登録情報 | データベース: PDB / ID: 3le7 |
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タイトル | Crystal structure of PD-L1 from P. dioica in complex with adenine |
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要素 | Ribosome-inactivating protein PD-L1/PD-L2 |
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キーワード | HYDROLASE / ribosome / adenine / Disulfide bond / Glycoprotein / Plant defense / Protein synthesis inhibitor / Toxin |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
rRNA N-glycosylase / rRNA N-glycosylase activity / defense response / toxin activity / negative regulation of translation類似検索 - 分子機能 Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / Ribosome-inactivating protein conserved site / Shiga/ricin ribosomal inactivating toxins active site signature. / Ribosome-inactivating protein type 1/2 / Ribosome-inactivating protein / Ribosome-inactivating protein, subdomain 1 / Ribosome-inactivating protein, subdomain 2 ...Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / Ribosome-inactivating protein conserved site / Shiga/ricin ribosomal inactivating toxins active site signature. / Ribosome-inactivating protein type 1/2 / Ribosome-inactivating protein / Ribosome-inactivating protein, subdomain 1 / Ribosome-inactivating protein, subdomain 2 / Ribosome-inactivating protein superfamily / Ribosome inactivating protein / Few Secondary Structures / Irregular / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ADENINE / Ribosome-inactivating protein PD-L1/PD-L2類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Phytolacca dioica (植物) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.65 Å |
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データ登録者 | Ruggiero, A. / Berisio, R. |
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引用 | ジャーナル: Mol Biosyst / 年: 2010 タイトル: The role of the glycan moiety on the structure-function relationships of PD-L1, type 1 ribosome-inactivating protein from P. dioica leaves 著者: Severino, V. / Chambery, A. / Di Maro, A. / Marasco, D. / Ruggiero, A. / Berisio, R. / Giansanti, F. / Ippoliti, R. / Parente, A. |
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履歴 | 登録 | 2010年1月14日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2010年4月14日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2020年7月29日 | Group: Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _chem_comp.type ..._chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 1.3 | 2023年11月1日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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