登録情報 | データベース: PDB / ID: 3dr7 |
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タイトル | GDP-perosamine synthase from Caulobacter crescentus with bound GDP-3-deoxyperosamine |
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要素 | Putative perosamine synthetase |
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キーワード | TRANSFERASE / perosamine / pyridoxal phosphate / o-antigen / lipopolysaccharide / aspartate aminotransferase / deoxysugar |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
GDP-perosamine synthase / GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose-4-aminotransferase activity / O antigen biosynthetic process / pyridoxal phosphate binding類似検索 - 分子機能 DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase / DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / Alpha-Beta Complex ...DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase / DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / Alpha-Beta Complex / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-GPD / GDP-perosamine synthase / GDP-perosamine synthase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Caulobacter crescentus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / フーリエ合成 / 解像度: 1.7 Å |
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データ登録者 | Holden, H.M. / Cook, P.D. / Carney, A.E. |
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引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2008 タイトル: Accommodation of GDP-linked sugars in the active site of GDP-perosamine synthase 著者: Cook, P.D. / Carney, A.E. / Holden, H.M. |
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履歴 | 登録 | 2008年7月10日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2008年10月14日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2017年5月3日 | Group: Non-polymer description |
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改定 1.3 | 2017年5月17日 | Group: Source and taxonomy |
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改定 1.4 | 2023年8月30日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.5 | 2023年11月15日 | Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2 |
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