PDB-3co2: Mlotik1 ion channel cyclic-nucleotide binding domain mutant

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3co2

タイトル

Mlotik1 ion channel cyclic-nucleotide binding domain mutant

要素

Mlotik1 ion channel protein

キーワード

MEMBRANE PROTEIN / Mlotik1 cyclic-nucleotide binding domain mutant3 R307W / unliganded

機能・相同性

機能・相同性情報

intracellular cyclic nucleotide activated cation channel complex / intracellularly cGMP-activated cation channel activity / intracellularly cAMP-activated cation channel activity / potassium channel activity / cGMP binding / cAMP binding / protein-containing complex binding / identical protein binding / plasma membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Mesorhizobium loti (根粒菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン / 解像度: 2.9 Å

データ登録者

Clayton, G.M. / Alteiri, S.L. / Thomas, L.R. / Morais-Cabral, J.H.

引用

ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2008
タイトル: Structural and Energetic Analysis of Activation by a Cyclic Nucleotide Binding Domain.
著者: Altieri, S.L. / Clayton, G.M. / Silverman, W.R. / Olivares, A.O. / De La Cruz, E.M. / Thomas, L.R. / Morais-Cabral, J.H.

履歴

登録	2008年3月27日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2008年8月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 1.2	2017年10月25日	Group: Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.date / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version
改定 1.3	2021年10月20日	Group: Database references / カテゴリ: database_2 / struct_ref_seq_dif Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details
改定 1.4	2024年2月21日	Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3co2.cif.gz	101 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3co2.ent.gz	79 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3co2.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/co/3co2 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/co/3co2	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	3cl1C 3clpC 1u12 1vp6 3beh C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6all-d 3vok-1 6mb8-d 2g06-d 2a9m-d 6rr5-d 3d57-d 6rqy-d 6mb5-1 5vj0-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#152 - 2012年8月環状AMP依存性タンパク質リン酸化酵素 (cAMP-dependent Protein Kinase) 類似性 (8) #48 - 2003年12月異化活性化タンパク質 (Catabolite Activator Protein) 類似性 (8) #251 - 2020年11月アデニリルシクラーゼ (Adenylyl Cyclase) 類似性 (7)

登録構造単位

A: Mlotik1 ion channel protein

B: Mlotik1 ion channel protein

C: Mlotik1 ion channel protein

D: Mlotik1 ion channel protein

59.5 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	111.473, 132.349, 39.822
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	18
Space group name H-M	P2₁2₁2

#1: タンパク質	Mlotik1 ion channel protein 分子量: 14868.108 Da / 分子数: 4 断片: cyclic-nucleotide binding domain (UNP residues 216-355) 変異: R307W / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mesorhizobium loti (根粒菌) / プラスミド: pGEX2T / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q98GN8
#2: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 9 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

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実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.47 Å³/Da / 溶媒含有率: 50.2 %
結晶化	手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: ammoinium sulfate, Nacitrate, NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP

-
データ収集

放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: NSLS / ビームライン: X29A / 波長: 0.9 Å
検出器	日付: 2007年4月1日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.55→50 Å / Num. obs: 19637 / % possible obs: 97.9 % / 冗長度: 4.6 % / R_merge(I) obs: 0.079
反射シェル	解像度: 2.55→2.64 Å / 冗長度: 3.7 % / R_merge(I) obs: 0.612 / % possible all: 89.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
REFMAC		精密化
PDB_EXTRACT	3.005	データ抽出

精密化

解像度: 2.9→41.03 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.891 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.854 / SU B: 45.938 / SU ML: 0.405 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.471 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.30605	694	5.1 %	RANDOM
R_work	0.26078	-	-	-
obs	0.26313	12958	99.34 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 11.55 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	1.89 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-3.76 Å²	0 Å²
3-	-	-	1.87 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.9→41.03 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	3510	0	0	9	3519

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.006	0.022	3582
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	0.953	1.962	4913
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	4.703	5	498
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	33.925	22.692	104
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	15.485	15	459
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	19.058	15	17
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.055	0.2	607
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.002	0.02	2692
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.185	0.2	1558
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.299	0.2	2528
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.118	0.2	80
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.171	0.2	27
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.133	0.2	2
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.15	1.5	2532
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.177	2	3957
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	0.401	3	1178
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	0.613	4.5	956
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

LS精密化シェル

解像度: 2.9→2.975 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.383	44	-
R_work	0.353	952	-
obs	-	-	99.5 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	15.5426	2.3175	15.2398	17.982	2.5079	14.946	-0.6588	-0.903	-2.0321	-0.9786	0.3579	1.2183	0.4995	0.0735	0.3009	0.2628	0.0161	0.015	0.0141	0.1456	0.8181	-32.6982	16.8632	-17.6007
2	12.4592	-5.8769	-1.2804	2.772	0.604	0.1316	0.1518	-1.2353	-0.314	0.5598	-0.1565	0.2418	-0.1497	0.1433	0.0046	0.3518	-0.1058	-0.0433	0.3688	0.0584	0.6462	-36.9599	27.204	-10.7659
3	16.1802	3.7896	-9.2738	3.4563	-3.125	9.1933	-0.4027	0.9317	-0.1851	-0.3002	0.1707	0.6939	-0.335	-1.355	0.232	0.3564	-0.0266	-0.1019	0.0623	-0.0228	0.5165	-38.1417	22.863	-21.3351
4	10.7338	-7.0869	-4.8847	11.1899	4.355	2.419	0.0782	0.2741	1.3559	-1.3157	0.434	0.5003	0.3301	-0.3783	-0.5123	0.6571	-0.0275	-0.1008	0.4087	0.0735	0.5561	-32.2722	37.8201	-31.6641
5	5.7023	0.9253	-6.8176	0.1502	-1.1063	8.151	0.2158	-0.5006	0.6087	-0.4175	0.8708	0.0719	0.4	-1.4793	-1.0866	0.3303	-0.017	-0.0867	0.1177	0.0517	0.3816	-33.0341	30.1609	-23.2421
6	9.7419	6.4395	3.5122	10.0943	14.7152	27.5782	0.9556	-0.5095	-0.2565	-1.8514	-1.7004	0.9811	-1.6805	1.4128	0.7448	0.1954	0.0532	0.1221	0.2845	-0.1183	0.4495	-22.9433	34.6998	-26.0387
7	10.7744	-0.7784	-1.3607	23.6669	1.5445	6.6866	-1.1951	1.0414	0.8412	-1.1457	0.789	-1.1317	-1.1973	0.5114	0.4061	0.3618	-0.0997	-0.1608	0.3708	-0.0378	0.3216	-23.9911	36.9903	-21.6636
8	8.0438	12.6313	-0.8017	19.835	-1.259	0.0799	0.488	1.3601	0.6589	1.2465	1.0035	2.5392	-1.7062	1.2588	-1.4916	0.4958	-0.0249	0.144	0.7591	0.208	1.3815	-40.3094	39.7408	-20.2304
9	27.8449	-7.183	4.7653	30.6845	-14.3086	6.7489	-1.6064	1.1132	-0.2468	1.0204	0.668	1.8173	-0.1272	-0.3269	0.9383	0.3868	-0.157	0.0569	0.2222	-0.0863	0.3847	-28.9086	39.4176	-28.0614
10	9.0942	2.0592	-3.623	0.4663	-0.8331	4.6386	1.9444	0.7934	0.7274	-0.9757	-0.9324	0.1538	-0.7577	-0.4799	-1.012	0.409	0.0914	-0.0022	0.058	0.0477	0.5074	-33.1306	28.233	-26.2535
11	12.5355	-11.8038	-1.4491	27.5425	-6.0726	3.5345	0.7248	0.6688	1.5195	-0.0236	-0.2314	-0.0905	0.6535	-3.6806	-0.4934	0.1334	-0.0169	0.0454	0.6225	0.0214	0.641	-48.6186	28.9354	-18.527
12	9.5136	-8.6451	-2.8492	12.1874	-5.8644	17.3514	-0.5253	-1.6738	0.0074	1.144	-0.3002	-0.4422	-0.651	0.9796	0.8256	0.247	0.0329	-0.1886	0.3645	0.1192	0.7864	-48.3227	34.8355	-11.1633
13	40.8595	20.6181	20.2641	10.4893	10.1744	10.0805	-0.728	-0.9906	0.867	0.8059	-2.0307	0.4348	0.3751	-0.5943	2.7587	0.8854	0.0893	-0.0154	0.399	0.1762	0.6044	-33.5354	15.3777	-5.0463
14	5.0573	-0.5708	-1.8919	2.2927	-2.6138	4.2953	0.1791	-0.0807	0.5593	-0.0413	-0.1918	-0.3412	-0.1718	0.0891	0.0127	0.2066	-0.0561	-0.0483	0.1584	0.0494	0.2405	-36.816	5.5055	-12.1527
15	12.3324	-4.4756	3.1218	20.1414	-0.6569	6.1776	0.2774	0.2128	0.796	-1.5761	0.3305	1.127	-1.2931	0.2218	-0.6079	0.2276	0.0057	-0.1192	0.1188	0.0914	0.5	-43.4463	9.0705	-13.8152
16	4.6187	-5.9284	5.2858	8.4234	-7.6317	8.5966	-0.2579	-0.7085	0.6132	0.5073	0.1501	-0.099	-0.1549	-0.726	0.1078	0.3744	0.0443	0.0189	0.181	-0.0748	0.1535	-35.5567	3.3947	4.152
17	2.7925	-0.4004	1.6136	6.4681	-0.7012	1.7517	0.3313	-0.2558	0.0611	0.3419	-0.2528	0.2986	0.0576	0.0921	-0.0785	0.3202	-0.0073	0.0555	0.1827	0.0274	0.0373	-36.9676	-4.3553	0.8995
18	17.3106	-1.2833	4.8704	0.734	-3.8567	20.4959	-0.6273	-0.3373	-1.8482	1.357	1.351	-0.3854	1.6298	0.9745	-0.7238	0.2019	0.0221	0.0374	0.3584	0.014	0.1912	-26.152	-7.4797	-0.1665
19	26.0405	0.7333	-5.5197	2.9723	10.8589	42.2711	0.5058	0.1113	-1.9522	-1.026	0.2098	0.0859	3.5416	1.0506	-0.7156	0.503	0.1167	-0.0866	0.6882	0.1001	0.4996	-22.6756	-9.6081	-2.953
20	32.6936	1.0862	-7.3355	4.101	-5.515	8.4816	1.1943	0.0271	0.408	0.6671	-0.6782	0.7438	0.3854	1.1935	-0.5161	0.3473	-0.0027	0.0497	0.2262	0.0497	0.1403	-31.6361	-0.7836	-5.8337
