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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3h3x | ||||||
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タイトル | Structure of the V74M large subunit mutant of NI-FE hydrogenase in an oxidized state | ||||||
要素 | (Periplasmic [NiFe] hydrogenase ...) x 2 | ||||||
キーワード | OXIDOREDUCTASE / NI-FE HYDROGENASE TUNNEL MUTANT / NICKEL / IRON / Iron-sulfur / Metal-binding | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 cytochrome-c3 hydrogenase / cytochrome-c3 hydrogenase activity / [Ni-Fe] hydrogenase complex / ferredoxin hydrogenase complex / ferredoxin hydrogenase activity / anaerobic respiration / 3 iron, 4 sulfur cluster binding / nickel cation binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / periplasmic space ...cytochrome-c3 hydrogenase / cytochrome-c3 hydrogenase activity / [Ni-Fe] hydrogenase complex / ferredoxin hydrogenase complex / ferredoxin hydrogenase activity / anaerobic respiration / 3 iron, 4 sulfur cluster binding / nickel cation binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / periplasmic space / electron transfer activity / membrane / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Desulfovibrio fructosovorans (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.7 Å | ||||||
データ登録者 | Volbeda, A. / Martinez, N. / Martin, L. / Fontecilla-Camps, J.C. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2009 タイトル: Introduction of methionines in the gas channel makes [NiFe] hydrogenase aero-tolerant 著者: Dementin, S. / Leroux, F. / Cournac, L. / de Lacey, A.L. / Volbeda, A. / Leger, C. / Burlat, B. / Martinez, N. / Champ, S. / Martin, L. / Sanganas, O. / Haumann, M. / Fernandez, V.M. / ...著者: Dementin, S. / Leroux, F. / Cournac, L. / de Lacey, A.L. / Volbeda, A. / Leger, C. / Burlat, B. / Martinez, N. / Champ, S. / Martin, L. / Sanganas, O. / Haumann, M. / Fernandez, V.M. / Guigliarelli, B. / Fontecilla-Camps, J.C. / Rousset, M. #1: ジャーナル: Nat.Struct.Biol. / 年: 1997 タイトル: Gas access to the active site of Ni-Fe hydrogenases probed by X-ray crystallography and molecular dynamics 著者: Montet, Y. / Amara, P. / Volbeda, A. / Vernede, X. / Hatchikian, E.C. / Field, M.J. / Frey, M. / Fontecilla-Camps, J.C. #2: ジャーナル: INT.J.HYDROGEN ENERGY / 年: 2002 タイトル: High-resolution crystallographic analysis of Desulfovibrio fructosovorans [NiFe] hydrogenase 著者: Volbeda, A. / Montet, Y. / Vernede, X. / Hatchikian, E.C. / Fontecilla-Camps, J.C. #3: ジャーナル: J.BIOL.INORG.CHEM. / 年: 2005 タイトル: Structural differences between the ready and unready oxidized states of [NiFe] hydrogenases 著者: Volbeda, A. / Martin, L. / Cavazza, C. / Matho, M. / Faber, B.W. / Roseboom, W. / Albracht, S.P. / Garcin, E. / Rousset, M. / Fontecilla-Camps, J.C. #4: ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.Usa / 年: 2008 タイトル: Experimental approaches to kinetics of gas diffusion in hydrogenase 著者: Leroux, F. / Dementin, S. / Burlat, B. / Cournac, L. / Volbeda, A. / Champ, S. / Martin, L. / Guigliarelli, B. / Bertrand, P. / Fontecilla-Camps, J.C. / Rousset, M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 3h3x.cif.gz | 472.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb3h3x.ent.gz | 381.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 3h3x.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 3h3x_validation.pdf.gz | 528.8 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 3h3x_full_validation.pdf.gz | 549.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | 3h3x_validation.xml.gz | 85.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 3h3x_validation.cif.gz | 120 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/h3/3h3x ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/h3/3h3x | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 1yqwS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
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