ソフトウェア | 名称 | バージョン | 分類 | NB |
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SCALA | 3.3.16データスケーリング | | REFMAC | 5.5.0109精密化 | | PDB_EXTRACT | 3.1 | データ抽出 | | CrysalisPro | | データ収集 | | CrysalisPro | | データ削減 | | REFMAC | 5.5.0109位相決定 | | | | |
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精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.9→22.66 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.971 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.955 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / SU B: 4.233 / SU ML: 0.122 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R Free: 0.178 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS. U VALUES: REFINED INDIVIDUALLY
| Rfactor | 反射数 | %反射 | Selection details |
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Rfree | 0.2408 | 229 | 4.6 % | RANDOM |
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Rwork | 0.163 | - | - | - |
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obs | 0.1667 | 4962 | 95.33 % | - |
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK |
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原子変位パラメータ | Biso max: 55.95 Å2 / Biso mean: 21.783 Å2 / Biso min: 8.42 Å2
| Baniso -1 | Baniso -2 | Baniso -3 |
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1- | -0.01 Å2 | 0 Å2 | 0 Å2 |
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2- | - | -0.01 Å2 | 0 Å2 |
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3- | - | - | 0.02 Å2 |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→22.66 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
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原子数 | 0 | 486 | 50 | 136 | 672 |
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拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal | Dev ideal target | 数 |
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X-RAY DIFFRACTION | r_bond_refined_d0.018 | 0.021 | 599 | X-RAY DIFFRACTION | r_angle_refined_deg3.031 | 3.011 | 911 | X-RAY DIFFRACTION | r_chiral_restr0.125 | 0.2 | 96 | X-RAY DIFFRACTION | r_gen_planes_refined0.017 | 0.02 | 301 | X-RAY DIFFRACTION | r_scbond_it2.505 | 3 | 599 | X-RAY DIFFRACTION | r_scangle_it3.294 | 4.5 | 911 | | | | | | |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.901→1.95 Å / Total num. of bins used: 20
| Rfactor | 反射数 | %反射 |
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Rfree | 0.416 | 15 | - |
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Rwork | 0.192 | 261 | - |
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all | - | 276 | - |
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obs | - | - | 74.59 % |
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