登録情報 | データベース: PDB / ID: 3m4p |
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タイトル | Entamoeba histolytica asparaginyl-tRNA synthetase (AsnRS) in complex with asparaginyl-adenylate |
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要素 | Asparaginyl-tRNA synthetase, putative |
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キーワード | LIGASE / aminoacyl-tRNA synthetase / tRNA ligase / AARS / AsnRS / translation / ATP-binding / nucleotide-binding / Structural Genomics / Medical Structural Genomics of Pathogenic Protozoa / MSGPP / Protein biosynthesis |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
asparagine-tRNA ligase / asparagine-tRNA ligase activity / asparaginyl-tRNA aminoacylation / nucleic acid binding / ATP binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Asparagine-tRNA ligase / Aspartyl/Asparaginyl-tRNA synthetase, class IIb / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / OB-fold nucleic acid binding domain / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. ...Asparagine-tRNA ligase / Aspartyl/Asparaginyl-tRNA synthetase, class IIb / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / OB-fold nucleic acid binding domain / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. / Class II Aminoacyl-tRNA synthetase/Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL) / Nucleic acid-binding proteins / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Nucleic acid-binding, OB-fold / Beta Barrel / 2-Layer Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 |  Entamoeba histolytica (赤痢アメーバ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.83 Å |
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データ登録者 | Larson, E.T. / Merritt, E.A. / Medical Structural Genomics of Pathogenic Protozoa (MSGPP) |
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引用 | ジャーナル: to be published タイトル: X-ray crystal structure of asparaginyl-tRNA synthetase from the eukaryotic human pathogen Entamoeba histolytica. 著者: Larson, E.T. / Kim, J.E. / Napuli, A. / Kelley, A. / Castaneda, L. / Verlinde, C.L.M.J. / Van Voorhis, W.C. / Buckner, F.S. / Fan, E. / Hol, W.G.J. / Merritt, E.A. |
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履歴 | 登録 | 2010年3月11日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年3月23日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年11月8日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.3 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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