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基本情報
| 登録情報 | データベース: PDB / ID: 3psh | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| タイトル | Classification of a Haemophilus influenzae ABC transporter HI1470/71 through its cognate molybdate periplasmic binding protein MolA (MolA bound to Molybdate) | ||||||
要素 | protein HI_1472 | ||||||
キーワード | METAL TRANSPORT / Substrate binding protein / Periplasmic binding protein / molybdate binding protein | ||||||
| 機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
| 生物種 | Haemophilus influenzae (インフルエンザ菌) | ||||||
| 手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 多波長異常分散 / 解像度: 1.5 Å | ||||||
データ登録者 | Tirado-Lee, L. / Lee, A. / Rees, D.C. / Pinkett, H.W. | ||||||
引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2011タイトル: Classification of a Haemophilus influenzae ABC Transporter HI1470/71 through Its Cognate Molybdate Periplasmic Binding Protein, MolA. 著者: Tirado-Lee, L. / Lee, A. / Rees, D.C. / Pinkett, H.W. | ||||||
| 履歴 |
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構造の表示
| 構造ビューア | 分子: Molmil Jmol/JSmol |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
| PDBx/mmCIF形式 | 3psh.cif.gz | 121.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
|---|---|---|---|---|
| PDB形式 | pdb3psh.ent.gz | 60.7 KB | 表示 | PDB形式 |
| PDBx/mmJSON形式 | 3psh.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
| その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
| アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ps/3psh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ps/3psh | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
| 登録構造単位 | ![]()
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| 1 |
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| 単位格子 |
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要素
| #1: タンパク質 | 分子量: 36642.934 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 22-347 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Haemophilus influenzae (インフルエンザ菌)遺伝子: HI1472, HI_1472 / 発現宿主: ![]() |
|---|---|
| #2: 化合物 | ChemComp-MOO / |
| #3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
| 実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 2 |
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試料調製
| 結晶 | マシュー密度: 6.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 80.06 % |
|---|---|
| 結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 4.5 詳細: 24% PEG2000 MME, 0.1 M sodium acetate pH 4.5, 0.2 M ammonium sulfate, 12% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K |
-データ収集
| 回折 | 平均測定温度: 100 K | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: SSRL / ビームライン: BL12-2 / 波長: 1.54, 1.00 | |||||||||
| 検出器 | タイプ: MARMOSAIC 325 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2007年12月7日 | |||||||||
| 放射 | モノクロメーター: Liquid nitrogen-cooled double crystal プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | |||||||||
| 放射波長 |
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| 反射 | 解像度: 1.5→20 Å / Num. all: 144042 / Num. obs: 138477 / % possible obs: 96.05 % |
-位相決定
| 位相決定 | 手法: 多波長異常分散 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Haemophilus influenzae (インフルエンザ菌)
X線回折
引用










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