- PDB-3p1w: Crystal Structure of RAB GDI from Plasmodium Falciparum, PFL2060c -
+
データを開く
IDまたはキーワード:
読み込み中...
-
基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3p1w
タイトル
Crystal Structure of RAB GDI from Plasmodium Falciparum, PFL2060c
要素
RabGDI protein
キーワード
PROTEIN TRANSPORT / GDI RAB / malaria (マラリア) / Structural Genomics Consortium / SGC / transport / PF10_0345
機能・相同性
機能・相同性情報
RAB GEFs exchange GTP for GDP on RABs / Rab GDP-dissociation inhibitor activity / small GTPase binding => GO:0031267 / Neutrophil degranulation / small GTPase-mediated signal transduction / vesicle-mediated transport / GTPase activator activity / protein transport / 細胞質 類似検索 - 分子機能
#1: ジャーナル: Mol.Biochem.Parasitol. / 年: 1996 タイトル: A Plasmodium falciparum homologue of a rab specific GDP dissociation inhibitor. 著者: Attal, G. / Langsley, G.
解像度: 1.85→40.44 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.96 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.955 / WRfactor Rfree: 0.1992 / WRfactor Rwork: 0.18 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0 / FOM work R set: 0.8908 / SU B: 5.216 / SU ML: 0.072 / SU R Cruickshank DPI: 0.1169 / SU Rfree: 0.1072 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.117 / ESU R Free: 0.107 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : RESIDUAL ONLY
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2006
2571
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.1804
-
-
-
all
0.1814
51043
-
-
obs
0.1814
50360
98.66 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK