登録情報 データベース : PDB / ID : 3kco 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Room temperature neutron structure of D-Xylose Isomerase in complex with two Ni2+ cations and d12-D-glucose in the linear form (refined jointly with X-ray structure 3KBN) 要素Xylose isomerase 詳細 キーワード ISOMERASE / xylose isomerase / deuterated glucose / Carbohydrate metabolism / Metal-binding / Pentose shunt / Xylose metabolism機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
xylose isomerase / D-xylose metabolic process / xylose isomerase activity / magnesium ion binding / identical protein binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 Xylose isomerase, actinobacteria / : / Xylose isomerase / Xylose isomerase family profile. / Divalent-metal-dependent TIM barrel enzymes / Xylose isomerase-like, TIM barrel domain / Xylose isomerase-like TIM barrel / Xylose isomerase-like superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 DEUTERATED WATER / D-glucose / NICKEL (II) ION / Xylose isomerase 類似検索 - 構成要素生物種 Streptomyces rubiginosus (バクテリア)手法 中性子回折 / X線回折 / NUCLEAR REACTOR / 分子置換 / 解像度 : 1.8 Å 詳細データ登録者 Kovalevsky, A.Y. / Langan, P. 引用ジャーナル : Structure / 年 : 2010タイトル : Metal ion roles and the movement of hydrogen during reaction catalyzed by D-xylose isomerase: a joint x-ray and neutron diffraction study.著者 : Kovalevsky, A.Y. / Hanson, L. / Fisher, S.Z. / Mustyakimov, M. / Mason, S.A. / Forsyth, V.T. / Blakeley, M.P. / Keen, D.A. / Wagner, T. / Carrell, H.L. / Katz, A.K. / Glusker, J.P. / Langan, P. 履歴 登録 2009年10月21日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2010年6月16日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月27日 Group : Data collection改定 1.3 2018年4月25日 Group : Data collection / カテゴリ : diffrn_sourceItem : _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _diffrn_source.source / _diffrn_source.type改定 1.4 2018年6月20日 Group : Data collection / カテゴリ : diffrn_radiationItem : _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol / _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l改定 1.5 2020年7月29日 Group : Derived calculations / Structure summaryカテゴリ : chem_comp / entity ... chem_comp / entity / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item : _chem_comp.name / _entity.pdbx_description ... _chem_comp.name / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 1.6 2024年2月21日 Group : Data collection / Database references / Structure summaryカテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession改定 1.7 2024年4月3日 Group : Refinement description / カテゴリ : pdbx_initial_refinement_model
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