登録情報 データベース : PDB / ID : 3fm6 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal Structure Analysis of Fungal Versatile Peroxidase from Pleurotus eryngii 要素Versatile peroxidase VPL2 詳細 キーワード OXIDOREDUCTASE / CLASS II (FUNGAL) PEROXIDASES / protoporphyrin IX / ELECTRON TRANSFER / LIGNIN PEROXIDASE / LIGNIN DEGRADATION / MANGANESE PEROXIDASE / MN-INDEPENDENT OXIDATION PHENOLIC NON-PHENOLIC AROMATICS / MNII OXIDATION / PEROXIDASE / POLYVALENT PEROXIDASE / Heme / Hydrogen peroxide / Iron / Manganese / Metal-binding / Secreted / Zymogen機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
versatile peroxidase / reactive-black-5:hydrogen-peroxide oxidoreductase activity / manganese peroxidase activity / lignin catabolic process / response to reactive oxygen species / hydrogen peroxide catabolic process / cellular response to oxidative stress / heme binding / extracellular region / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 Fungal ligninase / Fungal ligninase, C-terminal / Fungal peroxidase extension region / Heme-binding peroxidase Ccp1-like / Peroxidase; domain 2 / Peroxidase, domain 2 / Peroxidase; domain 1 - #10 / Peroxidase; domain 1 / Peroxidases heam-ligand binding site / Peroxidase, active site ... Fungal ligninase / Fungal ligninase, C-terminal / Fungal peroxidase extension region / Heme-binding peroxidase Ccp1-like / Peroxidase; domain 2 / Peroxidase, domain 2 / Peroxidase; domain 1 - #10 / Peroxidase; domain 1 / Peroxidases heam-ligand binding site / Peroxidase, active site / Peroxidases active site signature. / Plant heme peroxidase family profile. / Haem peroxidase / Peroxidase / Peroxidases proximal heme-ligand signature. / Haem peroxidase superfamily / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha 類似検索 - ドメイン・相同性 : / PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / Versatile peroxidase VPL2 類似検索 - 構成要素生物種 Pleurotus eryngii (菌類)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.13 Å 詳細データ登録者 Piontek, K. / Martinez, A.T. / Choinowski, T. / Plattner, D.A. 引用ジャーナル : To be Published タイトル : Structural and Site-directed Mutagenesis Study of Versatile Peroxidase Oxidizing both Mn(II) and Aromatic Substrates著者 : Piontek, K. / Choinowski, T. / Perez-Boada, M. / Ruiz-Duenas, F.J. / Martinez, M.J. / Plattner, D.A. / Martinez, A.T. 履歴 登録 2008年12月19日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2009年12月22日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Non-polymer description / Version format compliance改定 1.2 2021年11月10日 Group : Database references / Derived calculationsカテゴリ : database_2 / pdbx_struct_conn_angle ... database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.3 2023年11月1日 Group : Data collection / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
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