登録情報 | データベース: PDB / ID: 3g10 |
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タイトル | Structure of S. pombe Pop2p - Mg2+ and Mn2+ bound form |
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要素 | CCR4-Not complex subunit Caf1 |
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キーワード | Hydrolase / Gene Regulation / mRNA turnover / deadenylation / Ccr4-Not / Pop2p / Caf1p / DEDD exonuclease |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
poly(A)-specific ribonuclease / poly(A)-specific ribonuclease activity / CCR4-NOT core complex / CCR4-NOT complex / nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening / regulatory ncRNA-mediated gene silencing / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay / RNA nuclease activity / P-body / manganese ion binding ...poly(A)-specific ribonuclease / poly(A)-specific ribonuclease activity / CCR4-NOT core complex / CCR4-NOT complex / nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening / regulatory ncRNA-mediated gene silencing / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay / RNA nuclease activity / P-body / manganese ion binding / chromatin binding / mRNA binding / zinc ion binding / nucleus / metal ion binding / cytosol類似検索 - 分子機能 CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8/Pop2 / Ribonuclease CAF1 / CAF1 family ribonuclease / Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H / Nucleotidyltransferase; domain 5 / Ribonuclease H superfamily / Ribonuclease H-like superfamily / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_yeast.gif) Schizosaccharomyces pombe (分裂酵母) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.597 Å |
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データ登録者 | Andersen, K.R. / Jonstrup, A.T. / Van, L.B. / Brodersen, D.E. |
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引用 | ジャーナル: Rna / 年: 2009 タイトル: The activity and selectivity of fission yeast Pop2p are affected by a high affinity for Zn2+ and Mn2+ in the active site 著者: Andersen, K.R. / Jonstrup, A.T. / Van, L.B. / Brodersen, D.E. |
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履歴 | 登録 | 2009年1月29日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2009年3月31日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年11月1日 | Group: Data collection / Refinement description / カテゴリ: diffrn_source / software / Item: _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site |
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改定 1.3 | 2023年11月1日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR DETERMINED |
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Remark 700 | SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR DETERMINED |
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