登録情報 | データベース: PDB / ID: 3nen |
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タイトル | Unliganded aspartyl-tRNA synthetase from thermococcus kodakarensis |
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要素 | Aspartyl-tRNA synthetase |
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キーワード | LIGASE / aminoacyl-tRNA synthetase / Rossmann fold Ob fold / Aspartic acid / ATP-Mg / tRNA |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
aspartate-tRNA ligase / aspartyl-tRNA aminoacylation / aspartate-tRNA ligase activity / aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex / magnesium ion binding / RNA binding / ATP binding / cytosol類似検索 - 分子機能 Aspartate-tRNA synthetase, type 2 / Aspartyl/Asparaginyl-tRNA synthetase, class IIb / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / OB-fold nucleic acid binding domain / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. ...Aspartate-tRNA synthetase, type 2 / Aspartyl/Asparaginyl-tRNA synthetase, class IIb / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / OB-fold nucleic acid binding domain / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. / Class II Aminoacyl-tRNA synthetase/Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL) / Nucleic acid-binding proteins / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Nucleic acid-binding, OB-fold / Beta Barrel / 2-Layer Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Thermococcus kodakarensis (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.4 Å |
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データ登録者 | Schmitt, E. / Moras, D. / Moulinier, L. |
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引用 | ジャーナル: Embo J. / 年: 1998 タイトル: Crystal structure of aspartyl-tRNA synthetase from Pyrococcus kodakaraensis KOD: archaeon specificity and catalytic mechanism of adenylate formation 著者: Schmitt, E. / Moulinier, L. / Fujiwara, S. / Imanaka, T. / Thierry, J.C. / Moras, D. |
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履歴 | 登録 | 2010年6月9日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年8月4日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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