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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3cw3 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of AIM1g1 | ||||||
![]() | Absent in melanoma 1 protein | ||||||
![]() | ONCOPROTEIN / beta gamma-crystallin / greek key / tryptophan corner / Lectin | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Aravind, P. / Sankaranarayanan, R. / Sharma, Y. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Exploring the limits of sequence and structure in a variant betagamma-crystallin domain of the protein absent in melanoma-1 (AIM1). 著者: Aravind, P. / Wistow, G. / Sharma, Y. / Sankaranarayanan, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 32.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 21.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10817.207 Da / 分子数: 1 / 断片: non-lens vertebrate beta-gamma-crystallin domain / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-GOL / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.4 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.78 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 1.3-1.5M NaCitrate;0.1M HepesNa 7.5; 3%isopropanol (or)0.4M NaCl, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2006年4月4日 / 詳細: OSMIC |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.88→25 Å / Num. obs: 8382 / % possible obs: 99.6 % / 冗長度: 4.6 % / Rsym value: 0.097 / Net I/σ(I): 13.8 |
反射 シェル | 解像度: 1.88→1.95 Å / 冗長度: 3.2 % / Mean I/σ(I) obs: 1.9 / Num. unique all: 810 / Rsym value: 0.444 / % possible all: 96.8 |
-位相決定
位相決定 | 手法: ![]() |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | Bsol: 57.807 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 22.101 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.88→25 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.88→1.97 Å /
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Xplor file |
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