PDB-3kg6: Dehydratase domain from CurF module of Curacin polyketide synthase

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3kg6

タイトル

Dehydratase domain from CurF module of Curacin polyketide synthase

要素

CurF

キーワード

LYASE / polyketide synthase / double hotdog fold / dehydratase

機能・相同性

機能・相同性情報

(3S)-3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (NAD+) activity / secondary metabolite biosynthetic process / fatty acid synthase activity / phosphopantetheine binding / 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase activity / fatty acid biosynthetic process / nucleotide binding / metal ion binding / identical protein binding
類似検索 - 分子機能

Polyketide synthase dehydratase / CurL-like, PKS C-terminal / Zinc-binding dehydrogenase / Enoyl-CoA hydratase/isomerase, conserved site / Enoyl-CoA hydratase/isomerase signature. / : / Polyketide synthase dehydratase N-terminal domain / Condensation domain / Condensation domain / Amino acid adenylation domain ...Polyketide synthase dehydratase / CurL-like, PKS C-terminal / Zinc-binding dehydrogenase / Enoyl-CoA hydratase/isomerase, conserved site / Enoyl-CoA hydratase/isomerase signature. / : / Polyketide synthase dehydratase N-terminal domain / Condensation domain / Condensation domain / Amino acid adenylation domain / Polyketide synthase, dehydratase domain / PKS_DH / PKS_PP_betabranch / : / Polyketide synthase dehydratase domain / : / Polyketide and metazoan fatty acid synthase dehydratase (PKS/mFAS DH) domain profile. / Polyketide synthase, dehydratase domain superfamily / Thiol Ester Dehydrase; Chain A / Enoyl-CoA hydratase/isomerase / Enoyl-CoA hydratase/isomerase / Malonyl-CoA ACP transacylase, ACP-binding / : / AMP-binding enzyme C-terminal domain / AMP-binding enzyme, C-terminal domain / Chloramphenicol acetyltransferase-like domain superfamily / AMP-binding, conserved site / Putative AMP-binding domain signature. / Acyl transferase / Acyl transferase domain / Acyl transferase domain in polyketide synthase (PKS) enzymes. / Acyl transferase domain superfamily / Alcohol dehydrogenase, N-terminal / Alcohol dehydrogenase GroES-like domain / Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase / Polyketide synthase, enoylreductase domain / Enoylreductase / AMP-dependent synthetase/ligase / AMP-binding enzyme / Polyketide synthase, phosphopantetheine-binding domain / Phosphopantetheine attachment site / Beta-ketoacyl synthase / Beta-ketoacyl synthase, active site / Ketosynthase family 3 (KS3) active site signature. / AMP-binding enzyme, C-terminal domain superfamily / Ketosynthase family 3 (KS3) domain profile. / Beta-ketoacyl synthase, N-terminal / Beta-ketoacyl synthase, C-terminal / Polyketide synthase, beta-ketoacyl synthase domain / Beta-ketoacyl synthase, N-terminal domain / Beta-ketoacyl synthase, C-terminal domain / GroES-like superfamily / ClpP/crotonase-like domain superfamily / Thiolase-like / Phosphopantetheine attachment site / ACP-like superfamily / Carrier protein (CP) domain profile. / Phosphopantetheine binding ACP domain / NAD(P)-binding domain superfamily / Roll / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Lyngbya majuscula (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.7 Å

データ登録者

Akey, D.L. / Smith, J.L.

引用

ジャーナル: Structure / 年: 2010
タイトル: Crystal Structures of Dehydratase Domains from the Curacin Polyketide Biosynthetic Pathway.
著者: Akey, D.L. / Razelun, J.R. / Tehranisa, J. / Sherman, D.H. / Gerwick, W.H. / Smith, J.L.

履歴

登録	2009年10月28日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2010年1月19日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Refinement description / Version format compliance
改定 1.2	2017年11月1日	Group: Refinement description / カテゴリ: software
改定 1.3	2023年9月6日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.4	2024年1月31日	Group: Refinement description / カテゴリ: refine / Item: _refine.pdbx_starting_model

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3kg6_validation.pdf.gz	456.8 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3kg6_full_validation.pdf.gz	469.5 KB	表示
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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kg/3kg6 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kg/3kg6	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	3kg7SC 3kg8C 3kg9C S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3kg9-d 2px5-d 1icq-d 1ia9-d 3al5-1 6dy2-d 3al5-2 6e59-d 5x0r-d 5tz5-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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クエン酸回路 (Citric Acid Cycle)
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シャペロン (Chaperones)
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生分解性プラスチック (Biodegradable Plastic)
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登録構造単位

A: CurF

B: CurF

C: CurF

D: CurF

ヘテロ分子

128 kDa, 4 ポリマー
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1

A: CurF

C: CurF

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
64.1 kDa, 2 ポリマー
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2

B: CurF

D: CurF

ヘテロ分子

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3

A: CurF

ヘテロ分子

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32.1 kDa, 1 ポリマー
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4

B: CurF

ソフトウェアが定義した集合体
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5

C: CurF

ソフトウェアが定義した集合体
32 kDa, 1 ポリマー
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6

D: CurF

ヘテロ分子

ソフトウェアが定義した集合体
32.1 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	87.379, 198.385, 146.764
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	20
Space group name H-M	C222₁

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	A-1- CA
2	1	D-1- CA

#1: タンパク質	CurF 分子量: 32011.855 Da / 分子数: 4 / 断片: Dehydratase domain, residues 1687-1968 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Lyngbya majuscula (バクテリア) / 遺伝子: curF / プラスミド: pMCSG7 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q6DNE7, EC: 4.2.1.61
#2: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 52 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.48 Å³/Da / 溶媒含有率: 50.47 %
結晶化	温度: 293 K / pH: 8 詳細: 14% (w/v) PEG 4000, 200 mM CaCl2, 10% (v/v) glycerol, 2 mM DTT, 100 mM Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 23-ID-D / 波長: 0.97942
検出器	タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2007年6月5日 / 詳細: MIRRORS
放射	モノクロメーター: DOUBLE CRYSTAL MONOCHROMATOR / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97942 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.7→50 Å / Num. obs: 35542 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 7.4 % / R_merge(I) obs: 0.109 / R_sym value: 0.109 / Net I/σ(I): 18.1
反射シェル	解像度: 2.7→2.8 Å / 冗長度: 6.4 % / R_merge(I) obs: 0.792 / % possible all: 100

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PHASER		位相決定
RESOLVE		位相決定
REFMAC		精密化
PDB_EXTRACT	3.005	データ抽出
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3KG7

3kg7

解像度: 2.7→41.89 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.941 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.907 / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.5 / SU B: 32.369 / SU ML: 0.309 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.377 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2651	1980	5.6 %	RANDOM
R_work	0.21254	-	-	-
obs	0.21549	33290	99.16 %	-
all	-	35270	-	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 70.591 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-3.06 Å²	-0 Å²	0 Å²
2-	-	-1.42 Å²	0 Å²
3-	-	-	4.49 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.7→41.89 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	8802	0	5	52	8859

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.006	0.022	8991
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	0.918	1.95	12195
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.025	5	1098
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	36.279	25.404	433
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	15.946	15	1537
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	13.981	15	28
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.061	0.2	1365
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.002	0.02	6810
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.172	0.2	3417
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.299	0.2	5951
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.12	0.2	290
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined	0.051	0.2	3
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.185	0.2	64
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.172	0.2	6
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined	0.056	0.2	3
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.809	3.5	5690
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.389	5	8896
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	0.58	3.5	3774
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	0.885	5	3299
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 2.7→2.766 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.293	140	-
R_work	0.298	2358	-
obs	-	-	96.6 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	6.6287	1.6365	-1.7989	8.9753	-0.5463	3.9042	-0.0743	-0.3119	-0.317	0.1185	0.1414	-0.3631	0.1294	0.1866	-0.067	-0.3979	0.1	-0.0019	-0.4063	0.0909	-0.3684	47.896	92.007	12.272
2	5.0589	-1.6908	-0.7907	6.7395	2.039	3.4004	0.0144	-0.1912	0.3371	0.3542	0.1849	0.905	-0.2406	-0.5192	-0.1993	-0.3242	0.0854	0.144	-0.1429	0.147	0.0506	26.16	99.582	18.774
3	24.2904	-8.5591	4.1524	11.7678	-1.7005	4.9837	0.6028	0.3604	2.0845	0.2411	-0.4271	-1.5964	-0.6464	0.814	-0.1757	0.0201	0.0743	0.1366	-0.467	-0.1454	-0.0926	43.698	122.428	18.376
4	3.6576	-0.14	-3.1664	4.2959	0.4009	3.8225	-0.0633	-0.2013	0.4549	0.4006	0.1993	0.3482	-0.2863	-0.1846	-0.136	-0.2635	0.127	0.0622	-0.3354	0.0406	-0.2038	38.279	111.134	16.515
5	5.7599	-1.7782	0.0045	8.9832	0.7629	5.1245	0.2906	0.6082	0.0596	-0.7884	-0.3939	0.0867	-0.0793	-0.0027	0.1033	-0.1013	0.1658	-0.0716	-0.1316	-0.1865	-0.207	71.176	128.38	16.831
6	6.5716	-4.7217	-1.7739	12.1019	6.7496	8.3983	-0.1024	-0.4194	-0.1192	0.82	-0.2924	1.0352	0.3353	-0.5254	0.3948	-0.1439	0.0003	0.0403	-0.1042	-0.2321	-0.1202	63.041	138.15	36.823
7	7.0965	-1.6932	-10.5904	4.4312	6.5786	19.8809	0.3949	1.2906	1.6093	-0.9574	0.1206	-0.6639	-2.0169	-0.0449	-0.5155	0.6139	0.2512	0.0611	0.0825	0.1059	0.7574	65.371	159.724	17.993
8	2.7519	-1.7067	0.7179	6.4504	1.6369	7.6403	0.2273	0.2725	0.8437	-0.4307	-0.2624	0.3151	-0.7647	-0.3503	0.0351	0.0466	0.123	-0.0508	-0.2196	-0.1188	0.2049	63.936	147.946	23.626
9	7.1322	-1.6355	-0.4883	8.6797	0.7492	3.1805	0.2346	0.4415	0.0981	-0.2423	-0.2689	0.092	0.1131	-0.2315	0.0344	-0.2638	0.1168	0.0769	-0.4253	0.1646	-0.2663	52.095	65.439	8.006
10	9.1041	-3.3186	3.5924	9.2395	-2.7863	3.2352	-0.2188	-0.7043	-0.2486	0.7962	0.2278	-0.5862	0.0461	0.1675	-0.009	-0.0069	0.0748	0.0012	-0.4135	0.1762	-0.2757	62.099	52.135	24.908
11	14.3751	-2.0099	7.5995	14.4869	-0.3036	8.8924	0.7405	1.7315	-1.4014	-1.0333	-0.1901	0.9286	1.2004	-0.5303	-0.5504	0.2602	0.1564	0.1115	-0.0443	-0.0855	0.2867	56.245	34.443	2.826
12	3.0404	-1.5354	-0.2152	7.5284	0.0572	8.3932	0.3905	0.5667	-0.746	-0.1789	-0.2506	-0.0913	0.8816	0.244	-0.1399	-0.0053	0.1284	0.0192	-0.4055	0.0727	-0.0527	59.003	44.622	10.367
13	4.5118	1.536	0.3446	9.61	2.4428	4.5814	0.0139	-0.1317	0.1549	0.1229	0.0046	0.5465	-0.1822	-0.0716	-0.0185	-0.3825	0.0682	0.0257	-0.3278	-0.0521	-0.2569	77.405	103.164	14.048
14	6.0881	-5.6247	-0.0475	11.8983	0.7891	3.1604	-0.0994	-0.2293	0.0452	0.2688	0.2929	-1.1138	0.3042	0.6072	-0.1936	-0.3992	0.0912	-0.0993	-0.0466	-0.1403	0.0434	98.766	93.489	17.638
15	26.5178	-10.2609	-4.2835	8.2593	-0.0248	3.424	0.7871	0.8826	-1.7365	0.0511	-0.5951	0.7605	0.3245	-0.6324	-0.192	0.0694	-0.0161	-0.0295	-0.3214	0.0125	0.1962	80.965	71.826	10.724
16	6.0928	-1.1701	3.9321	8.7677	1.0136	2.9039	-0.153	-0.0873	-0.6216	0.0676	0.1674	-0.195	0.3515	0.3982	-0.0144	-0.1636	0.0835	-0.0166	-0.3039	0.0281	-0.1787	86.529	82.895	12.237

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1685 - 1710
2	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1729 - 1760
3	X-RAY DIFFRACTION	1	A	1770 - 1814
4	X-RAY DIFFRACTION	2	A	1711 - 1728
5	X-RAY DIFFRACTION	2	A	1761 - 1769
6	X-RAY DIFFRACTION	2	A	1837 - 1853
7	X-RAY DIFFRACTION	3	A	1815 - 1836
8	X-RAY DIFFRACTION	4	A	1854 - 1967
9	X-RAY DIFFRACTION	5	B	1684 - 1710
10	X-RAY DIFFRACTION	5	B	1729 - 1760
11	X-RAY DIFFRACTION	5	B	1770 - 1814
12	X-RAY DIFFRACTION	6	B	1711 - 1728
13	X-RAY DIFFRACTION	6	B	1761 - 1769
14	X-RAY DIFFRACTION	6	B	1837 - 1853
15	X-RAY DIFFRACTION	7	B	1815 - 1836
16	X-RAY DIFFRACTION	8	B	1854 - 1967
17	X-RAY DIFFRACTION	9	C	1685 - 1710
18	X-RAY DIFFRACTION	9	C	1729 - 1760
19	X-RAY DIFFRACTION	9	C	1770 - 1814
20	X-RAY DIFFRACTION	10	C	1711 - 1728
21	X-RAY DIFFRACTION	10	C	1761 - 1769
22	X-RAY DIFFRACTION	10	C	1837 - 1853
23	X-RAY DIFFRACTION	11	C	1815 - 1836
24	X-RAY DIFFRACTION	12	C	1854 - 1967
25	X-RAY DIFFRACTION	13	D	1685 - 1710
26	X-RAY DIFFRACTION	13	D	1729 - 1760
27	X-RAY DIFFRACTION	13	D	1770 - 1814
28	X-RAY DIFFRACTION	14	D	1711 - 1728
29	X-RAY DIFFRACTION	14	D	1761 - 1769
30	X-RAY DIFFRACTION	14	D	1837 - 1853
31	X-RAY DIFFRACTION	15	D	1815 - 1836
32	X-RAY DIFFRACTION	16	D	1854 - 1966

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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