登録情報 | データベース: PDB / ID: 3o4k |
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タイトル | Crystal structure of the complex of peptidoglycan recognition protein (PGRP-S) and lipoteichoic acid at 2.1 A resolution |
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要素 | Peptidoglycan recognition protein 1 |
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キーワード | IMMUNE SYSTEM / Immune response / secreted / antimicrobial / PGRP / Antibiotic / Peptidoglycan Binding |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
peptidoglycan immune receptor activity / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity / peptidoglycan binding / negative regulation of cytokine production / detection of bacterium / peptidoglycan catabolic process / defense response to Gram-positive bacterium / innate immune response / zinc ion binding / extracellular region類似検索 - 分子機能 Peptidoglycan recognition protein, PGRP-S / Peptidoglycan recognition protein family domain, metazoa/bacteria / Peptidoglycan recognition protein / Animal peptidoglycan recognition proteins homologous to Bacteriophage T3 lysozyme. / Lysozyme-like / Peptidoglycan recognition protein-like / Ami_2 / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase/PGRP domain superfamily ...Peptidoglycan recognition protein, PGRP-S / Peptidoglycan recognition protein family domain, metazoa/bacteria / Peptidoglycan recognition protein / Animal peptidoglycan recognition proteins homologous to Bacteriophage T3 lysozyme. / Lysozyme-like / Peptidoglycan recognition protein-like / Ami_2 / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase/PGRP domain superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-LTC / L(+)-TARTARIC ACID / Peptidoglycan recognition protein 1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_mammal.gif) Camelus dromedarius (ヒトコブラクダ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.11 Å |
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データ登録者 | Sharma, P. / Dube, D. / Sinha, M. / Kaur, P. / Sharma, S. / Singh, T.P. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2011 タイトル: Structural basis of recognition of pathogen-associated molecular patterns and inhibition of proinflammatory cytokines by camel peptidoglycan recognition protein 著者: Sharma, P. / Dube, D. / Singh, A. / Mishra, B. / Singh, N. / Sinha, M. / Dey, S. / Kaur, P. / Mitra, D.K. / Sharma, S. / Singh, T.P. |
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履歴 | 登録 | 2010年7月27日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2010年8月25日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年8月31日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2023年11月1日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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