手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 7 mg/ml in 20 mM BES, 1 mM EDTA, 0.5 mM DTT, pH 6.5, 50 mM NBG, 2.5 mM AVD (AVE9423), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
-
データ収集
放射光源
由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID14-1
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
相対比: 1
反射
解像度: 2.47→49.39 Å / Num. obs: 76587 / % possible obs: 99.9 %
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
REFMAC
5.2.0019
精密化
PDB_EXTRACT
3.004
データ抽出
XDS
データ削減
XSCALE
データスケーリング
精密化
解像度: 2.47→49.39 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.959 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.924 / SU B: 7.119 / SU ML: 0.161 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.351 / ESU R Free: 0.238 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.215
5343
7 %
RANDOM
Rwork
0.155
-
-
-
obs
0.159
76582
99.95 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK