PDB-3k4m: Pyranose 2-oxidase Y456W mutant in complex with 2FG

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3k4m

タイトル

Pyranose 2-oxidase Y456W mutant in complex with 2FG

要素

Pyranose 2-oxidase

キーワード

OXIDOREDUCTASE / GMC OXIDOREDUCTASE / Y456W MUTANT / ROSSMANN FOLD / PHBH FOLD / HOMOTETRAMER / 8-ALPHA-(N3) HISTIDYL FLAVINYLATION

機能・相同性

機能・相同性情報

pyranose oxidase / pyranose oxidase activity / flavin adenine dinucleotide binding / periplasmic space
類似検索 - 分子機能

生物種

Trametes ochracea (菌類)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

フーリエ合成 / 解像度: 2.2 Å

データ登録者

Divne, C. / Tan, T.C.

引用

ジャーナル: Febs J. / 年: 2010
タイトル: Importance of the gating segment in the substrate-recognition loop of pyranose 2-oxidase.
著者: Spadiut, O. / Tan, T.C. / Pisanelli, I. / Haltrich, D. / Divne, C.

履歴

登録	2009年10月5日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2010年5月12日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 1.2	2014年11月12日	Group: Structure summary
改定 1.3	2017年11月1日	Group: Data collection / Refinement description / カテゴリ: diffrn_source / software / Item: _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site / _software.name
改定 1.4	2020年7月29日	Group: Advisory / Data collection / Derived calculations カテゴリ: chem_comp / database_PDB_caveat ...chem_comp / database_PDB_caveat / pdbx_chem_comp_identifier / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.type / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 1.5	2021年10月13日	Group: Database references / Structure summary / カテゴリ: chem_comp / database_2 / struct_ref_seq_dif Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details
改定 1.6	2023年9月6日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb3k4m.ent.gz	778.3 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	3k4m_validation.pdf.gz	2.4 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	3k4m_full_validation.pdf.gz	2.5 MB	表示
XML形式データ	3k4m_validation.xml.gz	194.1 KB	表示
CIF形式データ	3k4m_validation.cif.gz	264.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k4/3k4m ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/k4/3k4m	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	3k4jC 3k4kC 3k4lC 3k4nC 2igoS 1tt0 2igk 2igm 2ign 3bg6 S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	1tzl-1 4moe-d 3lsi-1 3lsh-d 2ign-1 4mom-d 4moj-d 3bg6-1 2igo-1 1tt0-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#77 - 2006年5月ブドウ糖酸化酵素 (Glucose Oxidase) 類似性 (2)

登録構造単位

A: Pyranose 2-oxidase

B: Pyranose 2-oxidase

C: Pyranose 2-oxidase

D: Pyranose 2-oxidase

E: Pyranose 2-oxidase

F: Pyranose 2-oxidase

G: Pyranose 2-oxidase

H: Pyranose 2-oxidase

ヘテロ分子

565 kDa, 8 ポリマー
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1

A: Pyranose 2-oxidase

B: Pyranose 2-oxidase

C: Pyranose 2-oxidase

D: Pyranose 2-oxidase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
282 kDa, 4 ポリマー
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2

E: Pyranose 2-oxidase

F: Pyranose 2-oxidase

G: Pyranose 2-oxidase

H: Pyranose 2-oxidase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
282 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	168.190, 103.140, 168.710
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 106.47, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質

Pyranose 2-oxidase / Pyranose oxidase

分子量: 69436.828 Da / 分子数: 8 / 変異: Y456W / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Trametes ochracea (菌類) / 遺伝子: p2o / プラスミド: PET21(D+) / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q7ZA32, pyranose oxidase

#2: 化合物

ChemComp-FAD / FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE / FAD

分子量: 785.550 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₇H₃₃N₉O₁₅P₂ / コメント: FAD*YM

#3: 糖

ChemComp-SHG / 2-deoxy-2-fluoro-beta-D-glucopyranose / 2-deoxy-2-fluoro-beta-D-glucose / 2-deoxy-2-fluoro-D-glucose / 2-deoxy-2-fluoro-glucose / 2-フルオロ-2-デオキシ-β-D-グルコピラノ-ス

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 182.147 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₁FO₅

#4: 化合物

ChemComp-MES / 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID / 2-モルホリノエタンスルホン酸

分子量: 195.237 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₃NO₄S / コメント: pH緩衝剤*YM

#5: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 1913 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.53 Å³/Da / 溶媒含有率: 51.31 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.2 詳細: 0.1M MES, 50MM MGCL2, 10% (W/V)% MONOMETHYLETHER PEG 2000, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: MAX II / ビームライン: I911-2 / 波長: 1.0379 Å
検出器	タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD / 日付: 2008年10月25日 / 詳細: MIRRORS
放射	モノクロメーター: BENT SI (111) CRYSTAL / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.0379 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.2→30 Å / Num. all: 273077 / Num. obs: 273077 / % possible obs: 97.2 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.7 % / R_sym value: 0.129 / Net I/σ(I): 7.6
反射シェル	解像度: 2.2→2.3 Å / 冗長度: 2.4 % / Mean I/σ(I) obs: 1.5 / Num. unique all: 32973 / R_sym value: 0.827 / % possible all: 94.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
MAR345		データ収集
REFMAC	5.5	精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
REFMAC	5.5	位相決定

精密化

構造決定の手法:

フーリエ合成
開始モデル: pdb entry 2IGO

2igo

解像度: 2.2→30 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.929 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.88 / SU B: 15.569 / SU ML: 0.179 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.257 / ESU R Free: 0.22 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.26553	2798	1 %	RANDOM
R_work	0.20707	-	-	-
all	0.20767	270272	-	-
obs	0.20767	270272	97.43 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 22.097 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.17 Å²	0 Å²	-0.11 Å²
2-	-	-0.2 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.02 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.2→30 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	36237	0	616	1913	38766

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.022	0.022	37829
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	32805
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	2.065	1.964	51473
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.87	3	76739
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	7.569	5	4586
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	38.305	24.47	1794
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	16.177	15	6041
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	16.352	15	216
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.167	0.2	5616
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.009	0.021	41886
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0	0.02	7538
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.835	1.5	22954
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.218	1.5	9212
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.439	2	37310
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	2.336	3	14875
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	3.604	4.5	14163
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 2.2→2.318 Å / Total num. of bins used: 10

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.358	428	-
R_work	0.306	38029	-
obs	-	-	94.88 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.7441	0.3361	-0.1029	0.7988	0.3527	0.9311	-0.0262	-0.0381	-0.034	0.0679	0.0477	0.0728	0.067	-0.043	-0.0214	0.1191	0.0077	0.0024	0.124	0.0052	0.1174	-16.1407	15.1909	105.2137
2	0.0774	-0.0153	-0.1089	0.1709	0.0943	0.203	-0.0095	0.0061	-0.0186	0.0023	0.0186	-0.0216	0.0433	0.0262	-0.0091	0.1077	0.0024	-0.0033	0.125	-0.0034	0.1206	2.1062	8.223	86.9283
3	0.8208	-0.3021	0.0167	0.6775	-0.1101	0.3616	-0.0174	-0.055	0.0363	0.0537	0.0299	-0.0118	-0.0144	-0.0042	-0.0125	0.1339	0.009	-0.0038	0.1421	-0.0197	0.089	9.6933	18.6587	113.3878
4	0.3186	-0.1848	0.0343	0.8504	-0.2869	0.4353	-0.0011	0.0077	-0.0339	-0.0216	0.0171	0.1128	0.0526	-0.111	-0.016	0.0958	-0.0023	0.001	0.12	-0.006	0.1159	-18.4882	19.2178	97.5559
5	0.7584	-0.3131	0.1299	0.8511	0.044	0.5989	0.083	0.0328	0.0301	-0.0622	-0.0383	-0.112	0.1147	0.0964	-0.0447	0.1108	-0.0357	0.0333	0.1452	-0.0489	0.1007	17.1739	10.8956	102.4046
6	0.3291	-0.4316	0.1352	1.305	-0.585	0.5273	-0.0112	-0.0571	-0.0469	0.1608	0.0179	-0.0291	0.0394	0.0635	-0.0067	0.1474	0.0069	-0.0189	0.1638	-0.0203	0.1227	22.307	3.6487	114.9843
7	2.0464	-1.4782	0.5501	2.3184	0.4893	0.7839	0.0686	0.3664	-0.142	0.0956	-0.3385	0.4609	0.0862	0.0143	0.2699	0.1701	0.0069	0.0141	0.2596	-0.0621	0.2589	16.1843	0.2934	96.468
8	0.4376	-0.2086	0.0728	0.3127	0.0189	0.2108	-0.0119	0.0005	0.0348	0.0084	0.011	-0.0044	-0.0059	0.0015	0.0009	0.0947	-0.0038	0.0015	0.0935	-0.0042	0.0953	2.9794	23.7146	96.8126
9	1.2322	0.3456	0.0115	1.1833	-0.0196	0.4918	-0.0132	-0.1273	0.0055	0.1774	-0.0007	0.0776	-0.026	-0.0179	0.0139	0.1772	0.0018	0.0141	0.133	0.0125	0.1235	-13.6273	-18.245	107.3765
10	0.2001	0.0674	-0.0657	0.1175	0.0361	0.1021	-0.0142	0.0157	0.0346	0.0162	0.0152	-0.022	-0.0072	0.0264	-0.001	0.1274	0.0019	-0.0029	0.1219	-0.0029	0.116	8.3769	-8.8752	94.2028
11	0.2581	0.0183	-0.0542	0.2872	-0.083	0.8547	-0.0037	0.0037	-0.0725	0.0372	0.0089	0.055	0.0515	-0.0763	-0.0051	0.0948	-0.0108	0.0028	0.1079	0.0036	0.1309	-15.2349	-19.1221	87.1231
12	0.5166	-0.0586	0.1051	0.8643	-0.556	0.3708	-0.0177	-0.0973	0.0307	0.1072	0.0001	-0.0203	-0.0443	-0.0093	0.0176	0.1729	0.01	-0.0122	0.1283	0.0007	0.1082	-0.7378	-25.8904	111.9471
13	0.4759	0.0852	-0.0638	0.7582	-0.2847	0.9211	-0.0268	0.0512	0.0455	0.0364	-0.0507	-0.1037	-0.0116	0.1063	0.0775	0.102	-0.0319	0.0226	0.1299	-0.0545	0.132	-1.1665	-14.8468	77.1931
14	0.634	-0.1654	0.1496	0.6091	-0.1504	0.5372	-0.0118	0.0447	0.0833	-0.0362	0.011	0.0502	-0.1006	-0.037	0.0008	0.12	-0.0093	0.0023	0.1314	-0.0016	0.1122	-14.46	-3.4279	66.2928
15	0.6006	-0.2978	0.5847	2.4322	-1.3595	1.864	0.1664	-0.2014	0.1525	0.5835	-0.3838	-0.2818	-0.2537	0.2375	0.2174	0.3159	-0.1378	-0.0139	0.323	-0.0168	0.1502	1.565	-1.5534	77.5404
16	0.1839	0.0459	0.0327	0.46	-0.2021	0.4699	0.0092	-0.0238	-0.0366	0.0509	0.0073	0.0141	0.0743	-0.0064	-0.0165	0.123	0.0035	-0.0035	0.1079	-0.0088	0.1207	-0.5126	-25.2553	90.1189
17	0.2363	0.1755	-0.0149	0.2039	-0.1211	0.1869	-0.0205	0.0527	0.006	-0.0204	0.0037	-0.0383	-0.0035	0.0815	0.0168	0.1433	0.0157	-0.0018	0.1813	-0.0181	0.148	46.6335	-0.9399	70.2859
18	0.205	0.0071	-0.048	0.3552	-0.0458	0.2547	-0.0033	0.0057	0.0596	-0.0101	0.0102	-0.0755	-0.0128	0.1121	-0.0068	0.1028	0.0025	-0.0116	0.1866	-0.0116	0.1457	49.8837	9.9631	77.6851
19	0.9232	0.0165	0.4403	0.4274	-0.299	0.4328	0.0455	0.112	-0.1243	-0.0861	-0.0335	-0.0663	0.0935	0.0985	-0.012	0.1525	0.0435	-0.0037	0.2032	-0.0165	0.1645	60.9531	-13.5574	77.4216
20	1.3379	-0.8122	0.4148	0.943	-0.291	0.5591	-0.015	-0.0937	-0.0743	0.0745	0.0692	0.0332	0.0007	0.0536	-0.0542	0.1229	-0.0356	-0.0054	0.1929	-0.0403	0.1197	41.3746	9.7434	86.9788
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62	0.3486	-0.1871	0.1696	0.6736	-0.5726	0.7049	-0.0003	-0.0305	-0.0244	0.0089	-0.0044	-0.0253	0.0502	0.0253	0.0046	0.1063	-0.0037	0.0025	0.1246	-0.0106	0.1131	130.4728	104.2856	35.6801
63	1.9802	-1.3835	0.7037	3.7096	1.8509	2.2559	0.2582	0.376	-0.1534	-0.2618	-0.4485	0.3557	-0.0059	-0.0708	0.1903	0.2065	0.0002	0	0.2688	-0.0207	0.1908	123.6658	102.6917	17.7247
64	0.4818	-0.2202	0.1367	0.4097	-0.0605	0.2168	-0.0171	-0.015	0.0495	0.0022	0.0084	0.0639	-0.0454	-0.0426	0.0087	0.1219	-0.0037	-0.0043	0.113	0.0022	0.1307	109.5333	126.5364	17.566

