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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 3cbh | ||||||
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タイトル | THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF CELLOBIOHYDROLASE FROM TRICHODERMA REESEI | ||||||
要素 | CELLOBIOHYDROLASE II CORE PROTEIN | ||||||
キーワード | HYDROLASE (O-GLYCOSYL) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 cellulose 1,4-beta-cellobiosidase (non-reducing end) / cellulose 1,4-beta-cellobiosidase activity / cellulose binding / cellulose catabolic process / extracellular region / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Hypocrea jecorina (菌類) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2 Å | ||||||
データ登録者 | Jones, T.A. / Rouvinen, J. | ||||||
引用 | ジャーナル: Science / 年: 1990 タイトル: Three-dimensional structure of cellobiohydrolase II from Trichoderma reesei. 著者: Rouvinen, J. / Bergfors, T. / Teeri, T. / Knowles, J.K. / Jones, T.A. #1: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1989 タイトル: Crystallization of the Core Protein of Cellobiohydrolase II from Trichoderma Reesei 著者: Bergfors, T. / Rouvinen, J. / Lehtovaara, P. / Caldentey, X. / Tomme, P. / Claeyssens, M. / Pettersson, G. / Teeri, T. / Knowles, J. / Jones, T.A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 3cbh.cif.gz | 23.3 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb3cbh.ent.gz | 11.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 3cbh.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 3cbh_validation.pdf.gz | 307 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 3cbh_full_validation.pdf.gz | 306.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 3cbh_validation.xml.gz | 857 B | 表示 | |
CIF形式データ | 3cbh_validation.cif.gz | 4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cb/3cbh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cb/3cbh | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUES 358, 423, AND 444 ARE CIS PROLINES. |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 39055.297 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Hypocrea jecorina (菌類) 参照: UniProt: P07987, cellulose 1,4-beta-cellobiosidase (non-reducing end) |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.31 Å3/Da / 溶媒含有率: 71.44 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 0.55 Å / 最低解像度: 2.8 Å / Num. obs: 32934 / % possible obs: 97 % / Num. measured all: 99337 / Rmerge(I) obs: 0.0764 |
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-解析
ソフトウェア | 名称: X-PLOR / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2→8 Å / Rfactor Rwork: 0.155 | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→8 Å
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 8 Å / Rfactor all: 0.155 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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