- PDB-3niq: Crystal structure of Pseudomonas aeruginosa guanidinopropionase -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3niq
タイトル
Crystal structure of Pseudomonas aeruginosa guanidinopropionase
要素
3-guanidinopropionase
キーワード
HYDROLASE / guanidinopropionase / GpuA
機能・相同性
機能・相同性情報
guanidinopropionase / guanidinopropionase activity / putrescine biosynthetic process from arginine, using agmatinase / agmatinase activity / metal ion binding 類似検索 - 分子機能
Agmatinase-related / Ureohydrolase domain / Ureohydrolase, manganese-binding site / Arginase family signature. / Ureohydrolase / Arginase family / Arginase family profile. / Arginase; Chain A / Ureohydrolase domain superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性
解像度: 2.07→20 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.956 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.934 / SU B: 4.11 / SU ML: 0.113 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.21 / ESU R Free: 0.176 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.22788
1948
5 %
RANDOM
Rwork
0.18472
-
-
-
obs
0.18683
36912
99.99 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK