PDB-3sck: Crystal structure of spike protein receptor-binding domain from a...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3sck

タイトル

Crystal structure of spike protein receptor-binding domain from a predicted SARS coronavirus civet strain complexed with human-civet chimeric receptor ACE2

要素

Angiotensin-converting enzyme 2 chimera
Spike glycoprotein

キーワード

HYDROLASE/VIRAL PROTEIN / beta-sheet / HYDROLASE-VIRAL PROTEIN complex

機能・相同性

機能・相同性情報

Maturation of spike protein / Translation of Structural Proteins / Virion Assembly and Release / positive regulation of amino acid transport / angiotensin-converting enzyme 2 / positive regulation of L-proline import across plasma membrane / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; 金属プロテアーゼ / angiotensin-mediated drinking behavior / regulation of systemic arterial blood pressure by renin-angiotensin / tryptophan transport ...Maturation of spike protein / Translation of Structural Proteins / Virion Assembly and Release / positive regulation of amino acid transport / angiotensin-converting enzyme 2 / positive regulation of L-proline import across plasma membrane / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; 金属プロテアーゼ / angiotensin-mediated drinking behavior / regulation of systemic arterial blood pressure by renin-angiotensin / tryptophan transport / positive regulation of gap junction assembly / regulation of vasoconstriction / regulation of cardiac conduction / peptidyl-dipeptidase activity / maternal process involved in female pregnancy / angiotensin maturation / Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins / metallocarboxypeptidase activity / carboxypeptidase activity / negative regulation of signaling receptor activity / Attachment and Entry / positive regulation of cardiac muscle contraction / regulation of cytokine production / viral life cycle / blood vessel diameter maintenance / brush border membrane / regulation of transmembrane transporter activity / negative regulation of smooth muscle cell proliferation / endocytosis involved in viral entry into host cell / negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade / cilium / metallopeptidase activity / SARS-CoV-1 activates/modulates innate immune responses / endocytic vesicle membrane / positive regulation of reactive oxygen species metabolic process / virus receptor activity / regulation of cell population proliferation / regulation of inflammatory response / endopeptidase activity / suppression by virus of host tetherin activity / Potential therapeutics for SARS / Induction of Cell-Cell Fusion / entry receptor-mediated virion attachment to host cell / host cell endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane / receptor-mediated endocytosis of virus by host cell / membrane fusion / Attachment and Entry / positive regulation of viral entry into host cell / receptor-mediated virion attachment to host cell / host cell surface receptor binding / symbiont entry into host cell / membrane raft / apical plasma membrane / endoplasmic reticulum lumen / fusion of virus membrane with host plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / host cell plasma membrane / virion membrane / cell surface / proteolysis / extracellular space / zinc ion binding / extracellular exosome / extracellular region / identical protein binding / membrane / metal ion binding / plasma membrane / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

Spike protein, C-terminal core receptor binding subdomain / Spike (S) protein S1 subunit, receptor-binding domain, SARS-CoV / Collectrin-like domain profile. / Collectrin domain / Renal amino acid transporter / Peptidase family M2 domain profile. / Peptidase M2, peptidyl-dipeptidase A / Angiotensin-converting enzyme / Neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding region signature. / Spike (S) protein S1 subunit, N-terminal domain, SARS-CoV-like ...
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Paguma larvata (ハクビシン)

Homo sapiens (ヒト)

SARS coronavirus (SARS コロナウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3 Å

データ登録者

Wu, K. / Peng, G. / Wilken, M. / Geraghty, R. / Li, F.

引用

ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2012
タイトル: Mechanisms of host receptor adaptation by severe acute respiratory syndrome coronavirus.
著者: Wu, K. / Peng, G. / Wilken, M. / Geraghty, R.J. / Li, F.

履歴

登録	2011年6月7日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2012年2月8日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年7月26日	Group: Refinement description / Source and taxonomy / カテゴリ: entity_src_gen / software / Item: _software.classification
改定 1.2	2019年7月17日	Group: Data collection / Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.name / _software.version
改定 1.3	2020年9月16日	Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / citation_author ...citation / citation_author / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.name / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3sck.cif.gz	579.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3sck.ent.gz	494.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3sck.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3sck_validation.pdf.gz	468.1 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3sck_full_validation.pdf.gz	545.8 KB	表示
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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sc/3sck ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sc/3sck	HTTPS FTP

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関連構造データ

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類似構造データ	3scl-1 2ajf-1 3sci-1 6i7d-2 3scl-2 6i7d-1 3d0h-2 3scj-1 3zzu-1 2nqm-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#246 - 2020年6月 SARSコロナウイルス2 スパイク (SARS-CoV-2 Spike) 類似性 (13) #264 - 2021年12月 SARSコロナウイルス2型スパイク変異体 (SARS-CoV-2 Spike Variants) 類似性 (8) #12 - 2000年12月ペプシン (Pepsin) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Angiotensin-converting enzyme 2 chimera