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	45 - 87
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	88 - 174
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	175 - 254
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	255 - 339
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	340 - 393
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	394 - 450
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	451 - 461
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	462 - 618
9	X-RAY DIFFRACTION	9	B	43 - 85
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	86 - 172
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	173 - 286
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	287 - 339
13	X-RAY DIFFRACTION	13	B	340 - 388
14	X-RAY DIFFRACTION	14	B	389 - 449
15	X-RAY DIFFRACTION	15	B	450 - 462
16	X-RAY DIFFRACTION	16	B	463 - 619
17	X-RAY DIFFRACTION	17	C	46 - 130
18	X-RAY DIFFRACTION	18	C	131 - 281
19	X-RAY DIFFRACTION	19	C	282 - 339
20	X-RAY DIFFRACTION	20	C	340 - 381
21	X-RAY DIFFRACTION	21	C	382 - 407
22	X-RAY DIFFRACTION	22	C	408 - 453
23	X-RAY DIFFRACTION	23	C	454 - 462
24	X-RAY DIFFRACTION	24	C	463 - 619
25	X-RAY DIFFRACTION	25	D	46 - 131
26	X-RAY DIFFRACTION	26	D	132 - 252
27	X-RAY DIFFRACTION	27	D	253 - 339
28	X-RAY DIFFRACTION	28	D	340 - 379
29	X-RAY DIFFRACTION	29	D	380 - 403
30	X-RAY DIFFRACTION	30	D	404 - 450
31	X-RAY DIFFRACTION	31	D	451 - 462
32	X-RAY DIFFRACTION	32	D	463 - 619
33	X-RAY DIFFRACTION	33	E	43 - 70
34	X-RAY DIFFRACTION	34	E	71 - 142
35	X-RAY DIFFRACTION	35	E	143 - 260
36	X-RAY DIFFRACTION	36	E	261 - 338
37	X-RAY DIFFRACTION	37	E	339 - 383
38	X-RAY DIFFRACTION	38	E	384 - 406
39	X-RAY DIFFRACTION	39	E	407 - 462
40	X-RAY DIFFRACTION	40	E	463 - 618
41	X-RAY DIFFRACTION	41	F	46 - 87
42	X-RAY DIFFRACTION	42	F	88 - 131
43	X-RAY DIFFRACTION	43	F	132 - 281
44	X-RAY DIFFRACTION	44	F	282 - 381
45	X-RAY DIFFRACTION	45	F	382 - 407
46	X-RAY DIFFRACTION	46	F	408 - 454
47	X-RAY DIFFRACTION	47	F	455 - 462
48	X-RAY DIFFRACTION	48	F	463 - 618
49	X-RAY DIFFRACTION	49	G	46 - 85
50	X-RAY DIFFRACTION	50	G	86 - 130
51	X-RAY DIFFRACTION	51	G	131 - 281
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57	X-RAY DIFFRACTION	57	H	46 - 121
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63	X-RAY DIFFRACTION	63	H	451 - 462
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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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