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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3h1o | ||||||
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Title | The Structure of Fluorescent Protein FP480 | ||||||
![]() | Fluorescent protein FP480 | ||||||
![]() | FLUORESCENT PROTEIN / OD-structure / order-disorder structure | ||||||
Function / homology | Green Fluorescent Protein / Green fluorescent protein / Green fluorescent protein-related / Green fluorescent protein / Green fluorescent protein / bioluminescence / Beta Barrel / Mainly Beta / Fluorescent protein FP480![]() | ||||||
Biological species | ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Pletnev, S. / Morozova, K.S. / Verkhusha, V.V. / Dauter, Z. | ||||||
![]() | ![]() Title: Rotational order-disorder structure of fluorescent protein FP480 Authors: Pletnev, S. / Morozova, K.S. / Verkhusha, V.V. / Dauter, Z. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 103.7 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 84.8 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 453.2 KB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 457.3 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 21.5 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 29.7 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 |
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Unit cell |
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Components
#1: Protein | Mass: 26336.914 Da / Num. of mol.: 2 Source method: isolated from a genetically manipulated source Source: (gene. exp.) ![]() ![]() ![]() #2: Chemical | ChemComp-GOL / #3: Water | ChemComp-HOH / | |
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-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 2.47 Å3/Da / Density % sol: 50.27 % |
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Crystal grow | Temperature: 293 K / Method: vapor diffusion, hanging drop / pH: 3.5 Details: 80mM citric acid, 20% PEG 3350, pH 3.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K |
-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 100 K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Diffraction source | Source: ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Detector | Type: MARMOSAIC 300 mm CCD / Detector: CCD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Radiation | Protocol: SINGLE WAVELENGTH / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Radiation wavelength | Wavelength: 1 Å / Relative weight: 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reflection | Resolution: 2→30 Å / Num. obs: 34954 / % possible obs: 100 % / Redundancy: 4.2 % / Rmerge(I) obs: 0.075 / Χ2: 1.111 / Net I/σ(I): 16.995 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reflection shell |
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Processing
Software |
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Refinement | Method to determine structure: ![]()
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Solvent computation | Bsol: 61.601 Å2 / ksol: 0.372 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Displacement parameters | Biso max: 164.15 Å2 / Biso mean: 39.835 Å2 / Biso min: 17.16 Å2
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Refinement step | Cycle: LAST / Resolution: 2→29.21 Å
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Refine LS restraints |
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LS refinement shell |
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