登録情報 | データベース: PDB / ID: 3i03 |
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タイトル | Crystal structure of bothropstoxin-I chemically modified by p-bromophenacyl bromide (BPB) - monomeric form at a high resolution |
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要素 | Phospholipase A2 homolog bothropstoxin-1 |
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キーワード | TOXIN / Lys49-PLA2s / Phospholipase homologue / bothropstoxin-I / p-bromophenacyl bromide / myotoxicity / Antibiotic / Antimicrobial / Disulfide bond / Myotoxin / Secreted |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
calcium-dependent phospholipase A2 activity / arachidonic acid secretion / phospholipid metabolic process / lipid catabolic process / negative regulation of T cell proliferation / phospholipid binding / heparin binding / toxin activity / defense response to bacterium / calcium ion binding / extracellular region類似検索 - 分子機能 Phospholipase A2, aspartic acid active site / Phospholipase A2 aspartic acid active site. / Phospholipase A2 / Phospholipase A2, histidine active site / Phospholipase A2 histidine active site. / Phospholipase A2 / Phospholipase A2 domain / Phospholipase A2 / Phospholipase A2 / Phospholipase A2 domain ...Phospholipase A2, aspartic acid active site / Phospholipase A2 aspartic acid active site. / Phospholipase A2 / Phospholipase A2, histidine active site / Phospholipase A2 histidine active site. / Phospholipase A2 / Phospholipase A2 domain / Phospholipase A2 / Phospholipase A2 / Phospholipase A2 domain / Phospholipase A2 domain superfamily / Up-down Bundle / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 ISOPROPYL ALCOHOL / p-Bromophenacyl bromide / Basic phospholipase A2 homolog bothropstoxin-I類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Bothrops jararacussu (ヘビ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.48 Å |
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データ登録者 | Marchi-Salvador, D.P. / Fernandes, C.A.H. / Soares, A.M. / Fontes, M.R.M. |
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引用 | ジャーナル: J.Struct.Biol. / 年: 2010 タイトル: Comparison between apo and complexed structures of bothropstoxin-I reveals the role of Lys122 and Ca(2+)-binding loop region for the catalytically inactive Lys49-PLA(2)s. 著者: Fernandes, C.A. / Marchi-Salvador, D.P. / Salvador, G.M. / Silva, M.C. / Costa, T.R. / Soares, A.M. / Fontes, M.R. |
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履歴 | 登録 | 2009年6月24日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2010年5月12日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年11月30日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2012年2月22日 | Group: Database references |
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改定 2.0 | 2019年11月27日 | Group: Advisory / Derived calculations ...Advisory / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_distant_solvent_atoms / pdbx_entity_nonpoly / struct_conn Item: _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight ..._chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.name / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag |
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改定 2.1 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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