Huang, K. / Lu, W. / Anderson, S. / Laskowski Jr., M. / James, M.N.G. #1: ![]() タイトル: Water Molecules Participates in Proteinase-Inhibitor Interactions: Crystal Structure of Leu18, Ala18 and Gly18 Variants of Turkey Ovomucoid Inhibitor Third Domain Complexed with ...タイトル: Water Molecules Participates in Proteinase-Inhibitor Interactions: Crystal Structure of Leu18, Ala18 and Gly18 Variants of Turkey Ovomucoid Inhibitor Third Domain Complexed with Streptomyces griseus Proteinase B 著者: Huang, K. / Lu, W. / Anderson, S. / Laskowski Jr., M. / James, M.N.G. #2: ![]() タイトル: Structure of the Complex of Streptomyces griseus Protease B and the Third Domain of the Turkey Ovomucoid Inhibitor at 1.8 Angstroms Resolution 著者: Read, R.J. / Fujinaga, M. / Sielecki, A.R. / James, M.N.G. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 59.7 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 41.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 387.8 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 394.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 10.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18653.232 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 株: K1 / 参照: UniProt: P00777, streptogrisin B |
---|---|
#2: タンパク質 | 分子量: 5600.260 Da / 分子数: 1 / Fragment: THIRD DOMAIN / Mutation: DEL(1-5), L18Q / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() プラスミド: PEZZ318.TKY / 発現宿主: ![]() ![]() |
#3: 化合物 | ChemComp-PO4 / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.03 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.53 % |
---|---|
結晶化 | pH: 10.7 / 詳細: 0.4 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE buffer AT PH 10.7 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 287 K |
---|---|
放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: SDMS / 検出器: AREA DETECTOR |
放射 | モノクロメーター: NI FILTER / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.8→20 Å / Num. obs: 17153 / % possible obs: 88.5 % / 冗長度: 2 % / Rmerge(I) obs: 0.088 |
-
解析
ソフトウェア | 名称: TNT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 3SGB 解像度: 1.8→20 Å / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: TNT PROTGEO /
| ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.8→20 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|