21	2.9924	-7.2253	1.6336	23.1844	-7.7692	3.441	-0.4469	1.0761	-0.7637	-0.3327	0.8645	1.1872	1.0235	-1.4896	-0.4176	0.2603	-0.2016	-0.0482	0.4355	0.0027	0.4395	-42.8139	-8.573	-5.5244
22	8.564	-1.0749	0.1257	2.5848	-0.9319	4.995	0.1754	-0.0677	0.1465	0.2831	-0.1147	0.1684	-0.0019	0.0551	-0.0607	0.249	-0.0239	0.0057	0.1257	0.0572	0.1071	-34.4039	-1.63	1.4297
23	16.2892	3.489	6.5761	19.5873	-9.8799	9.4185	-0.1319	-0.4345	-0.1387	1.5821	-0.1529	0.844	-0.2351	-2.4667	0.2849	0.3031	0.0904	-0.0176	0.5913	0.0754	0.4013	-51.1748	2.9326	-6.4503
24	19.5504	5.5949	2.8721	9.6928	4.6416	11.5404	-0.0246	1.6863	0.3756	0.1404	-0.1668	-0.5724	0.1791	0.8808	0.1914	0.1573	0.0872	0.0251	0.4901	0.0722	0.399	-51.9446	0.3939	-15.0049
25	4.873	19.5186	-6.7777	78.1816	-27.1482	9.4271	-1.236	0.7946	0.3831	-3.0528	-0.2225	-0.7079	2.0575	0.3515	1.4585	0.4667	-0.0409	0.0278	0.4505	0.0588	0.6358	-18.2426	16.6526	-20.9928
26	9.1808	6.656	-11.7962	7.6881	-8.6865	15.1628	-0.0326	-0.4705	0.3176	0.461	-0.4875	-1.0302	-0.4899	0.6232	0.5201	0.1919	0.0089	0.0171	0.2288	0.0097	0.5141	-18.0443	11.9555	-12.28
27	39.7919	30.1103	0.1525	35.5096	-3.5539	9.8158	0.4252	-1.3003	2.0159	1.3638	-0.3145	-0.2593	1.2379	0.1593	-0.1107	0.4987	0.1217	-0.146	0.4122	0.0991	0.6336	-10.2754	10.6392	-6.2267
28	25.0468	9.6814	-16.0816	3.7421	-6.216	10.3254	-0.2718	-0.5381	1.5114	0.5269	-0.6878	-1.425	1.1592	0.0439	0.9596	0.562	0.1574	0.0072	-0.1569	0.1464	1.0477	-8.7701	12.1722	-14.4428
29	2.0805	-1.1618	-0.3641	2.3067	-1.9799	2.9385	-0.0923	1.0863	-0.1413	-0.5498	0.4585	-0.7226	0.2344	0.157	-0.3662	0.2388	-0.0354	0.0947	0.1157	-0.0089	0.2237	-21.4461	0.0871	-22.5243
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31	5.0258	2.3461	0.0375	1.1207	0.6089	13.7313	-0.5597	0.461	-0.027	-0.4892	0.811	0.2841	0.1146	-0.1599	-0.2513	0.0638	-0.0085	0.0388	0.1391	-0.0006	0.1584	-24.7244	-0.4063	-14.5621
32	1.7349	-2.0919	-2.9488	8.2617	-3.847	14.56	-0.6336	-0.1223	-0.519	-0.0536	0.3824	0.7181	0.5172	-0.3724	0.2512	0.1643	0.0132	0.013	0.2641	0.0205	0.1808	-26.7078	-3.2576	-9.4495
33	21.8613	5.7665	-3.2154	34.3575	5.4249	9.5639	-0.1557	0.442	-1.3079	0.8721	0.5607	-1.4554	0.7058	0.789	-0.405	0.5318	0.0689	-0.086	0.5464	0.02	0.6469	-11.6566	-6.7998	-9.8216
34	1.2886	-0.3508	-1.9599	6.4854	3.0744	3.9912	0.2461	-0.0079	-0.595	-0.1745	-0.2469	-0.9328	0.0478	-0.0931	0.0009	0.2902	-0.0777	-0.0529	0.139	0.0981	0.2788	-21.5745	-2.3168	-17.4119
