ソフトウェア | 名称 | 分類 |
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CrystalClear | データ収集 | CNS | 精密化 | CrystalClear | データ削減 | CrystalClear | データスケーリング | CNS | 位相決定 |
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精密化 | 構造決定の手法: フーリエ合成 / 解像度: 2.75→27.85 Å / Rfactor Rfree error: 0.009 / Data cutoff high absF: 54013.67 / Data cutoff low absF: 0 / Isotropic thermal model: RESTRAINED / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / 詳細: BULK SOLVENT MODEL USED
| Rfactor | 反射数 | %反射 | Selection details |
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Rfree | 0.243 | 694 | 7.5 % | RANDOM |
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Rwork | 0.218 | - | - | - |
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obs | 0.218 | 9221 | 97.6 % | - |
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: FLAT MODEL / Bsol: 54.6298 Å2 / ksol: 0.35 e/Å3 |
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原子変位パラメータ | Biso mean: 74.8 Å2
| Baniso -1 | Baniso -2 | Baniso -3 |
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1- | -11.57 Å2 | 0 Å2 | 0 Å2 |
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2- | - | -11.57 Å2 | 0 Å2 |
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3- | - | - | 23.14 Å2 |
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Refine analyze | | Free | Obs |
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Luzzati coordinate error | 0.48 Å | 0.51 Å |
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Luzzati d res low | - | 5 Å |
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Luzzati sigma a | 0.68 Å | 0.72 Å |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.75→27.85 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
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原子数 | 0 | 1334 | 32 | 0 | 1366 |
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拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal |
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X-RAY DIFFRACTION | c_bond_d0.007 | X-RAY DIFFRACTION | c_angle_deg1.3 | X-RAY DIFFRACTION | c_dihedral_angle_d17.2 | X-RAY DIFFRACTION | c_improper_angle_d1.73 | | | | |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.75→2.85 Å / Rfactor Rfree error: 0.05 / Total num. of bins used: 6
| Rfactor | 反射数 | %反射 |
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Rfree | 0.521 | 107 | 7.1 % |
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Rwork | 0.527 | 1394 | - |
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obs | - | - | 98.8 % |
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Xplor file | Refine-ID | Serial no | Param file | Topol file |
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X-RAY DIFFRACTION | 1 | dna-rnaATT | protein.topX-RAY DIFFRACTION | 2 | cobalt.par | | |
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