登録情報 | データベース: PDB / ID: 3hfu |
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タイトル | Crystal structure of the ligand binding domain of E. coli CynR with its specific effector azide |
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要素 | HTH-type transcriptional regulator cynR |
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キーワード | TRANSCRIPTION / CynR / LysR transcriptional activiator / effector / azide / Activator / Cytoplasm / DNA-binding / Repressor / Transcription regulation |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
protein-DNA complex / DNA-binding transcription factor activity / regulation of DNA-templated transcription / DNA binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 HTH-type transcriptional regulator CynR, PBP2 domain / D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 - #290 / LysR, substrate-binding / LysR substrate binding domain / LysR-type HTH domain profile. / Transcription regulator HTH, LysR / Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family / D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily ...HTH-type transcriptional regulator CynR, PBP2 domain / D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 - #290 / LysR, substrate-binding / LysR substrate binding domain / LysR-type HTH domain profile. / Transcription regulator HTH, LysR / Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family / D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 AZIDE ION / HTH-type transcriptional regulator CynR類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.6 Å |
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データ登録者 | Singer, A.U. / Evdokimova, E. / Kagan, O. / Dong, A. / Edwards, A.M. / Savchenko, A. |
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引用 | ジャーナル: TO BE PUBLISHED タイトル: Crystal structure of the ligand binding domain of E. coli CynR with its specific effector azide 著者: Singer, A.U. / Evdokimova, E. / Kagan, O. / Cuff, M.E. / Edwards, A.M. / Joachimiak, A. / Savchenko, A. |
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履歴 | 登録 | 2009年5月12日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2009年6月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2023年9月6日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.3 | 2023年11月22日 | Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2 |
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