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Yorodumi- PDB-3psh: Classification of a Haemophilus influenzae ABC transporter HI1470... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3psh | ||||||
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Title | Classification of a Haemophilus influenzae ABC transporter HI1470/71 through its cognate molybdate periplasmic binding protein MolA (MolA bound to Molybdate) | ||||||
Components | protein HI_1472 | ||||||
Keywords | METAL TRANSPORT / Substrate binding protein / Periplasmic binding protein / molybdate binding protein | ||||||
Function / homology | Function and homology information monoatomic ion transport / cellular response to iron ion / periplasmic space Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Haemophilus influenzae (bacteria) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / SAD / MAD / Resolution: 1.5 Å | ||||||
Authors | Tirado-Lee, L. / Lee, A. / Rees, D.C. / Pinkett, H.W. | ||||||
Citation | Journal: Structure / Year: 2011 Title: Classification of a Haemophilus influenzae ABC Transporter HI1470/71 through Its Cognate Molybdate Periplasmic Binding Protein, MolA. Authors: Tirado-Lee, L. / Lee, A. / Rees, D.C. / Pinkett, H.W. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 3psh.cif.gz | 121.2 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb3psh.ent.gz | 60.7 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 3psh.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ps/3psh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ps/3psh | HTTPS FTP |
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-Related structure data
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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1 |
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Unit cell |
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-Components
#1: Protein | Mass: 36642.934 Da / Num. of mol.: 1 / Fragment: UNP residues 22-347 Source method: isolated from a genetically manipulated source Source: (gene. exp.) Haemophilus influenzae (bacteria) / Gene: HI1472, HI_1472 / Production host: Escherichia coli (E. coli) / References: UniProt: P44206 |
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#2: Chemical | ChemComp-MOO / |
#3: Water | ChemComp-HOH / |
-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: X-RAY DIFFRACTION / Number of used crystals: 2 |
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-Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 6.17 Å3/Da / Density % sol: 80.06 % |
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Crystal grow | Temperature: 277 K / Method: vapor diffusion, sitting drop / pH: 4.5 Details: 24% PEG2000 MME, 0.1 M sodium acetate pH 4.5, 0.2 M ammonium sulfate, 12% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K |
-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 100 K | |||||||||
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Diffraction source | Source: SYNCHROTRON / Site: SSRL / Beamline: BL12-2 / Wavelength: 1.54, 1.00 | |||||||||
Detector | Type: MARMOSAIC 325 mm CCD / Detector: CCD / Date: Dec 7, 2007 | |||||||||
Radiation | Monochromator: Liquid nitrogen-cooled double crystal / Protocol: SINGLE WAVELENGTH / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray | |||||||||
Radiation wavelength |
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Reflection | Resolution: 1.5→20 Å / Num. all: 144042 / Num. obs: 138477 / % possible obs: 96.05 % |
-Phasing
Phasing | Method: MAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Phasing MAD set site |
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