- PDB-3m3m: Crystal structure of glutathione S-transferase from Pseudomonas f... -
+
データを開く
IDまたはキーワード:
読み込み中...
-
基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 3m3m
タイトル
Crystal structure of glutathione S-transferase from Pseudomonas fluorescens [Pf-5]
要素
Glutathione S-transferaseグルタチオン-S-トランスフェラーゼ
キーワード
TRANSFERASE (転移酵素) / PSI-II / Structural Genomics (構造ゲノミクス) / Protein Structure Initiative / New York SGX Research Center for Structural Genomics / NYSGXRC
モノクロメーター: Si(111)channel / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.979 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.75→40.43 Å / Num. all: 26280 / Num. obs: 24949 / % possible obs: 99.49 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 10 % / Biso Wilson estimate: 24.2 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.105 / Net I/σ(I): 15.4
反射 シェル
解像度: 1.75→1.79 Å / 冗長度: 8.6 % / Rmerge(I) obs: 0.292 / Mean I/σ(I) obs: 2.5 / Num. unique all: 1785 / % possible all: 98.37
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
CBASS
データ収集
SHARP
位相決定
REFMAC
5.5.0102
精密化
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.75→40.43 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.961 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.946 / SU B: 1.756 / SU ML: 0.057 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.093 / ESU R Free: 0.096 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.19626
1331
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.15857
-
-
-
obs
0.16049
24949
99.49 %
-
all
-
26280
-
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK