登録情報 | データベース: PDB / ID: 3saw |
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タイトル | MUTM Slanted complex 8 with R112A mutation |
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要素 | - 5'-D(*A*GP*GP*TP*AP*GP*AP*CP*AP*AP*GP*GP*AP*CP*GP*C)-3'
- 5'-D(*TP*GP*CP*GP*TP*C*CP*TP*TP*GP*TP*(CX2)P*TP*AP*CP*C)-3'
- DNA GLYCOSYLASE
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キーワード | HYDROLASE/DNA / DNA GLYCOSYLASE / DNA REPAIR / DAMAGE SEARCH / TRANSLOCATION / DISULFIDE CROSSLINKING / DNA DAMAGE / DNA-BINDING / GLYCOSIDASE / HYDROLASE / LYASE / METAL-BINDING / MULTIFUNCTIONAL ENZYME / ZINC-FINGER / HYDROLASE-DNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
DNA-formamidopyrimidine glycosylase / 8-oxo-7,8-dihydroguanine DNA N-glycosylase activity / class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / base-excision repair / damaged DNA binding / zinc ion binding類似検索 - 分子機能 Formamidopyrimidine-DNA glycosylase / Zinc finger, DNA glycosylase/AP lyase-type / Zinc finger, FPG/IleRS-type / DNA glycosylase/AP lyase, zinc finger domain, DNA-binding site / Zinc finger found in FPG and IleRS / Zinc finger FPG-type signature. / Zinc finger FPG-type profile. / MutM-like, N-terminal / Formamidopyrimidine-DNA glycosylase H2TH domain / N-terminal domain of MutM-like DNA repair proteins ...Formamidopyrimidine-DNA glycosylase / Zinc finger, DNA glycosylase/AP lyase-type / Zinc finger, FPG/IleRS-type / DNA glycosylase/AP lyase, zinc finger domain, DNA-binding site / Zinc finger found in FPG and IleRS / Zinc finger FPG-type signature. / Zinc finger FPG-type profile. / MutM-like, N-terminal / Formamidopyrimidine-DNA glycosylase H2TH domain / N-terminal domain of MutM-like DNA repair proteins / Formamidopyrimidine-DNA glycosylase N-terminal domain / Formamidopyrimidine-DNA glycosylase N-terminal domain / MutM-like, N-terminal / Formamidopyrimidine-DNA glycosylase, catalytic domain / Formamidopyrimidine-DNA glycosylase catalytic domain profile. / Formamidopyrimidine-DNA glycosylase H2TH domain / DNA glycosylase/AP lyase, H2TH DNA-binding / Helicase, Ruva Protein; domain 3 - #50 / Helicase, Ruva Protein; domain 3 / Ribosomal protein S13-like, H2TH / Alpha-Beta Barrel / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 DNA / DNA (> 10) / Formamidopyrimidine-DNA glycosylase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Geobacillus stearothermophilus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.35 Å |
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データ登録者 | Qi, Y. / Verdine, G.L. |
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2012 タイトル: Strandwise translocation of a DNA glycosylase on undamaged DNA. 著者: Qi, Y. / Nam, K. / Spong, M.C. / Banerjee, A. / Sung, R.J. / Zhang, M. / Karplus, M. / Verdine, G.L. |
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履歴 | 登録 | 2011年6月3日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2012年1月11日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2012年2月22日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2017年11月8日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software / Item: _software.name |
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改定 1.3 | 2019年7月17日 | Group: Data collection / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: software / struct_conn Item: _software.name / _software.version / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag |
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改定 1.4 | 2023年9月13日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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