35	38.4462	19.497	21.9573	11.1811	14.2891	20.2295	-1.1599	0.0052	0.0614	0.3569	-0.8032	-1.9822	-3.1709	0.2704	1.963	0.5971	0.1818	-0.1179	0.1804	0.1232	1.8482	-3.0768	3.5327	-15.6495
36	27.0198	16.2377	23.5931	9.7582	14.1784	20.601	5.4279	1.4581	4.0594	2.2952	-1.1835	-4.8991	-4.3129	-4.4765	-4.2444	2.4624	0.677	0.1706	1.3753	0.5065	1.9727	0.0713	7.0851	-7.6192
37	46.8731	14.2647	-66.1707	17.3756	-10.6172	100.3667	-2.7345	-1.842	0.6116	3.1942	-0.6019	-2.9786	1.2722	-0.6807	3.3364	0.8427	-0.0661	0.0917	0.4277	0.1342	0.898	-16.3163	22.6893	-8.646
38	14.8011	6.2044	-3.9298	13.3168	-7.9982	4.8072	0.1703	0.355	-0.4164	-0.1652	0.018	0.942	0.6858	0.0545	-0.1883	0.1789	-0.0334	0.1258	0.1078	-0.1507	0.4442	-14.2298	27.7535	-20.3422
39	4.074	-2.1905	3.3986	8.6762	1.9021	29.5824	-0.15	0.9656	0.8	0.5072	-0.1095	-0.4991	0.4611	2.0683	0.2595	0.4634	-0.1751	0.0998	0.1452	-0.1097	0.5505	-7.4482	23.6895	-20.5695
40	24.5825	-21.4229	-15.3851	20.083	12.3664	10.3958	-0.3746	-0.3871	0.3261	-0.085	0.6913	-1.0867	-0.7941	1.2761	-0.3167	0.3762	0.0723	0.0414	0.2917	0.0346	0.3018	-10.6677	33.4274	-8.2784
41	9.0721	-7.7529	-15.459	6.6256	13.2111	26.3423	-0.9132	0.4771	-0.0725	-0.4676	0.26	-0.2989	-1.0922	-0.1577	0.6533	0.2008	-0.1265	0.0332	0.4244	-0.164	0.2956	-18.4882	45.9739	-7.8456
42	5.7876	-2.647	1.6049	5.9144	2.9323	3.3027	0.0049	-0.3776	0.5008	0.0129	-0.2757	-0.9347	-0.0647	0.3156	0.2709	0.333	-0.0142	0.1066	0.094	-0.0413	0.4065	-11.9429	43.007	-15.3167
43	10.8349	-1.0491	-4.9659	11.3357	11.001	12.1277	0.5334	0.1117	1.0729	1.0695	0.6724	1.9787	-2.7951	-0.897	-1.2058	0.2391	-0.1146	-0.0543	0.5115	-0.1688	0.2955	-23.7061	44.0565	-15.0943
44	8.1048	-4.6412	2.2629	4.2648	2.0731	7.694	0.2424	0.9256	1.2391	-1.1084	-0.6205	-0.2458	-0.8265	-0.3575	0.3781	0.3916	0.0516	0.0794	0.2001	0.0128	0.6824	-23.0477	41.4506	-18.9295
45	13.5671	-1.7478	-7.0407	3.212	-4.5176	13.5058	0.1218	1.4048	-0.6897	-1.4648	0.0728	-1.8797	-0.2826	1.1518	-0.1946	0.4448	-0.0167	0.126	0.4008	-0.0385	0.5193	-7.856	42.8137	-22.8286
46	1.6448	-3.6296	-0.3472	8.0469	1.0175	1.7667	-0.2651	0.0958	0.0804	0.0468	0.0373	-0.302	-0.0629	-0.3535	0.2278	0.26	-0.0537	-0.0162	0.1845	-0.0663	0.3349	-16.1663	41.1161	-12.0547
47	2.4433	-1.6462	-3.932	8.4514	6.3556	8.1987	1.1845	-0.5204	1.0781	-0.9601	-0.1813	-3.1142	-0.7677	0.2326	-1.0033	0.3915	-0.0177	0.185	0.3959	0.0626	1.0425	0.9297	30.8161	-18.5993
48	6.0994	-8.1213	-0.0026	17.0927	8.2039	10.7097	0.1275	0.9154	-1.0318	-1.5277	-1.2356	1.2569	-0.0133	-0.1483	1.1081	0.2622	-0.1602	0.0684	0.4415	-0.1147	0.9592	-1.0519	32.3962	-29.3406

