登録情報 | データベース: PDB / ID: 3qas |
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タイトル | Structure of Undecaprenyl Diphosphate synthase |
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要素 | Undecaprenyl pyrophosphate synthase |
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キーワード | TRANSFERASE / alpha-helix / Isoprenoid Biosynthesis |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
Gram-negative-bacterium-type cell wall biogenesis / ditrans,polycis-undecaprenyl-diphosphate synthase [(2E,6E)-farnesyl-diphosphate specific] / di-trans,poly-cis-undecaprenyl-diphosphate synthase activity / Z-farnesyl diphosphate synthase activity / polyprenol biosynthetic process / polyprenyltransferase activity / small molecule binding / peptidoglycan biosynthetic process / cell wall organization / manganese ion binding ...Gram-negative-bacterium-type cell wall biogenesis / ditrans,polycis-undecaprenyl-diphosphate synthase [(2E,6E)-farnesyl-diphosphate specific] / di-trans,poly-cis-undecaprenyl-diphosphate synthase activity / Z-farnesyl diphosphate synthase activity / polyprenol biosynthetic process / polyprenyltransferase activity / small molecule binding / peptidoglycan biosynthetic process / cell wall organization / manganese ion binding / regulation of cell shape / cell cycle / cell division / magnesium ion binding / protein homodimerization activity / plasma membrane / cytoplasm / cytosol類似検索 - 分子機能 Undecaprenyl pyrophosphate synthetase / Decaprenyl diphosphate synthase-like / Di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase-like, conserved site / Undecaprenyl pyrophosphate synthase family signature. / Decaprenyl diphosphate synthase-like / Putative undecaprenyl diphosphate synthase / Decaprenyl diphosphate synthase-like superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Ditrans,polycis-undecaprenyl-diphosphate synthase ((2E,6E)-farnesyl-diphosphate specific)類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.7 Å |
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データ登録者 | Cao, R. / Oldfield, E. |
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引用 | ジャーナル: Chem.Biol.Drug Des. / 年: 2011 タイトル: Applying Molecular Dynamics Simulations to Identify Rarely Sampled Ligand-bound Conformational States of Undecaprenyl Pyrophosphate Synthase, an Antibacterial Target. 著者: Sinko, W. / de Oliveira, C. / Williams, S. / Van Wynsberghe, A. / Durrant, J.D. / Cao, R. / Oldfield, E. / McCammon, J.A. |
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履歴 | 登録 | 2011年1月11日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2011年3月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2023年9月13日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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