B: Angiotensin-converting enzyme 2 chimera

E: Spike glycoprotein

F: Spike glycoprotein

ヘテロ分子

182 kDa, 4 ポリマー
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1

A: Angiotensin-converting enzyme 2 chimera

E: Spike glycoprotein

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
91.2 kDa, 2 ポリマー
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2

B: Angiotensin-converting enzyme 2 chimera

F: Spike glycoprotein

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
91.2 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	81.219, 119.277, 113.236
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 92.19, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
1	2	A
2	2	B
1	3	E
2	3	F

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Refine code	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	6	A	19 - 102
2	1	1	6	B	19 - 102
1	2	1	6	A	290 - 397
2	2	1	6	B	290 - 397
1	3	1	6	A	417 - 430
2	3	1	6	B	417 - 430
1	1	2	6	A	103 - 289
2	1	2	6	B	103 - 289
1	2	2	6	A	398 - 416
2	2	2	6	B	398 - 416
1	3	2	6	A	431 - 615
2	3	2	6	B	431 - 615
1	1	3	6	E	323 - 506
2	1	3	6	F	323 - 506

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3

#1: タンパク質	Angiotensin-converting enzyme 2 chimera / ACE2 / ACE-related carboxypeptidase / Angiotensin-converting enzyme homolog / ACEH / ...ACE2 / ACE-related carboxypeptidase / Angiotensin-converting enzyme homolog / ACEH / Metalloprotease MPROT15 / Processed angiotensin-converting enzyme 2 分子量: 69875.344 Da / 分子数: 2 / 断片: SEE REMARK 999 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Paguma larvata (ハクビシン), (組換発現) Homo sapiens (ヒト) 遺伝子: ACE2, UNQ868/PRO1885 発現宿主: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) 参照: UniProt: Q56NL1, UniProt: Q9BYF1, angiotensin-converting enzyme 2
#2: タンパク質	Spike glycoprotein / S glycoprotein / E2 / Peplomer protein / Spike protein S1 分子量: 21217.822 Da / 分子数: 2 / 断片: receptor binding domain (UNP residues 324-502) / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) SARS coronavirus (SARS コロナウイルス) 遺伝子: S, 2 発現宿主: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) 参照: UniProt: P59594
#3: 化合物	ChemComp-ZN / ZINC ION 分子量: 65.409 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#4: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
配列の詳細	CHAINS A AND B ARE CHIMERIC, COMPRISING RESIDUES 19-82 OF UNP Q56NL1 AND RESIDUES 83-615 OF UNP ...CHAINS A AND B ARE CHIMERIC, COMPRISING RESIDUES 19-82 OF UNP Q56NL1 AND RESIDUES 83-615 OF UNP Q9BYF1. IN CHAINS E AND F, L472P AND D480G ARE NATURAL VARIANTS OF UNP P59594.

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.01 Å³/Da / 溶媒含有率: 59.11 %
結晶化	温度: 295 K / 手法: 蒸発脱水法 / pH: 8.5 詳細: 20 mM Tris, pH 8.5, 20% PEG6000, 100 mM sodium chloride, EVAPORATION, temperature 295K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-ID
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	相対比: 1
反射	解像度: 3→50 Å / Num. all: 46750 / Num. obs: 42870 / % possible obs: 91.7 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2
反射シェル	解像度: 3→3.11 Å / % possible all: 59.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.5.0109	精密化
CNS		精密化
HKL-2000		データ収集
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
CNS		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 3→47.27 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.93 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.896 / SU B: 68.105 / SU ML: 0.516 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.591 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: U VALUES : RESIDUAL ONLY

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.28529	1723	5.1 %	RANDOM
R_work	0.2392	-	-	-
obs	0.24157	31946	78.71 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso max: 162.4 Å² / B_iso mean: 105.24 Å² / B_iso min: 51.13 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	3.6 Å²	-0 Å²	9.6 Å²
2-	-	-2.32 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.55 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3→47.27 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	12514	0	4	0	12518

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.011	0.022	12890
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.329	1.936	17538
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	2.863	5	1534
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	44.17	24.585	650
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	16.585	15	2084
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	18.292	15	54
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.086	0.2	1828
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.008	0.021	10038
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.161	1.5	7686
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	2.145	2	12420
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.392	3	5204
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	2.323	4.5	5118
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr	1.282	3	12890
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Dom-ID: 1 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Ens-ID	Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	A	1648	LOOSE POSITIONAL	0.29	5
1	A	1648	LOOSE THERMAL	1.3	10
2	A	3215	LOOSE POSITIONAL	0.59	5
2	A	3215	LOOSE THERMAL	4.65	10
3	E	1395	LOOSE POSITIONAL	0.16	5
3	E	1395	LOOSE THERMAL	1.3	10

