登録情報 | データベース: PDB / ID: 3dr4 |
---|
タイトル | GDP-perosamine synthase K186A mutant from Caulobacter crescentus with bound sugar ligand |
---|
要素 | Putative perosamine synthetase |
---|
キーワード | TRANSFERASE / Perosamine / deoxysugar / pyridoxal phosphate / aspartate aminotransferase / o-antigen |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
GDP-perosamine synthase / GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose-4-aminotransferase activity / O antigen biosynthetic process / pyridoxal phosphate binding類似検索 - 分子機能 DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase / DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / Alpha-Beta Complex ...DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase / DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase, domain 1 / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / Alpha-Beta Complex / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-G4M / GDP-perosamine synthase / GDP-perosamine synthase類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | Caulobacter crescentus (バクテリア) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.6 Å |
---|
データ登録者 | Holden, H.M. / Cook, P.D. / Carney, A.E. |
---|
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2008 タイトル: Accommodation of GDP-linked sugars in the active site of GDP-perosamine synthase 著者: Cook, P.D. / Carney, A.E. / Holden, H.M. |
---|
履歴 | 登録 | 2008年7月10日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2008年10月14日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
---|
改定 1.2 | 2021年7月28日 | Group: Database references / Derived calculations ...Database references / Derived calculations / Refinement description / Source and taxonomy カテゴリ: entity_src_gen / refine ...entity_src_gen / refine / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id / _refine.ls_percent_reflns_obs ..._entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id / _refine.ls_percent_reflns_obs / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
---|
改定 1.3 | 2021年10月20日 | Group: Database references / カテゴリ: database_2 / struct_ref_seq_dif Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details |
---|
改定 1.4 | 2023年8月30日 | Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model |
---|
|
---|