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	A	221 - 227	6 - 12
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	A	228 - 242	13 - 27
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	A	243 - 256	28 - 41
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	A	257 - 270	42 - 55
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	A	271 - 276	56 - 61
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	A	277 - 283	62 - 68
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	A	284 - 297	69 - 82
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	A	298 - 306	83 - 91
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	A	307 - 314	92 - 99
10	X-RAY DIFFRACTION	10	A	A	315 - 325	100 - 110
11	X-RAY DIFFRACTION	11	A	A	326 - 332	111 - 117
12	X-RAY DIFFRACTION	12	A	A	333 - 346	118 - 131
13	X-RAY DIFFRACTION	13	B	B	219 - 225	4 - 10
14	X-RAY DIFFRACTION	14	B	B	226 - 236	11 - 21
15	X-RAY DIFFRACTION	15	B	B	237 - 247	22 - 32
16	X-RAY DIFFRACTION	16	B	B	248 - 261	33 - 46
17	X-RAY DIFFRACTION	17	B	B	262 - 277	47 - 62
18	X-RAY DIFFRACTION	18	B	B	278 - 284	63 - 69
19	X-RAY DIFFRACTION	19	B	B	285 - 291	70 - 76
20	X-RAY DIFFRACTION	20	B	B	292 - 297	77 - 82
21	X-RAY DIFFRACTION	21	B	B	298 - 307	83 - 92
22	X-RAY DIFFRACTION	22	B	B	308 - 325	93 - 110
23	X-RAY DIFFRACTION	23	B	B	326 - 331	111 - 116
24	X-RAY DIFFRACTION	24	B	B	332 - 346	117 - 131
25	X-RAY DIFFRACTION	25	C	C	219 - 224	4 - 9
26	X-RAY DIFFRACTION	26	C	C	225 - 233	10 - 18
27	X-RAY DIFFRACTION	27	C	C	234 - 242	19 - 27
28	X-RAY DIFFRACTION	28	C	C	243 - 248	28 - 33
29	X-RAY DIFFRACTION	29	C	C	249 - 261	34 - 46
30	X-RAY DIFFRACTION	30	C	C	262 - 272	47 - 57
31	X-RAY DIFFRACTION	31	C	C	273 - 283	58 - 68
32	X-RAY DIFFRACTION	32	C	C	284 - 297	69 - 82
33	X-RAY DIFFRACTION	33	C	C	298 - 307	83 - 92
34	X-RAY DIFFRACTION	34	C	C	308 - 324	93 - 109
35	X-RAY DIFFRACTION	35	C	C	325 - 331	110 - 116
36	X-RAY DIFFRACTION	36	C	C	332 - 337	117 - 122
37	X-RAY DIFFRACTION	37	D	D	219 - 225	4 - 10
38	X-RAY DIFFRACTION	38	D	D	226 - 236	11 - 21
39	X-RAY DIFFRACTION	39	D	D	237 - 247	22 - 32
40	X-RAY DIFFRACTION	40	D	D	248 - 255	33 - 40
41	X-RAY DIFFRACTION	41	D	D	256 - 263	41 - 48
42	X-RAY DIFFRACTION	42	D	D	264 - 276	49 - 61
43	X-RAY DIFFRACTION	43	D	D	277 - 284	62 - 69
44	X-RAY DIFFRACTION	44	D	D	285 - 297	70 - 82
45	X-RAY DIFFRACTION	45	D	D	298 - 307	83 - 92
46	X-RAY DIFFRACTION	46	D	D	308 - 324	93 - 109
47	X-RAY DIFFRACTION	47	D	D	325 - 333	110 - 118
48	X-RAY DIFFRACTION	48	D	D	334 - 347	119 - 132

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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新型コロナ情報

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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