登録情報 データベース : PDB / ID : 3moo 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of the HmuO, heme oxygenase from Corynebacterium diphtheriae, in complex with azide-bound verdoheme 要素Heme oxygenase 詳細 キーワード OXIDOREDUCTASE / heme oxygenase / reaction intermediate / ferrous verdoheme / reaction mechanism / anaerobic chamber / absorption spectra機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
heme oxygenase (biliverdin-producing) / heme oxidation / heme oxygenase (decyclizing) activity / heme catabolic process / response to oxidative stress / heme binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 Haem oxygenase conserved site / Heme oxygenase signature. / Haem oxygenase / Haem oxygenase-like / Heme oxygenase / Heme oxygenase-like / Heme Oxygenase; Chain A / Haem oxygenase-like, multi-helical / Up-down Bundle / Mainly Alpha 類似検索 - ドメイン・相同性 sucrose / AZIDE ION / 5-OXA-PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / heme oxygenase (biliverdin-producing) 類似検索 - 構成要素生物種 Corynebacterium diphtheriae (ジフテリア菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.71 Å 詳細データ登録者 Omori, K. / Matsui, T. / Unno, M. / Ikeda-Saito, M. 引用ジャーナル : J.Am.Chem.Soc. / 年 : 2010タイトル : Enzymatic ring-opening mechanism of verdoheme by the heme oxygenase: a combined X-ray crystallography and QM/MM study.著者 : Lai, W. / Chen, H. / Matsui, T. / Omori, K. / Unno, M. / Ikeda-Saito, M. / Shaik, S. 履歴 登録 2010年4月22日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2011年3月9日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 2.0 2020年7月29日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / entity_name_com / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_molecule_features / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_validate_symm_contact / struct_asym / struct_conn / struct_conn_type / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _entity.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_validate_symm_contact.auth_asym_id_2 / _pdbx_validate_symm_contact.auth_comp_id_2 / _pdbx_validate_symm_contact.auth_seq_id_2 / _struct_asym.entity_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2023年11月1日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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