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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3cox | |||||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF CHOLESTEROL OXIDASE COMPLEXED WITH A STEROID SUBSTRATE. IMPLICATIONS FOR FAD DEPENDENT ALCOHOL OXIDASES | |||||||||
![]() | CHOLESTEROL OXIDASE | |||||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE(OXYGEN RECEPTOR) | |||||||||
機能・相同性 | ![]() cholesterol oxidase / cholesterol oxidase activity / steroid Delta-isomerase / steroid delta-isomerase activity / cholesterol catabolic process / flavin adenine dinucleotide binding / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Vrielink, A. / Li, J. / Brick, P. / Blow, D.M. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of cholesterol oxidase complexed with a steroid substrate: implications for flavin adenine dinucleotide dependent alcohol oxidases. 著者: Li, J. / Vrielink, A. / Brick, P. / Blow, D.M. #1: ![]() タイトル: Crystal Structure of Cholesterol Oxidase from Brevibacterium Sterolicum Refined at 1.8 Angstroms Resolution 著者: Vrielink, A. / Lloyd, L.F. / Blow, D.M. #2: ![]() タイトル: Sequence of Gene Chob Encoding Cholesterol Oxidase of Brevibacterium Sterolicum: Comparison with Choa of Streptomyces Sp. Sa-Coo 著者: Ohta, T. / Fujishiro, K. / Yamaguchi, K. / Tamura, Y. / Aisaka, K. / Uwajima, T. / Hasegawa, M. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 116.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 88.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 54891.742 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P22637, cholesterol oxidase |
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#2: 化合物 | ChemComp-FAD / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
構成要素の詳細 | THE STRUCTURE CONTAINS AN FAD COFACTOR IN THE OXIDIZED FORM. THE FLAVIN RING SYSTEM OF THE FAD ...THE STRUCTURE CONTAINS AN FAD COFACTOR IN THE OXIDIZED FORM. THE FLAVIN RING SYSTEM OF THE FAD MOLECULE ADOPTS A SLIGHTLY TWISTED CONFORMATI |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.3 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.48 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 18 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / Num. obs: 46364 / % possible obs: 97.6 % / Num. measured all: 175309 / Rmerge(I) obs: 0.066 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.8→10 Å / Rfactor Rwork: 0.156 / Rfactor obs: 0.156 / σ(F): 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.8→10 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. reflection all: 45729 / σ(F): 0 / Rfactor all: 0.156 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 19.4 Å2 |