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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3psh | ||||||
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タイトル | Classification of a Haemophilus influenzae ABC transporter HI1470/71 through its cognate molybdate periplasmic binding protein MolA (MolA bound to Molybdate) | ||||||
要素 | protein HI_1472 | ||||||
キーワード | METAL TRANSPORT / Substrate binding protein / Periplasmic binding protein / molybdate binding protein | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Haemophilus influenzae (インフルエンザ菌) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 多波長異常分散 / 解像度: 1.5 Å | ||||||
データ登録者 | Tirado-Lee, L. / Lee, A. / Rees, D.C. / Pinkett, H.W. | ||||||
引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2011 タイトル: Classification of a Haemophilus influenzae ABC Transporter HI1470/71 through Its Cognate Molybdate Periplasmic Binding Protein, MolA. 著者: Tirado-Lee, L. / Lee, A. / Rees, D.C. / Pinkett, H.W. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 3psh.cif.gz | 121.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb3psh.ent.gz | 60.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 3psh.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ps/3psh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ps/3psh | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 36642.934 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 22-347 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Haemophilus influenzae (インフルエンザ菌) 遺伝子: HI1472, HI_1472 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P44206 |
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#2: 化合物 | ChemComp-MOO / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 2 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 6.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 80.06 % |
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 4.5 詳細: 24% PEG2000 MME, 0.1 M sodium acetate pH 4.5, 0.2 M ammonium sulfate, 12% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K | |||||||||
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放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: SSRL / ビームライン: BL12-2 / 波長: 1.54, 1.00 | |||||||||
検出器 | タイプ: MARMOSAIC 325 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2007年12月7日 | |||||||||
放射 | モノクロメーター: Liquid nitrogen-cooled double crystal プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | |||||||||
放射波長 |
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反射 | 解像度: 1.5→20 Å / Num. all: 144042 / Num. obs: 138477 / % possible obs: 96.05 % |
-位相決定
位相決定 | 手法: 多波長異常分散 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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