登録情報 | データベース: PDB / ID: 3h5k |
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タイトル | Crystal structure of the ribosome inactivating protein PDL1 |
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要素 | Ribosome-inactivating protein PD-L1/PD-L2 |
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キーワード | HYDROLASE / protein / ribosome inactivation / Disulfide bond / Glycoprotein / Plant defense / Protein synthesis inhibitor / Toxin |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
rRNA N-glycosylase / rRNA N-glycosylase activity / defense response / toxin activity / negative regulation of translation類似検索 - 分子機能 Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / Ribosome-inactivating protein conserved site / Shiga/ricin ribosomal inactivating toxins active site signature. / Ribosome-inactivating protein type 1/2 / Ribosome-inactivating protein / Ribosome-inactivating protein, subdomain 1 / Ribosome-inactivating protein, subdomain 2 ...Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / Ribosome-inactivating protein conserved site / Shiga/ricin ribosomal inactivating toxins active site signature. / Ribosome-inactivating protein type 1/2 / Ribosome-inactivating protein / Ribosome-inactivating protein, subdomain 1 / Ribosome-inactivating protein, subdomain 2 / Ribosome-inactivating protein superfamily / Ribosome inactivating protein / Few Secondary Structures / Irregular / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Phytolacca dioica (植物) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.45 Å |
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データ登録者 | Ruggiero, A. / Di Maro, A. / Severino, V. / Chambery, A. / Berisio, R. |
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引用 | ジャーナル: Biopolymers / 年: 2009 タイトル: Crystal structure of PD-L1, a ribosome inactivating protein from Phytolacca dioica L. Leaves with the property to induce DNA cleavage 著者: Ruggiero, A. / Di Maro, A. / Severino, V. / Chambery, A. / Berisio, R. |
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履歴 | 登録 | 2009年4月22日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2009年10月13日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Non-polymer description / Version format compliance |
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改定 1.2 | 2020年7月29日 | Group: Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _chem_comp.type ..._chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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