LS精密化シェル

解像度: 3→3.162 Å / Total num. of bins used: 10

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.35	131	-
R_work	0.398	2440	-
obs	-	-	44.59 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	5.1001	4.8613	3.2141	7.9126	2.3431	4.5739	-0.3711	0.0713	-0.2998	0.1956	-0.0103	-0.7231	0.4645	0.2205	0.3813	0.393	0.0374	0.1126	0.0179	0.0413	0.1756	53.8967	-15.9649	118.1001
2	1.539	1.0991	-0.7299	1.741	-0.1155	2.7812	0.0874	0.0431	0.4113	0.329	-0.0277	0.1018	-0.1799	0.2249	-0.0597	0.26	-0.0101	-0.0511	0.1659	0.0738	0.2814	56.79	10.3948	117.3865
3	16.0915	-7.7704	2.7212	5.8224	-5.7206	9.8449	0.3865	1.9259	0.5334	1.1546	-0.5521	-0.2525	-2.7726	-0.4299	0.1655	1.0461	0.1625	-0.0996	0.357	0.1045	0.7986	58.231	30.1332	105.4648
4	2.8027	0.6732	-1.2145	1.3929	-0.7416	1.1886	-0.4872	-0.2187	-0.1706	-0.034	0.1095	-0.2151	0.2589	0.3654	0.3777	0.1999	0.1383	0.0955	0.2743	0.1528	0.1944	78.4836	-1.8686	101.8223
5	3.4214	3.7553	-3.5761	20.0427	-5.6394	3.977	-0.2501	-0.0015	0.4912	0.5993	0.6165	-0.5655	0.0577	-0.1382	-0.3664	0.2996	0.0417	-0.2656	0.3369	0.0774	0.3239	58.4069	10.2636	103.95
6	2.5617	0.4436	-1.3111	0.4845	-0.3575	0.9297	-0.3353	0.2386	0.0609	-0.1288	0.1598	-0.0532	0.3055	-0.1519	0.1755	0.2581	0.0067	0.0137	0.2334	0.0461	0.2573	69.1654	3.8758	95.0227
7	2.8389	-2.0154	-1.8414	2.5583	2.6573	5.3815	0.0582	0.4967	0.172	-0.5495	0.1977	-0.0646	0.178	-0.3585	-0.2559	0.7607	-0.2548	0.0365	0.7019	0.2147	0.0924	40.1042	38.5289	38.8247
8	0.7286	-0.3904	-0.7761	1.3306	0.1587	4.2379	0.0303	0.1894	0.0467	-0.3004	0.0832	-0.2457	-0.098	-0.1148	-0.1134	0.0793	-0.0308	0.0667	0.2866	0.0597	0.1974	40.8469	39.952	65.7439
9	5.0563	2.1731	1.7761	12.7815	-20.8152	39.9284	-0.2054	0.2008	-0.4113	0.0625	-0.0327	-0.3872	-0.3448	0.2425	0.2381	0.1266	0.105	-0.0992	0.1188	-0.1228	0.1439	43.272	30.0559	86.7483
10	0.802	0.0349	-0.0907	1.3275	-0.8543	1.488	-0.0834	0.118	-0.0254	-0.2121	0.3202	0.1218	0.0817	-0.2714	-0.2369	0.2245	-0.0509	-0.0044	0.2378	0.0885	0.223	18.3927	29.6643	60.8867
11	3.0003	-1.9827	2.9143	1.8054	0.0606	11.2637	0.4223	-0.3715	0.1804	-0.3719	0.3572	-0.3723	-0.0464	-0.3855	-0.7795	0.2098	-0.1207	-0.0219	0.4432	-0.0573	0.2166	39.1478	27.0867	67.1746
12	1.1927	0.3861	-0.1963	0.8863	-0.8463	0.9449	-0.0048	0.0557	-0.1936	-0.1496	0.1793	0.0517	0.1901	-0.0737	-0.1746	0.2951	-0.0276	0.0174	0.2087	-0.0029	0.2153	26.8375	21.3027	64.8504
13	2.6173	-0.1862	-1.5065	3.9687	-0.0537	1.2421	0.0807	0.0183	0.1491	0.1359	-0.1234	0.4031	-0.2912	-0.1131	0.0427	0.2114	0.0255	-0.0674	0.1111	-0.0417	0.1166	30.4415	-9.3377	130.3988
14	2.1488	0.8972	0.2089	1.1051	-0.0044	2.7752	0.0848	0.3674	0.1827	-0.3103	-0.2208	-0.3047	0.0634	0.0837	0.1359	0.3839	0.0796	0.2923	0.4185	0.2614	0.3408	65.0828	49.9608	41.433

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	19 - 102
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	290 - 397
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	417 - 430
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	103 - 289
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	398 - 416
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	431 - 615
7	X-RAY DIFFRACTION	7	B	19 - 102
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	290 - 397
9	X-RAY DIFFRACTION	9	B	417 - 430
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	103 - 289
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	398 - 416
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	431 - 615
13	X-RAY DIFFRACTION	13	E	324 - 502
14	X-RAY DIFFRACTION	14	F	324 - 502

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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