登録情報 データベース : PDB / ID : 3dck 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル X-ray structure of D25N chemical analogue of HIV-1 protease complexed with ketomethylene isostere inhibitor 要素Chemical analogue HIV-1 protease 詳細 キーワード HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / HIV-1 protease / homodimer / beta-turns / beta-strand / HYDROLASE / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
aspartic-type endopeptidase activity / proteolysis 類似検索 - 分子機能 Retropepsin-like catalytic domain / Retropepsins / Retroviral aspartyl protease / Aspartyl protease, retroviral-type family profile. / Peptidase A2A, retrovirus, catalytic / Cathepsin D, subunit A; domain 1 / Acid Proteases / Aspartic peptidase, active site / Eukaryotic and viral aspartyl proteases active site. / Aspartic peptidase domain superfamily ... Retropepsin-like catalytic domain / Retropepsins / Retroviral aspartyl protease / Aspartyl protease, retroviral-type family profile. / Peptidase A2A, retrovirus, catalytic / Cathepsin D, subunit A; domain 1 / Acid Proteases / Aspartic peptidase, active site / Eukaryotic and viral aspartyl proteases active site. / Aspartic peptidase domain superfamily / Beta Barrel / Mainly Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 (2S)-2-{[(2R,5S)-5-{[(2S,3S)-2-{[(2S,3R)-2-(ACETYLAMINO)-3-HYDROXYBUTANOYL]AMINO}-3-METHYLPENTANOYL]AMINO}-2-BUTYL-4-OXONONANOYL]AMINO}-N~1~-[(2S)-1-AMINO-5-CARBAMIMIDAMIDO-1-OXOPENTAN-2-YL]PENTANEDIAMIDE / Chem-KVI / Protease 類似検索 - 構成要素手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.8 Å 詳細データ登録者 Torbeev, V.Y. / Mandal, K. / Terechko, V.A. / Kent, S.B.H. 引用ジャーナル : Bioorg.Med.Chem.Lett. / 年 : 2008タイトル : Crystal structure of chemically synthesized HIV-1 protease and a ketomethylene isostere inhibitor based on the p2/NC cleavage site著者 : Torbeev, V.Y. / Mandal, K. / Terechko, V.A. / Kent, S.B.H. 履歴 登録 2008年6月3日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2008年8月19日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Advisory / Version format compliance改定 1.2 2013年10月16日 Group : Non-polymer description改定 1.3 2017年10月25日 Group : Refinement description / カテゴリ : software改定 1.4 2023年11月1日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_sheet / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_sheet.number_strands / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.5 2023年11月15日 Group : Data collection / カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item : _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2改定 1.6 2024年3月20日 Group : Source and taxonomy / Structure summary / カテゴリ : entity / pdbx_entity_src_syn / Item : _entity.details
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